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BACTÉRIES

Écologie bactérienne

L'étude des relations des bactéries avec leur environnement est un domaine complexe, longtemps limité à l'analyse du produit final du métabolisme bactérien, tel que la fixation d'azote ou la production de méthane, par un mélange de bactéries dans un milieu non défini chimiquement. Les méthodes de séparation des bactéries et d'étude de leur métabolisme en présence de substrats purs, dans des conditions de culture standardisées, permet d'attribuer à chaque espèce le rôle qu'elle joue véritablement dans son écosystème naturel. Cet écosystème peut être le sol, la rhizosphère, l'eau. Il peut s'agir aussi des cavités naturelles des organismes supérieurs, notamment leur oropharynx et leur tube digestif, ainsi que leur revêtement cutané, où l'on trouve ce qu'il est convenu de nommer des flores bactériennes. Chacun de ces biotopes possède sa propre flore bactérienne qui diffère qualitativement et quantitativement, ainsi que du point de vue des interactions entre les différentes bactéries. Divers types d'interaction correspondent à différentes situations : la symbiose (croissance de deux espèces bactériennes dans un même biotope, à leur profit mutuel) ; le commensalisme, situation dans laquelle le produit du métabolisme d'une espèce (l'hôte) avantage l'autre espèce (espèce commensale), sans dommage pour l'hôte ; neutralisme (aucune interaction ne se manifeste entre les deux espèces cohabitant dans le même biotope) ; antagonisme (une des espèces excrète une substance à activité antibiotique active sur l'autre espèce) ; synergie (une des espèces synthétise un produit favorable au métabolisme de l'autre espèce).

Écologie des germes pathogènes

L'une des interactions les plus couramment observées est le commensalisme ; un exemple est fourni par certaines bactéries anaérobies strictes qui peuvent croître en présence d'oxygène (habituellement toxique pour ces bactéries) si elles sont cultivées avec des bactéries aéro-anaérobies facultatives capables de désoxygéner le milieu. De même, un état commensal est représenté par des bactéries pouvant synthétiser des produits assimilables, non seulement pour leur propre métabolisme, mais également pour des espèces bactériennes, cultivées dans le même milieu, pour qui ces produits sont indispensables ; l'exemple classique illustrant ce type de commensalisme est celui de Haemophilus influenzae, bactérie exigeante en NAD (facteur V), qui est capable de croître sur un milieu de culture ne contenant pas ce facteur si on la cultive en présence de Staphylocoques produisant le NAD. L'antagonisme entre différentes espèces bactériennes est également un phénomène primordial dans l'établissement des écosystèmes bactériens ; c'est un des mécanismes majeurs de la protection non spécifique des organismes supérieurs, possédant déjà une flore microbienne équilibrée, contre l'implantation de nouvelles espèces pathogènes ou potentiellement pathogènes.

Rôle des bactéries dans le cycle de la matière

Tous les éléments constitutifs de la matière vivante subissent une transformation cyclique, passant sans cesse de l'état minéral à l'état organique et vice versa. Grâce à l'énergie solaire, les plantes vertes, par assimilation chlorophyllienne, procèdent à « l'organisation » de la matière, autrement dit à la transformation de substances minérales simples en dérivés organiques. Dans les matières organiques, l'énergie du rayonnement solaire est, en quelque sorte, « mise en réserve » sous forme de liaisons chimiques ; lorsqu'un animal mange des plantes, et lorsqu'il est mangé par un autre, il n'y a en définitive que transferts d'énergie par l'intermédiaire de la matière organique consommée. À cette première partie du cycle fait suite une seconde partie qui comporte[...]

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Écrit par

  • : docteur en médecine, docteur ès sciences
  • : docteur en médecine, chef de service du laboratoire de microbiologie à l'hôpital de Nanterre
  • : professeur émérite à l'université Paris-Saclay, professeur honoraire à l'Institut Pasteur

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Classification

Pour citer cet article

Jean-Michel ALONSO, Jacques BEJOT et Patrick FORTERRE. BACTÉRIES [en ligne]. In Encyclopædia Universalis. Disponible sur : (consulté le )

Médias

Microscopie optique : bactéries - crédits : Encyclopædia Universalis France

Microscopie optique : bactéries

Encyclopædia Universalis France

Croissance d'une culture bactérienne - crédits : Encyclopædia Universalis France

Croissance d'une culture bactérienne

Encyclopædia Universalis France

Dissémination des gènes aux bactéries du milieu - crédits : Encyclopædia Universalis France

Dissémination des gènes aux bactéries du milieu

Encyclopædia Universalis France

Autres références

  • ABCÈS

    • Écrit par Jacques BEJOT
    • 516 mots

    Collection purulente bien limitée qui se forme au sein d'un organe ou d'un tissu, au cours d'une réaction inflammatoire. Un certain nombre d'agents pathogènes, introduits accidentellement en un point de l'organisme, sont capables d'entraîner cette réaction dont le but est de les éliminer. L'exemple...

  • ACTINOMYCÈTES

    • Écrit par Hubert A. LECHEVALIER
    • 3 450 mots
    • 4 médias
    Bacille de Koch - crédits : NIH/ NAID/ IMAGE.FR/ BSIP/ Universal Images Group/ Getty Images

    Les Actinomycètes sont des Bactéries dont la croissance donne lieu à des colonies constituées d' hyphes, c'est-à-dire de filaments qui irradient, par croissance centrifuge, tout autour du germe qui leur a donné naissance. Cela explique leur dénomination : le mot « Actinomycètes » provient de deux...

  • AÉROBIOSE & ANAÉROBIOSE

    • Écrit par Claude LIORET
    • 2 734 mots
    • 1 média
    ATP : synthèse - crédits : Encyclopædia Universalis France
    Des bactéries telles que les Acetobacter, les Pseudomonas, les Agrobacterium, certains Thiobacillus (T. denitrificans) se rangent dans cette catégorie. Les animaux sont en principe aérobies stricts, mais certains de leurs tissus, comme le tissu musculaire, peuvent supporter temporairement l'absence d'oxygène....

  • ALGUES

    • Écrit par Bruno DE REVIERS
    • 4 869 mots
    • 9 médias
    Les cyanobactéries (autrefois appelées algues bleues) sont classées parmi les bactéries. Ce sont des organismes qui sont apparus il y a au moins 2,7 milliards d'années, peut-être même, selon certains auteurs, il y 3,5 milliards d'années. Leurs constructions calcaires, appelées stromatolites (ou stromatolithes),...
  • Afficher les 143 références

Voir aussi

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