PHYLOGÉNIE ou PHYLOGENÈSE
Article principal
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PHYLOGÉNIE ANIMALE
- Écrit par Michaël MANUEL
- 10 290 mots
Articles associés
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ACTINOPTÉRYGIENS
- Écrit par Philippe JANVIER
- 2 425 mots
- 9 médias
L'analyse de la répartition des caractères morphologiques et physiologiques des actinoptérygiens, ainsi que la comparaison des séquences moléculaires de plusieurs gènes de l'ADN et de l'ARN, ont permis d'obtenir une phylogénie relativement consensuelle pour l'ensemble du groupe. Mis à part quelques résultats... -
AGASSIZ LOUIS (1807-1873)
- Écrit par Stéphane SCHMITT
- 1 229 mots
- 1 média
...la loi de récapitulation formulée quelques décennies plus tard par Ernst Haeckel et selon laquelle l’ontogenèse (le développement) récapitule la phylogenèse (l’évolution). Il existe toutefois une différence majeure avec Agassiz : pour ce dernier, il n’est absolument pas question d’une évolution... -
AMPHIBIENS ou BATRACIENS
- Écrit par Pierre CLAIRAMBAULT, Philippe JANVIER, Jean-Claude RAGE
- 5 436 mots
- 19 médias
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ANGIOSPERMES
- Écrit par Sophie NADOT, Hervé SAUQUET
- 5 397 mots
- 8 médias
...Celui qui est adopté aujourd’hui par la plupart des botanistes est le système APG (Angiosperm Phylogeny Group). Ce dernier est fondé avant tout sur les relations de parenté (phylogénie) des Angiospermes, ce qui garantit à cette classification une réelle stabilité et une grande pérennité (contrairement... -
ANIMAL
- Écrit par Valérie CHANSIGAUD
- 2 368 mots
...résulte plus seulement d'un acte classificatoire observant des critères plus ou moins arbitraires, mais découle directement de la compréhension de la généalogie des différentes espèces et de leur relation entre elles. Les protistes, du moins ceux qui ne partagent pas de caractéristique commune avec les... -
ARCHÉES ASGARD
- Écrit par Patrick FORTERRE
- 3 331 mots
- 3 médias
L’idée selon laquelle les archées Asgard sont les ancêtres des Eucaryotes reste controversée. La phylogénie publiée en 2015 par Ettema et ses collaborateurs pour déterminer la position des archées Asgard dans l’ensemble du monde vivant était fondée sur l’assemblage bout à bout (on parle de concaténation)... -
ARCHAEOPTERYX
- Écrit par Eric BUFFETAUT
- 1 865 mots
- 4 médias
...connaît désormais nombre de dinosaures non aviens qui étaient couverts de plumes. Ces dernières ne suffisent donc plus à définir les oiseaux. Certaines analyses phylogénétiques écartent Archaeopteryx des vrais oiseaux, pour en faire un dinosaure à plumes parmi d’autres. Cependant, ces interprétations... -
BACTÉRIES
- Écrit par Jean-Michel ALONSO, Jacques BEJOT, Patrick FORTERRE
- 9 726 mots
- 3 médias
...essentiellement distinguées par la coloration de Gram entre Gram + et Gram —, les Cyanobactéries (anciennement algues bleues) étant souvent classées à part. Cette classification rudimentaire a été bouleversée par l'application des méthodes de la phylogénie moléculaire : essentiellement la comparaison de leurs... -
BOTANIQUE (HISTOIRE DE LA)
- Écrit par Lucien PLANTEFOL, Hervé SAUQUET
- 4 262 mots
- 1 média
...idées semblables mais ne s'accordaient pas dans le détail des systèmes proposés. Parallèlement au développement des idées sur l'évolution des plantes, la reconstruction phylogénétique, c'est-à-dire des relations de parenté entre organismes, a connu plusieurs révolutions conceptuelles et méthodologiques... -
BOTANIQUE
- Écrit par Sophie NADOT, Hervé SAUQUET
- 4 969 mots
- 7 médias
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CARNIVORES MAMMIFÈRES
- Écrit par Robert MANARANCHE, Géraldine VÉRON
- 6 566 mots
- 33 médias
Àla fin du Crétacé, il y a quelque 65 millions d'années, les dinosaures ainsi qu'une grande partie de la faune disparaissaient, laissant place aux mammifères alors de petite taille, souvent insectivores ou omnivores. L'absence de carnassiers spécialisés crée une situation écologique qui permet... -
CHONDRICHTHYENS
- Écrit par Philippe JANVIER
- 2 101 mots
- 7 médias
...n'avaient pas de réalité en tant que groupe zoologique. Une révision récente des données anatomiques qui étayaient cette hypothèse ainsi que des données de la phylogénie moléculaire basées sur plusieurs gènes confirment clairement le monophylétisme des requins actuels (ou pleurotrémates) et montrent... -
CLADISTIQUE
- Écrit par Pascal TASSY
- 2 646 mots
- 4 médias
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CLASSIFICATION DU VIVANT
- Écrit par Pascal DURIS, Pascal TASSY
- 6 337 mots
- 6 médias
Dès la publication des premiers textes fondateurs de la théorie de l'évolution, la dualité classification et phylogénie est apparente. Lamarck en 1809 distingue, d'une part, la classification et, d'autre part, la « distribution », c'est-à-dire l'ordre que la nature a suivi pour produire les organismes,... -
CORONAVIRUS
- Écrit par Gabriel GACHELIN
- 2 366 mots
- 1 média
...gènes est fortement conservée, ainsi que les particularités de la traduction de leur ARN en protéines. L’alignement des séquences permet d’établir les relations phylogénétiques entre les souches, et ainsi de remonter à des origines animales très probables, comme des virus de chauves-souris, et de retracer... -
CRUSTACÉS
- Écrit par Jacques FOREST
- 6 757 mots
- 7 médias
Les fossiles, si nombreux soient-ils, ne sont que d'une aide limitée dans la recherche des rapports phylétiques chez les crustacés. En effet, beaucoup de ceux-ci, à cause de leur petite taille et de la finesse de leurs téguments, ne se fossilisent pas : c'est le cas des copépodes, par exemple, que l'on... -
CYCLOSTOMES
- Écrit par Pierre CLAIRAMBAULT, Philippe JANVIER
- 2 403 mots
- 3 médias
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DÉVELOPPEMENT DES ÉMOTIONS
- Écrit par Sandrine GIL
- 1 793 mots
...n’existe pas de consensus sur leur nombre – reposerait sur l’existence d’un bagage inné. Cette inscription génétique serait l’héritage adaptatif de la phylogenèse, car ces émotions et leur expression refléteraient des actions utiles pour l’organisme dans une situation donnée. Dans ce cadre, le postulat... -
DÉVELOPPEMENT (biologie) - Le développement humain
- Écrit par Jacques-Michel ROBERT
- 9 796 mots
- 10 médias
..., ces transformations par lesquelles passe l'individu dans son développement depuis l'œuf jusqu'à l'état achevé) est une courte récapitulation de la phylogenèse (c'est-à-dire de l'évolution). « L'ontogenèse, écrit H. Laborit, reproduit en quelques heures, jours ou semaines selon les espèces, la longue... -
DÉVELOPPEMENT (biologie) - Le développement végétal
- Écrit par Georges DUCREUX, Hervé LE GUYADER, Jean-Claude ROLAND
- 16 914 mots
- 14 médias
Les problèmes ontogénétiques ne sont peut-être pas encore clairement compris sur le plan phylogénétique. Toutes les structures morphologiques végétatives et reproductrices, y compris l'ovule, avaient été réalisées chez les Ptéridophytes dès le Dévonien. Comme l'a dit Louis Emberger, depuis lors, chez... -
DINOSAURES
- Écrit par Eric BUFFETAUT
- 6 460 mots
- 16 médias
Les dinosaures apparaissent vers le début du Trias supérieur, il y a environ 225 Ma (fig. 3). Leur origine est à rechercher parmi de petits archosaures légèrement bâtis, qui montrent les prémices des adaptations locomotrices des dinosaures, tels que Marasuchus découvert dans le Trias moyen d'Argentine.... -
DISCOKERYX XIEZHI
- Écrit par Bastien MENNECART
- 994 mots
- 2 médias
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ÉVOLUTION
- Écrit par Armand de RICQLÈS, Stéphane SCHMITT
- 13 309 mots
- 10 médias
...du lien généalogique réel entre les espèces, c'est-à-dire du résultat de l'évolution. C'est ce qu 'Ernst Haeckel (1834-1919) nommera plus tard la phylogénie du vivant et exprimera par la célèbre métaphore de l'arbre (1866) si souvent exploitée depuis lors (fig. 1). Ainsi, Darwin est à l'origine de... -
EMBRYOPHYTES ou CORMOPHYTES ou ARCHÉGONIATES
- Écrit par Jean-Yves DUBUISSON, Sabine HENNEQUIN
- 2 862 mots
- 7 médias
Les analyses phylogénétiques suggèrent fortement l’enracinement des Embryophytes dans les algues vertes avec lesquelles elles forment le clade – groupe monophylétique – des Chlorobiontes (« végétaux verts »). Les Chlorobiontes sont caractérisés par la présence d’amidon (produit par la photosynthèse)... -
ENTELOGNATHUS PRIMORDIALIS
- Écrit par Gaël CLÉMENT
- 1 002 mots
- 1 média
Entelognathus primordialis (signifiant animal primordial à mâchoires complètes) est un petit poisson fossile vieux d’environ 420 millions d’années qui a été mis au jour dans la province du Yunnan, dans le sud de la Chine. L’étude de ce fossile viendrait bouleverser les hypothèses...
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FLEUR
- Écrit par Louis EMBERGER, Michel FAVRE-DUCHARTRE, Georges MANGENOT, Paul ROLLIN
- 6 721 mots
- 8 médias
...comparée et de nombreux cas tératologiques ont montré que la fleur se retrouve chez tous les végétaux vasculaires. Elle s'ébauche déjà chez les Cryptogames vasculaires paléozoïques, et la fleur des Angiospermes n'est que l'étape actuelle de laphylogenèse que cet organe a parcourue au cours des temps. -
FOSSILES
- Écrit par Raymond FURON, Armand de RICQLÈS
- 5 111 mots
- 1 média
...relier entre eux des groupes systématiques largement distincts les uns des autres dans la nature actuelle, d'où leur grand intérêt pour l'étude de la phylogenèse. Latimeria, seul Crossoptérygien actuel, est un bon exemple de relique : il représente le groupe faisant le passage des Poissons osseux... -
GENERELLE MORPHOLOGIE DER ORGANISMEN (E. Haeckel)
- Écrit par Stéphane SCHMITT
- 991 mots
- 1 média
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GNATHOSTOMES
- Écrit par Philippe JANVIER
- 1 887 mots
- 2 médias
...physiologiques, ou des séquences moléculaires de gènes nucléaires et mitochondriaux, font l'objet d'un relatif consensus. La figure 2 montre, à gauche, l'arbre phylogénétique des gnathostomes le plus largement admis, prenant en considération les données morpho-anatomiques. Certaines ramifications de l'arbre... -
GYMNOSPERMES
- Écrit par Sophie NADOT, Hervé SAUQUET
- 3 521 mots
- 7 médias
Contrairement aux Angiospermes, il n’existe actuellement pas de consensus ni sur les relations de parenté (phylogénie) des Gymnospermes, ni sur leur classification. La question des relations entre les grands groupes de Gymnospermes alimente en effet l’un des débats les plus animés en phylogénie des plantes.... -
HENNIG WILLI (1913-1976)
- Écrit par Pascal TASSY
- 956 mots
- 2 médias
...revient à Berlin en 1947 où il travaille jusqu’en 1963. À cette date, il s’installe au Muséum de Stuttgart, devenant directeur du département de recherches phylogénétiques dans la ville voisine de Ludwigsburg où se situent de nombreux laboratoires du Muséum de Stuttgart. Ce sont ses démêlés avec le système... -
HISTOIRE DE LA CLADISTIQUE - (repères chronologiques)
- Écrit par Philippe JANVIER, Michel LAURIN
- 1 463 mots
1950 L'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il propose une nouvelle méthode de reconstruction des relations de parenté entre les espèces fondée exclusivement sur les états apomorphes...
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HOMINIDÉS
- Écrit par Brigitte SENUT
- 8 331 mots
- 7 médias
...molécularistes ont estimé que les changements biologiques au cours du temps se faisaient à vitesse constante (la fameuse notion d'« horloge moléculaire ») : la date de divergence entre les grands singes africains et l'Homme avait donc été estimée à 2 millions d'années (Ma) environ pour certains et jusqu'à 4 Ma... -
HOMO LUZONENSIS ou HOMME DE CALLAO ou HOMME DE LUÇON
- Écrit par Dominique GRIMAUD-HERVÉ
- 1 368 mots
- 2 médias
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INSECTES
- Écrit par René LAFONT, Jean-Yves TOULLEC
- 11 339 mots
- 35 médias
L'aile est donc une particularité d'une importance capitale dans l'étude de la phylogénie des insectes (fig. 2) : elle est représentative, de par sa morphologie, du degré d'évolution de l'espèce (mobilité de l'aile et réduction de la nervation). Les espèces primitives sont assez proches des espèces... -
INSTINCT
- Écrit par Georges THINÈS
- 8 293 mots
- 1 média
...en réalité établi la spontanéité fondamentale de l'action instinctive et, en même temps, son caractère génétiquement déterminé et son insertion dans la phylogenèse. Mais leur ambition n'allait pas au-delà de l'utilisation taxinomique des comportements. Quant à Craig, il avait démontré le caractère téléologique... -
LORENZ KONRAD (1903-1989)
- Écrit par Raymond CAMPAN
- 2 284 mots
...université. Il écrit un article sur Kant en 1941 (« Kants Lehre vom Apriorischen im Lichte gegenwärtiger Biologie »), la même année que sa fameuse étude sur la phylogenèse des Anatidés (« Vergleichende Bewegungstudien an Anatiden »). Il montre dans cette dernière, comme l'avait fait Heinroth avant lui,... -
LYCOPHYTES
- Écrit par Jean-Yves DUBUISSON, Sabine HENNEQUIN
- 3 008 mots
- 7 médias
...parmi les Ptéridophytes, avec les Monilophytes (groupe des fougères), les deux groupes étant des Embryophytes vasculaires à spores libres. Dans les phylogénies actuelles des Embryophytes, les Lycophytes sont placées en groupe frère des Monilophytes et des Spermatophytes (plantes à graines). Les... -
MAMMIFÈRES PLACENTAIRES (ORIGINE DES)
- Écrit par Jean-Louis HARTENBERGER
- 1 175 mots
- 2 médias
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MAMMIFÈRES
- Écrit par Pierre CLAIRAMBAULT, Robert MANARANCHE, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ, Michel TRANIER
- 9 500 mots
- 20 médias
Connu par quelques dents depuis la fin du Trias, le grand ensemble des Pantothériens commence à prendre de l'importance au milieu du Jurassique avec des formes comme Amphitherium. Chez cet animal, l'articulation mandibulaire est purement mammalienne. Les dents sont diversifiées en incisives, canines,... -
MISLIYA HOMME DE
- Écrit par Bruno MAUREILLE
- 1 440 mots
- 2 médias
...représente que la lignée des hommes modernes. Il s’agit actuellement de la théorie qui fait le plus consensus au sein de la communauté scientifique quant à l’histoire phylogénique des taxons humains du Pléistocène moyen et du Pléistocène supérieur de l’Ancien Monde. Mais, pour d’autres, cette lignée... -
MOUSSES
- Écrit par Catherine LENNE
- 1 248 mots
- 2 médias
...des ressemblances qui ont justifié par le passé leur rapprochement en un seul groupe (taxon) de mousses, appelé bryophytes au sens large. Cependant, la phylogénie actuelle fait de ce taxon un groupe paraphylétique car, si ces trois lignées partagent bien un ancêtre commun, ce dernier est aussi celui de... -
MUTATIONNISME
- Écrit par Cédric GRIMOULT
- 1 954 mots
...paléontologie par Wilhelm Waagen pour caractériser la variation lente et graduelle des espèces fossiles suivie à travers les terrains géologiques. À cette époque, de nombreux paléontologues insistent d'ailleurs sur l'aspect heurté du rythme de l'évolution des lignées, inaugurant ainsi une conception... -
NERVEUX (SYSTÈME) - Neurogenèse et évolution
- Écrit par Paul LAGET
- 9 123 mots
- 7 médias
L' évolution phylogénétique du système nerveux des métazoaires, évolution si remarquable par la croissante complexité d'organisation et de fonctionnement qui la caractérise, offre au naturaliste un champ d'étude à l'intérêt fascinant. Cependant, malgré l'emploi de techniques d'examen et d'expérimentation...
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OISEAUX
- Écrit par Michel CUISIN
- 7 652 mots
- 38 médias
On connaît plus de 9 800 espèces d'oiseaux vivants. Les spécialistes ne sont pas d'accord sur la classification des oiseaux les plus évolués, les passereaux. En effet, en raison du très petit nombre de fossiles et des grandes ressemblances entre espèces, on n'est pas encore parvenu...
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ORIGINE ET ÉVOLUTION DES OISEAUX
- Écrit par Eric BUFFETAUT
- 4 203 mots
- 8 médias
L’origine des Néornithes, les oiseaux modernes, groupe qui renferme toutes les espèces actuelles, se place au Crétacé. Des études de phylogénie moléculaire le suggèrent depuis les années 1990, mais les preuves paléontologiques sont longtemps restées indécises. Divers fossiles témoignent désormais... -
OSTRACODERMES
- Écrit par Philippe JANVIER
- 1 385 mots
- 1 média
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OURS BRUN EN EUROPE
- Écrit par Farid BENHAMMOU, Jean-Pierre RAFFIN
- 4 034 mots
- 4 médias
Après avoir étudié un échantillonnage ADN d'ours bruns européens, Pierre Taberlet et Jean Bouvet ont élaboré en 1994 un arbre phylogénétique. Deux lignées principales, l'une occidentale et l'autre orientale, auraient divergé il y a environ 85 000 ans, lors des premières glaciations du Quaternaire. La... -
PÉRISSODACTYLES
- Écrit par Robert MANARANCHE
- 2 805 mots
- 6 médias
L'ancêtre des Equidae actuels était représenté à l'Éocène par le genre Hyracotherium, qui comporte plusieurs espèces, dont la taille moyenne était celle d'un lévrier. Ces animaux possédaient des caractères archaïques rappelant les Condylarthres, dont ils sont issus, à côté de traits évolutifs... -
PALÉOGÉOGRAPHIE
- Écrit par Jean-Claude RAGE
- 4 400 mots
- 7 médias
...précieuses informations. Après des observations plus ou moins empiriques, l’arrivée du cladisme (ou cladistique) – méthode qui permet de reconstituer la phylogénie, c’est-à-dire les relations de parenté entre les êtres vivants – a mené à des analyses plus strictes. L’histoire phylogénétique des groupes... -
PALÉOHISTOLOGIE
- Écrit par Delphine ANGST
- 3 034 mots
- 7 médias
En zoologie, tout comme en botanique, une grande partie des travaux visent à comprendre la phylogénie, c’est-à-dire les liens de parenté existant entre les différents groupes d’organismes. Pour cela, des caractères anatomiques des différents organismes sont comparés afin de regrouper les organismes qui... -
PALÉONTOLOGIE
- Écrit par Édouard BOUREAU, Patrick DE WEVER, Jean PIVETEAU
- 9 708 mots
- 5 médias
Cuvier et ses prédécesseurs proposaient dans leurs systèmes de la nature de présenter le tableau des relations logiques qui unissent les espèces entre elles. Mais, peu à peu, des doctrines nouvelles se font jour, qui tendent à voir non plus dans l'ordre immuable du monde, mais dans l'histoire et la genèse... -
PHYLOGÉNOMIQUE
- Écrit par Gabriel GACHELIN
- 2 655 mots
La phylogénomique, définie à la fin des années 1990, vise à établir les filiations entre les différents groupes d'êtres vivants en s'appuyant sur les caractéristiques de leur patrimoine héréditaire respectif. Elle constitue ainsi la version la plus récente d'une démarche scientifique initiée dès la...
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PLANTES
- Écrit par Marie POTAGE, Arnaud VAN HOLT
- 5 973 mots
- 11 médias
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POISSONS
- Écrit par Yves FRANÇOIS, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ
- 8 863 mots
- 18 médias
Jusqu'à la fin du xix e siècle, l'accord était général pour considérer les Poissons comme une vaste classe de Vertébrés au même titre et sur le même plan que les Amphibiens, les Reptiles, les Oiseaux et les Mammifères. Mais, depuis que les progrès de la paléontologie ont montré...
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PRIMATES FOSSILES
- Écrit par Denis GERAADS
- 5 563 mots
- 1 média
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PROBOSCIDIENS
- Écrit par Robert MANARANCHE, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ, Pascal TASSY
- 2 601 mots
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REPTILES FOSSILES
- Écrit par Armand de RICQLÈS, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ
- 10 205 mots
- 14 médias
Où commencent lesReptiles ? Leur origine est-elle unique ou multiple ? Les caractères qui permettent de définir les Reptiles actuels sont-ils applicables aux formes fossiles ? Où finissent les Reptiles par rapport aux Mammifères ? Ces questions, qui sont celles de l'origine, de l'homogénéité, des limites... -
RIBOSOMES
- Écrit par Carlo COCITO
- 4 157 mots
- 7 médias
...séparent des boucles monocaténaires. Il en découle que chaque ARNr possède, au sein de la particule ribosomale, une structure tridimensionnelle propre. La comparaison des structures des ARN 5 S issus de différentes bactéries a permis de préciser la position taxonomique d'organismes nouvellement isolés... -
SARCOPTÉRYGIENS
- Écrit par Philippe JANVIER
- 3 322 mots
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SPERMATOPHYTES
- Écrit par Sophie NADOT, Hervé SAUQUET
- 843 mots
- 1 média
Les Spermatophytes actuels sont formés de deux groupes monophylétiques : les Acrogymnospermes (Gymnospermes actuelles) et les Angiospermes. Le premier ne comprend que très peu d’espèces (environ 1 000, classées en douze familles), tandis que le second est remarquablement diversifié (250 000 à 300 000... -
STÉGOCÉPHALES
- Écrit par Jean-Sébastien STEYER
- 1 466 mots
- 1 média
...environ) au milieu du Crétacé (— 100 Ma environ), et réparties partout, d'Arctique en Antarctique et d'Amérique du Nord en Australie. L'histoire évolutive du groupe, longue de quelque 270 millions d'années (presque deux fois celle des dinosaures – non aviens –) commence notamment... -
SYSTÉMATIQUE PHYLOGÉNÉTIQUE
- Écrit par Philippe JANVIER
- 305 mots
En 1950, l'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie son Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il expose sa méthode d'utilisation des caractères morphologiques afin d'élucider les relations de parenté entre les espèces ou les...
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SYSTÈME IMMUNITAIRE (ORIGINES DU)
- Écrit par Gabriel GACHELIN
- 1 767 mots
Si l'on se replace dans la phylogénie des chordés, dont les vertébrés font partie, la phylogénomique nous apprend que les urochordés comme les tuniciers et les céphalochordés (comme l'amphioxus) possèdent bien une immunité innée mais sont dépourvus de système immunitaire adaptatif. Entre... -
TÉTRAPODES
- Écrit par Philippe JANVIER, Jorge MONDÉJAR FERNÀNDEZ
- 3 257 mots
- 3 médias
Le nombre et la diversité de poissons sarcoptérygiens actuels étant très réduits, il devient difficile de reconstruire de manière détaillée l’histoire évolutive de la transition entre les poissons et les tétrapodes puisque les différences morphologiques entre les espèces vivantes sont trop marquées.... -
TETRAPODOPHIS AMPLECTUS
- Écrit par Philippe JANVIER
- 1 157 mots
- 1 média
Une autre surprise réside dans le mode de vie probable de Tetrapodophis amplectus . Les hypothèses sur la position des serpents dans la phylogénie des Squamates ont varié depuis les années 1990, selon que l’on considérait des caractères moléculaires ou morphologiques. Les premiers suggéraient un enracinement... -
VERTÈBRES ET RACHIS
- Écrit par Yves FRANÇOIS, Claude GILLOT
- 4 053 mots
- 7 médias
La plupart des Tétrapodes ont une vertèbre de type assez différent. Les variations des structures vertébrales au cours de l'évolution ont une grande importance pour la classification de ces Vertébrés.