MICROBIOLOGIE
Les micro-organismes et le corps humain
Les micro-organismes entretiennent avec l'homme trois types de relations en fonction des espèces.
Les micro-organismes commensaux vivent sur ou dans le corps humain sans faire de tort à leur hôte. Ils peuvent être présents de manière transitoire ou permanente et ne sont pas perçus par l'homme. Ils occupent de nombreux sites du corps humain mais sont tout particulièrement concentrés dans l'intestin (par exemple Escherichia coli).
On appelle probiotiques les micro-organismes dont l'apport comme additif alimentaire est considéré comme bénéfique pour la santé de l'homme (par exemple, Bifidobacterium ou Lactobacillus casei).
Enfin un micro-organisme est considéré comme pathogène lorsqu'il est capable de provoquer des désordres organiques. Les micro-organismes pathogènes peuvent être classés en fonction de leur siège anatomique, de leur nature épidémiologique ou du niveau de risque de biocontamination. L'évaluation de ce risque dépend de cinq caractéristiques propres au micro-organisme : la pathogénicité, la stabilité biologique (notion de souche), le mode de transmission, l'endémicité et la possibilité de traitement. Les agents biologiques sont ainsi officiellement classés en quatre classes correspondant à quatre niveaux de dangerosité croissante pour l'espèce humaine, la classe 4 n'étant actuellement occupée que par certains virus (par exemple, classe 1, Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus ; classe 2, Clostridium tetani ; classe 3, Mycobacterium leprae).
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Écrit par :
- Jean-Michel PANOFF : biologiste, professeur à l'université de Caen Basse-Normandie
- Corinne DOREL : maître de conférences à l'Institut national des sciences appliquées de Lyon
- Philippe LEJEUNE : professeur à l'Institut national des sciences appliquées de Lyon
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Autres références
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Dans le chapitre « Contaminations accidentelles » : […] : thérapeutique anti-infectieuse d'une part, accélération de la croissance d'autre part. Mais cette utilisation entraîne trois ordres de conséquences néfastes : augmentation de la résistance des germes pathogènes, transformation en pathogènes de variétés jusque-là saprophytes, enfin création chez le consommateur d'allergies et d'intolérances […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/alimentation-aliments-risques-alimentaires/#i_16006
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Dans le chapitre « La microflore ammonifiante »
: […]
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Selon la définition donnée par S. A. Waksman, en 1941, un antibiotique est une substance produite par un micro-organisme et qui a le pouvoir d'inhiber la croissance d'autres micro-organismes et même de les détruire […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/antibiotiques/#i_16006
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Dans le chapitre « Spécificité biochimiques des archées »
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ASTHME ET IMMUNITÉ INNÉE
Dans le chapitre « Asthme des villes et asthme des champs » : […] Autriche et Suisse) et aux États-Unis montrent que le fait d’avoir grandi dès le plus jeune âge dans une ferme traditionnelle et en contact avec les animaux et leur environnement microbien (phénomène appelé farm effect) constitue une protection contre l’asthme. Elles viennent conforter une opinion courante, mais jusqu’ici non prouvée […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/asthme-et-immunite-innee/#i_16006
BACTÉRIES
Bien que l'existence des micro-organismes ait été révélée par les premiers microscopes, voilà près de trois cents ans, il fallut pourtant attendre les travaux de Pasteur et de ses contemporains pour découvrir l'importance des bactéries dans la
BACTÉRIOLOGIE
La bactériologie a pris naissance dans le sillage de la chimie, à partir du milieu du xixe siècle. Elle devait devenir en quelques décennies une science autonome sous l'impulsion de trois savants de génie :
BARRIÈRE D'ESPÈCE, épidémiologie
Toute maladie infectieuse résulte d'une contamination microbienne de l'organisme affecté par cette maladie. Ce dogme épidémiologique n'a jamais été mis en défaut depuis les recherches dont
BIODÉPOLLUTION
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BOIVIN ANDRÉ (1895-1949)
commence, dans cette ville, avec R. Vendrely et R. Tulasne, une étude approfondie de la structure chimique et cytologique des microbes. Bien des années plus tôt, il avait pu montrer que les microbes sont riches en nucléoprotéines. Ses recherches nouvelles lui permettent d'affirmer qu'ils renferment, à la fois, de l'acide désoxyribonucléique et de […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/andre-boivin/#i_16006
BORDET JULES (1870-1961)
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Dans le chapitre « L'extension progressive du domaine brevetable » : […] C'est ainsi qu'en 1977 un juge américain, qui devait statuer sur la brevetabilité de cultures de micro-organismes biologiquement purs, énonçait qu'« ils sont devenus des outils importants dans l'industrie chimique et lorsqu'un nouvel outil industriel utile, réel mais non évident est inventé, il n'y a pas de raison de priver son inventeur des […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/brevet-d-invention/#i_16006
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1980 Premier brevet, aux États-Unis, sur un micro-organisme génétiquement modifié : une bactérie capable de dégrader les hydrocarbures […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/brevets-sur-le-vivant-reperes-chronologiques/#i_16006
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Au début des années 1970, le microbiologiste indien Ananda Chakrabarty invente, pour le compte de la General Electric Company, une bactérie génétiquement modifiée capable de dégrader les hydrocarbures. Le brevet qu'il demande lui est alors refusé, conformément à la jurisprudence (Plant Patent Act, 1930) excluant les êtres vivants – à l'exception […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/brevet-sur-un-o-g-m/#i_16006
COHEN GEORGES N. (1920- )
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COHN FERDINAND JULIUS (1828-1898)
Ferdinand Cohn, naturaliste allemand et botaniste, considéré comme un des fondateurs de la
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Dans le chapitre « Mutualisations entre êtres unicellulaires et multicellulaires »
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Des ensembles de micro-organismes étroitement associés à des hôtes animaux ou végétaux constituent des microbiotes. Ils bénéficient ainsi d’un milieu favorable et fournissent en échange à leur hôte, de nombreux avantages. À l’heure de la
DIGESTIF APPAREIL
Dans le chapitre « La microbiologie digestive »
: […]
Dans la bouche vivent en permanence de 106 à 109
DROUHET ÉDOUARD (1919-2000)
Dès son arrivée à Paris, il présente les lettres de recommandation de ses patrons à Joseph Magrou qui, connaissant et appréciant les microbiologistes roumains, l'intègre à l'Institut Pasteur. À l'issue de sa bourse, Drouhet décide de rester en France ; il obtient un poste au C.N.R.S., puis sera intégré dans les cadres de l'Institut Pasteur en 1954 […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/edouard-drouhet/#i_16006
EAU - Approvisionnement et traitement
Dans le chapitre « Les stations d'épuration classiques » : […] biologique, destiné à éliminer la pollution organique biodégradable grâce aux micro-organismes (biomasse), est constitué par un ou plusieurs réacteurs en série (cf. Principe du traitement biologique). Pour une station assurant une épuration poussée des effluents, le traitement biologique comprend un réacteur anaérobie suivi […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/eau-approvisionnement-et-traitement/#i_16006
EXTRÉMOPHILES
Les environnements considérés par l'homme comme extrêmes en termes de température, de pression, de pH et de salinité sont souvent colonisés par des micro-organismes, auxquels on a donné le nom d'extrémophiles. Ces derniers, bien adaptés à ces conditions physico-chimiques particulières, sont capables d'en retirer l'énergie nécessaire pour leur […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/extremophiles/#i_16006
FLEMING ALEXANDER (1881-1955)
Bactériologiste qui découvrit en 1928 la pénicilline et ouvrit la voie à la thérapeutique des
GAYON JEAN (1949-2018)
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française. Ils ont montré en particulier comment la physiologie bernardienne et la
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1675 Antoine Van Leeuwenhoek découvre les micro-organismes grâce à un microscope de sa fabrication […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/generation-spontanee-reperes-chronologiques/#i_16006
GÉNÉRATION SPONTANÉE : FIN D'UNE CONTROVERSE
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GÉOMICROBIOLOGIE
La géomicrobiologie est l'une des applications de la
HÉRELLE FÉLIX D' (1873-1949)
Né à Montréal, orphelin de père à six ans, il est emmené par sa mère à Paris, puis en Hollande. On manque de précisions sur ses études supérieures. Mais on sait comment Félix d'Hérelle s'est orienté, par hasard, vers la
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INSTITUT PASTEUR
des années, et surtout depuis la fin de la Seconde Guerre mondiale, un des plus importants centres de recherche en France, dans pratiquement tous les domaines de la biologie fondamentale, tout en conservant un niveau d'excellence en
KOCH BACILLE DE
Après avoir identifié le bacille du charbon (1876), le médecin allemand
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LEDERBERG JOSHUA (1925-2008)
Généticien et microbiologiste américain, un des fondateurs de la biologie moléculaire moderne. Pour sa découverte de la recombinaison
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LEVADITI CONSTANTIN (1874-1953)
À l'Institut Pasteur, élève d'Élie Metchnikoff et d'
LINDENMANN JEAN (1924-2015)
Le microbiologiste suisse Jean Lindenmann fut, en 1957, le codécouvreur (avec le bactériologiste britannique Alick Isaacs) des interférons, de petites molécules appartenant à la famille des cytokines. Les interférons participent au contrôle de la
LITHOSPHÈRE OCÉANIQUE (MICROBIOLOGIE DE LA)
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MALADIES INFECTIEUSES
Dès le xixe siècle, Henlé avait établi une liste de critères permettant d'admettre l'existence d'une relation de cause à effet entre un micro-organisme et une maladie : le micro-organisme doit être présent dans tous les cas de la maladie ; il doit pouvoir être isolé de l'hôte malade et cultivé en […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/maladies-infectieuses/#i_16006
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MICROBE
Grâce à l'invention du microscope, vers la fin du xviie siècle, on découvrit l'existence d'êtres vivants de très petite taille, invisibles à l'œil nu. Sujets de curiosité pendant plus de cent cinquante ans, leur étude ne fut réellement abordée qu'au milieu du xix […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/microbe/#i_16006
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NICOLLE CHARLES (1866-1936)
Après son internat aux hôpitaux de Paris et une thèse préparée au laboratoire du docteur Roux à l'
NOCARD EDMOND (1850-1903)
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PASTEUR LOUIS (1822-1895)
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PHYTOPATHOLOGIE
Dans le chapitre « Histoire de la phytopathologie »
: […]
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PRIX NOBEL DE PHYSIOLOGIE OU MÉDECINE 2016
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PYOCYANIQUE BACILLE
Bacille court (1,5 μm de long sur 0,5 μm de large) aux extrémités arrondies, le bacille pyocyanique (Pseudomonas aeruginosa) est mobile et à Gram négatif. Très répandu dans la nature (saprophyte des sols et des eaux), on le rencontre aussi à l'état commensal chez l'homme (téguments, intestin). Il se caractérise, en particulier, […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/bacille-pyocyanique/#i_16006
RÉOVIRUS
Le genre Réovirus est classé dans la famille des Reoviridae avec les genres Orbivirus (dont l'espèce type est le
ROUX ÉMILE (1853-1933)
Bientôt conquis par les idées de Pasteur, Roux devient son fidèle disciple. Son nom est associé à celui de son maître dans les publications qui devaient suivre la découverte des virus-vaccins, et, en premier lieu, celle de la
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La grande révolution a été l'apparition de la
SOLS - Biodynamique
Dans le chapitre « Organismes transformateurs » : […] Les bactéries sont très abondantes dans les sols (cf. sols - Microbiologie), de l'ordre de 106 à 109 par gramme de sol, et leur diversité spécifique est très grande ; seulement 10 p. 100 environ des espèces sont connues. Les bactéries du sol couvrent toute sorte d'activités, […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/sols-biodynamique/#i_16006
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Tous les types de micro-organismes existent dans les sols. Ce sont soit des eucaryotes (champignons,
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TOXINES
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VACCINATION ANTI-CHARBONNEUSE
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VIRUS
Le terme « virus » signifie poison en latin ; la notion est donc ancienne. Mais elle est restée sans contenu précis jusqu'à Pasteur. C'est avec la découverte d'agents à l'origine des infections, et l'observation au microscope des
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Le biologiste américain Norton Zinder découvrit la transduction – transfert de matériel
Voir aussi
Pour citer l’article
Jean-Michel PANOFF, Corinne DOREL, Philippe LEJEUNE, « MICROBIOLOGIE », Encyclopædia Universalis [en ligne], consulté le 14 août 2018. URL : http://www.universalis.fr/encyclopedie/microbiologie/
