NUCLÉOTIDIQUE SÉQUENCE

Articles associés

• BACTÉRIOLOGIE

  • Écrit par Jean-Michel ALONSO, Jacques BEJOT, Michel DESMAZEAUD, Didier LAVERGNE, Daniel MAZIGH
  • 16 129 mots
  • 10 médias
  Les premières méthodes de diagnostic moléculaire ont fait appel à l'hybridation d'une séquence d'ADN simple brin connue : sonde d'ADN dûment marquée (radioactive, fluorescente ou chromogène...) avec une séquence à identifier (cf. génétique moléculaire), sur des fragments d'ADN...

• BIOCHIMIE

  • Écrit par Pierre KAMOUN
  • 3 415 mots
  • 5 médias
  ...la cytosine), la première faisant toujours face à la troisième et la deuxième à la quatrième sur les deux brins complémentaires de la molécule d'ADN. La séquence des bases sur l'ADN constitue un langage qui est parfois traduit en langage protéique : trois lettres sur l'ADN codent un message correspondant...

• BIOLOGIE - La bio-informatique

  • Écrit par Bernard CAUDRON
  • 4 811 mots
  • 3 médias
  ...macromolécule linéaire issue de l'enchaînement de quatre bases nucléiques (l'adénosine – A –, la cytosine – C –, la guanine – G – et la thymine – T). L'information génétique est contenue dans de longues « phrases » constituées de ces quatre lettres : ce sont les gènes. Ces derniers codent pour des ARN...

• BIOLOGIE - La biologie moléculaire

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 6 516 mots
  • 8 médias
  ...se répliquer à l'identique lors des divisions cellulaires. Or l'ADN est une longue fibre issue de l'enchaînement de milliers ou de milliards des quatre bases nucléotidiques, l'adénine (A), la thymine (T), la cytosine (C) et la guanine (G). Cet enchaînement produit une séquence (...AATCGATG...) dont la...

• BIOTECHNOLOGIES

  • Écrit par Pierre TAMBOURIN
  • 4 724 mots
  • 4 médias
  La connaissance des séquences nucléotidiques de l'ADN constitue le niveau le plus fin de l'information génétique. Dans les années 1990, la biologie à grande échelle naît de la nécessité d'augmenter fortement la puissance des techniques de séquençage de cette molécule géante,...

• BOTANIQUE

  • Écrit par Sophie NADOT, Hervé SAUQUET
  • 4 969 mots
  • 7 médias
  ...reconstruction phylogénétique fait constamment intervenir la génétique et l'informatique. En effet, depuis les années 1990, il est possible d'amplifier et lire la séquence ADN de n'importe quel gène d'une espèce, pourvu qu'on ait une idée du début et de la fin de cette séquence et que l'on ait accès à du matériel...

• CELLULE - L'organisation

  • Écrit par Pierre FAVARD
  • 9 705 mots
  • 15 médias
  Laséquence des nucléotides d'un ARNm est traduite en séquence d'acides aminés par les ribosomes qui sont des complexes ARNr protéines. Une séquence de trois nucléotides adjacents de l'ARNm constitue un codon qui spécifie un acide aminé ; la table de correspondance entre les...

• CHIMIE - La chimie aujourd'hui

  • Écrit par Pierre LASZLO
  • 9 553 mots
  • 3 médias
  Depuis la fin du xx ^e siècle, ce champ disciplinaire a entièrement basculé –  génomique oblige – versl'analyse comparée des acides nucléiques de divers organismes. Il associe aujourd'hui génomique, outils moléculaires et logiciels informatiques. Pour établir les arbres phylogénétiques...

• CLADISTIQUE

  • Écrit par Pascal TASSY
  • 2 646 mots
  • 4 médias
  À partir des années 1980, la comparaison des gènes et l'examen des séquences des nucléotides de l'ADN ont pris le pas sur les caractères anatomiques. D'une part, parce que c'est plus simple : l'information est stéréotypée, les gènes ne diffèrent que par les quatre bases qui les composent...

• CODE GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Antoine DANCHIN
  • 1 224 mots
  • 1 média

  On a coutume de remarquer l'extraordinaire variété du vivant, et d'oublier ce qui est commun à tout ce qui vit. D'abord, l'atome de vie, la cellule. Ensuite, un mécanisme incroyablement simple de transmission de l'hérédité, la réplication, qui passe par la reproduction...

• COMPLÉMENTARITÉ, biochimie

  • Écrit par Didier LAVERGNE
  • 475 mots

  La présence de motifs structuraux à conformation complémentaire sur des molécules organiques non identiques permet leur assemblage à la manière des pièces d'un puzzle par stéréospécificité.

  La complémentarité est rigoureuse quand elle dépend de l'organisation...

• CORONAVIRUS

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 2 366 mots
  • 1 média
  La comparaison des séquences nucléotidiques de multiples coronavirus isolés de manière indépendante chez divers sujets de diverses espèces montre que l’organisation de leurs gènes est fortement conservée, ainsi que les particularités de la traduction de leur ARN en protéines. L’alignement des...

• DENISOVA HOMMES DE ou DÉNISOVIENS

  • Écrit par Bruno MAUREILLE
  • 3 364 mots
  • 4 médias
  En 2010, Swante Pääbo et son équipe séquencent et étudient le génome mitochondrial complet de la pièce Denisova 3, constituée d’un fragment de phalange distale de la main, probablement du petit doigt, d’une jeune femme. Ce fossile a été découvert dans la couche 11.2 de la chambre est de la grotte de...

• DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE

  • Écrit par Yannick SIMONIN
  • 4 570 mots
  • 4 médias
  La détermination de la séquence nucléotidique de l’ADN amplifié est utilisée en diagnostic afin de caractériser plus finement le pathogène identifié. Elle permet notamment de déterminer la présence des variants. Le plus souvent, la méthode utilisée consiste à amplifier par PCR une région donnée du génome...

• ÉPIGÉNÉTIQUE

  • Écrit par Pierre-Antoine DEFOSSEZ, Olivier KIRSH, Ikrame NACIRI
  • 5 274 mots
  • 4 médias
  ...à l’une des bases de l’ADN. Cette modification a été proposée comme une marque pouvant réguler l’expression des gènes dès 1975. Elle ne modifie pas la séquence nucléotidique et ne peut pas être décelée par les techniques de séquençage classiques. Chez les vertébrés, la méthylation de l’ADN...

• ENCODE PROJET

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 1 253 mots
  • 1 média

  Le projet Encode (Encyclopedia of DNA elements) a été lancé en 2003. Son but était de rechercher tous les éléments fonctionnels présents dans l'ADN du génome humain. La première synthèse de ce travail gigantesque, qui a impliqué plusieurs dizaines de laboratoires et quelques centaines...

• EUCARYOTES (CHROMOSOME DES)

  • Écrit par Denise ZICKLER
  • 6 795 mots
  • 9 médias
  ...) – l'ADN d'un organisme est isolé, coupé en fragments, dénaturé en chaînes simples et la vitesse de réassociation en duplex pour une séquence nucléotidique donnée dépend du nombre d'exemplaires de cette dernière – font apparaître trois classes de fréquences de réassociation, dont les proportions...

• GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Axel KAHN, Philippe L'HÉRITIER, Marguerite PICARD
  • 22 769 mots
  • 31 médias
  Il est extrêmement aisé de déterminer l'enchaînement des nucléotides constituant un brin d'ADN. Deux techniques – dont les descriptions valurent le prix Nobel à leurs auteurs – sont couramment utilisées. La méthode de Maxam et Gilbert fait appel à des réactions chimiques clivant l'ADN au...

• GÉNIE GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Louis-Marie HOUDEBINE
  • 2 938 mots
  • 6 médias
  ...vingt), dont l'ordre définit la structure de la protéine et son activité biologique. La succession des acides aminés est directement déterminée par la succession des bases nucléotidiques (A, C, G, T, pour, respectivement, adénine, cytosine, guanine et thymine) qui sont les constituants essentiels de l'ADN....

• GÉNOME NÉANDERTALIEN

  • Écrit par Eva-Maria GEIGL, Thierry GRANGE, Bruno MAUREILLE
  • 2 880 mots
  La comparaison réalisée entre le génome du Néandertalien et d'Hommes actuels permet l'identification des changements de séquences propres au génome humain qui précèdent la grande expansion de l'Homme moderne. La méthode de séquençage utilisée permet d'identifier les petits changements de séquence...

• GÉNOMIQUE - Génome artificiel

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 1 889 mots
  ...nucléique, l'ADN (acide désoxyribonucléique) dans le cas le plus général. Les gènes, alignés le long de la molécule d'ADN des chromosomes, sont des séquences issues de l'assemblage de quatre bases azotées : l'adénine (A), la cytosine (C), la guanine (G) et la thymine (T). L'ordre dans lequel ces...

• GÉNOMIQUE - La transgenèse

  • Écrit par Pascale BRIAND
  • 6 426 mots
  • 2 médias
  ...transcriptionnel, c'est-à-dire lors de l'étape de synthèse des ARN messagers, molécules intermédiaires entre le gène et la protéine dont il a codé la synthèse. Des séquences du gène, ou qui lui sont contiguës, sont impliquées dans cette régulation et constituent des cibles des facteurs de régulation. Déterminer...

• GÉNOMIQUE - Théorie et applications

  • Écrit par Louis-Marie HOUDEBINE
  • 3 557 mots
  ...gènes. Ces fragments sont introduits dans des vecteurs de clonage dont le type dépend de la longueur des fragments d'ADN qui y sont insérés. Le séquençage partiel des fragments permet de les ordonner. On dispose donc ainsi de l'ensemble d'un génome dans une série de vecteurs dont les séquences...

• GILBERT WALTER (1932- )

  • Écrit par Georges BRAM
  • 229 mots

  Biologiste moléculaire américain né à Boston le 21 mars 1932. Après des études de chimie et de physique à Harvard, Walter Gilbert soutient, en 1957, à l'université de Cambridge (Grande-Bretagne), un doctorat de physique mathématique préparé sous la direction de Abdus Salam (Prix...

• HÉRÉDITÉ

  • Écrit par Charles BABINET, Luisa DANDOLO, Jean GAYON, Simone GILGENKRANTZ
  • 9 883 mots
  • 7 médias
  ...l'expression génique. Par exemple, un gène méthylé sur l'allèle d'origine paternelle ne pourra s'exprimer qu'à partir de son allèle d'origine maternelle. Des séquences spécifiques sont la cible de cette méthylation : elles sont en général localisées à proximité des gènes et sont appelées DMR (de l'anglais...

• HISTOIRE DE LA CLADISTIQUE - (repères chronologiques)

  • Écrit par Philippe JANVIER, Michel LAURIN
  • 1 463 mots

  1950 L'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il propose une nouvelle méthode de reconstruction des relations de parenté entre les espèces fondée exclusivement sur les états apomorphes...

• HORMONES

  • Écrit par Jacques DECOURT, Universalis, Yves-Alain FONTAINE, René LAFONT, Jacques YOUNG
  • 12 632 mots
  • 11 médias
  ...à partir de l'ADN des gènes hormono-régulés. Le complexe hormone-récepteur activé se lie grâce aux doigts de zinc sur l'ADN sur des séquences particulières situées dans le promoteur (partie régulatrice) des gènes cibles (fig. 5). Ces séquences sont désignées par le terme général...

• INFORMATION GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Henri ATLAN
  • 5 494 mots
  • 1 média
  ...diffère d'une autre – donc un gène ne diffère d'un autre – que par l'ordre dans lequel sont assemblés les nucléotides (parfois plusieurs milliers) dans la séquence qui la constitue. Si une molécule protéique peut être comparée à une phrase écrite à l'aide d'un alphabet comportant vingt lettres, une molécule...

• MICROBIOME HUMAIN

  • Écrit par Universalis
  • 3 359 mots
  • 3 médias
  ...polymérase, ACP ; polymerase chain reaction, PCR) puis séquencé. On obtient ainsi des millions de séquences. On examine ensuite particulièrement les séquences nucléotidiques de la région hypervariable 4 de l’acide ribonucléique (ARN) ribosomique 16S bactérien, car ces séquences sont différentes...

• MUTATIONS

  • Écrit par Universalis, Gérard LEBLON, Philippe L'HÉRITIER
  • 2 583 mots
  Une mutation ponctuelle est une altération d'une ou d'un petit nombre de paires nucléotides dans la séquence qui constitue une molécule d'ADN. Comme la spécificité d'un tel segment réside dans l'ordre séquentiel des paires de nucléotides qui peut se traduire notamment par la formation d'une...

• MYCOBACTÉRIES

  • Écrit par Carlo COCITO, Universalis, Gabriel GACHELIN
  • 3 811 mots
  • 4 médias
  La détermination de la séquence complète du génome de Mycobacterium leprae, qui a été publiée en février 2001 (S. T. Cole et al, « Massive Gene decay in the leprosy bacillus 2001 », in Nature, n^o 409, pp. 1007-1011, 2001), devrait permettre d'y voir un peu plus clair dans les propriétés...

• NUCLÉIQUES ACIDES

  • Écrit par Jacques KRUH, Ethel MOUSTACCHI, Michel PRIVAT DE GARILHE, Alain SARASIN
  • 11 852 mots
  • 17 médias
  Cette structure qui réunit deux chaînes réciproquement complémentaires à l'égard de leurs séquences nucléotidiques est compatible avec la réplication de la molécule d'ADN (cf. infra).

• PCR (polymerase chain reaction) ou AMPLIFICATION EN CHAÎNE PAR POLYMÉRASE

  • Écrit par Véronique BARRIEL
  • 4 498 mots
  • 6 médias
  ...début des années 1950, on montre que l'ADN est une double hélice dont chaque brin s'enroule autour de l'autre selon la complémentarité de la séquence de leurs bases nucléiques : en face d'un A se trouve un T, en face d'un C se trouve un G. Il est possible de dissocier les brins par chauffage,...

• PHYLOGÉNOMIQUE

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 2 655 mots
  ...fragments d'ADN écrits dans un alphabet à quatre lettres (A pour adénine, T pour thymine, C pour cytosine et G pour guanine). Ces lettres sont alignées en séquences qui dictent la structure des molécules pour lesquelles elles codent et qui, elles, participent à la construction des caractères. Le pari...

• POLARITÉ, biologie

  • Écrit par Didier LAVERGNE
  • 952 mots

  La polarité est inhérente au vivant. Elle en traduit le besoin d'ordre ou, plus exactement, elle révèle qu'il tend vers une ordonnance intrinsèque.

  Elle commence au niveau moléculaire : Pasteur a montré que toute la matière vivante est construite...

• POLYMORPHISME, biologie

  • Écrit par Maxime LAMOTTE, Philippe L'HÉRITIER, Étienne PATIN, Lluis QUINTANA-MURCI
  • 9 963 mots
  • 8 médias
  Ces polymorphismes peuvent être de plusieurs types. Ils peuvent correspondre soit à un changement de séquence nucléotidique (par exemple, A devient G, C ou T), auquel cas on parle de SNP (single nucleotide polymorphism) ; soit à une variation en nombre de répétitions d'une séquence répétée de taille...

• PROGRAMME GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Corinne ABBADIE
  • 7 069 mots
  • 1 média
  ...cytosine, notées A, T, G et C. C'est l'ordre d'enchaînement non aléatoire de ces quatre bases qui constitue le message génétique. On appelle gène toute séquence nucléotidique de l'ADN codant soit une protéine soit un petit ARN qui participera à la biosynthèse de cette protéine. Plus précisément,...

• SÉQUENÇAGE D'ADN, en bref

  • Écrit par Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS
  • 153 mots

  Dès son entrée à l'université de Cambridge en 1940, le Britannique Frederick Sanger se passionne pour la structure des macromolécules. En 1955, il publie la première séquence protéique, celle de l'insuline, qui lui vaut le prix Nobel de chimie en 1958. Il se tourne ensuite...

• SÉQUENÇAGE DU GÉNOME HUMAIN, en bref

  • Écrit par Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS, Universalis
  • 252 mots

  Le 12 février 2001, les revues scientifiques Nature et Science publient la séquence quasi complète des trois milliards de bases du génome humain. Cette double publication conclut par un ex aequo la compétition entre un consortium international de laboratoires publics, qui a commencé...

• SANGER FREDERICK (1918-2013)

  • Écrit par Georges BRAM, Universalis
  • 678 mots
  • 2 médias

  Le Britannique Frederick Sanger est certainement un des biochimistes les plus brillants du xx ^e siècle et l’un des très rares scientifiques à avoir reçu deux fois le prix Nobel dans la même discipline, à savoir la chimie.

  Né le 13 août 1918 à Rendcombe (Gloucestershire), Frederick Sanger...

• VARIATION, biologie

  • Écrit par Jean GÉNERMONT
  • 8 255 mots
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  Les endonucléases de restriction sont des enzymes qui coupent la chaîne d'ADN en des sites occupés par une séquence précise de quelques (par exemple 6) nucléotides. Traiter par une telle enzyme le matériel génétique d'un individu fournit un ensemble de fragments de longueurs variables (les distances...

• VIROLOGIE

  • Écrit par Sophie ALAIN, Michel BARME, François DENIS, Léon HIRTH
  • 9 203 mots
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  La recherche de séquences génomiques spécifiques de telle ou telle espèce virale est possible avec les techniques d'hybridation à l'aide de sondes chaudes ou froides qui sont relativement peu sensibles et utilisées quand les charges virales sont élevées (virus de l'hépatite B, ...

• VIRUS

  • Écrit par Vincent BARGOIN
  • 7 338 mots
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  Aux extrémités des génomes viraux figurent des séquences particulières. Pour les rétrovirus, il s'agit de séquences dites LTR (long terminal repeat), qui ne font pas partie du génome viral présent dans le virion, mais qui sont ajoutées précocement lors du cycle infectieux, pour permettre...

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