ARCHÉES ASGARD

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Les Archées, l’un des trois domaines du monde vivant – les deux autres étant les Bactéries et les Eucaryotes –, sont des micro-organismes unicellulaires et dépourvus de noyau extrêmement diversifiés. Leur mise en culture permet de les étudier et de les caractériser, montrant qu’elles présentent des formes et des métabolismes très variés. À partir de 2010, l’essor de la métagénomique (isolement direct de gènes à partir d’un échantillon de sol, d’eau...) a permis d’identifier un grand nombre d’archées que l’on ne savait pas cultiver. Plusieurs d’entre elles ont été classées dans un grand groupe (superphylum) appelé Asgard, qui a acquis une certaine notoriété. En effet, de nombreux scientifiques pensent que ces archées Asgard seraient les ancêtres des Eucaryotes, donc nos ancêtres directs. D’autres pensent que ce n’est pas le cas, mais qu’elles auraient côtoyé nos ancêtres, pouvant ainsi témoigner de notre histoire la plus ancienne.

La métagénomique et la diversité des archées

Depuis les années 2000, notre connaissance de la diversité microbienne a été bouleversée par les approches dites de « métagénomique ». La possibilité de séquencer massivement tout l’ADN présent dans un environnement donné à moindre coût grâce à la technique du séquençage à haut débit a permis de reconstituer, par des méthodes informatiques, les génomes d’organismes que l’on n’avait encore jamais réussi à cultiver. Les génomes ainsi obtenus, appelés MAG (metagenome-assembled genomes), ne sont pas parfaits, l’assemblage par ordinateur des séquences d’ADN pouvant comporter des erreurs, mais ils permettent de se faire une assez bonne idée du métabolisme de ces organismes et de leur position dans l’arbre du vivant. Dans les années 1990, l’essor de l’écologie moléculaire avait déjà permis de mettre en évidence de nombreuses lignées évolutives jusque-là inconnues chez les Bactéries et les Archées. Cette approche était fondée sur le séquençage spécifique des gènes codant pour les molécules d’ARN ribosomique 16S (appelée [...]


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Diversité des archées Asgard

Diversité des archées Asgard
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Place des archées Asgard dans l’arbre universel du vivant

Place des archées Asgard dans l’arbre universel du vivant
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Prometheoarchaeum synthrophicum

Prometheoarchaeum synthrophicum
Crédits : H. Imachi, M.K. Nobu, JAMSTEC

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Patrick FORTERRE, « ARCHÉES ASGARD », Encyclopædia Universalis [en ligne], consulté le 12 octobre 2020. URL : https://www.universalis.fr/encyclopedie/archees-asgard/