MÉTAGÉNOMIQUE

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• ARCHÉES ASGARD

  • Écrit par Patrick FORTERRE
  • 3 331 mots
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  Les Archées, l’un des trois domaines du monde vivant – les deux autres étant les Bactéries et les Eucaryotes –, sont des micro-organismes unicellulaires et dépourvus de noyau extrêmement diversifiés. Leur mise en culture permet de les étudier et de les caractériser, montrant qu’elles présentent...

• ARCHÉOBACTÉRIES ou ARCHÉES

  • Écrit par Patrick FORTERRE
  • 1 881 mots
  ...en chaîne (PCR). Ces archées peuvent être très abondantes, formant par exemple jusqu'à 25 p. 100 de l'ensemble de la biomasse océanique. Des travaux de métagénomique (isolement direct de gènes dans l'environnement) et la culture de l'un de ces organisme en 2005 ont mis en évidence parmi ces archées mésophiles...

• DIAGNOSTIC VIROLOGIQUE

  • Écrit par Yannick SIMONIN
  • 4 570 mots
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  ...détection. Des innovations concernent notamment des tests multiplexés ciblant de nombreux pathogènes simultanément, l’utilisation d’approches dites de métagénomique permettant de détecter des pathogènes sans a priori sur leur nature (tout comme dans l’étude des microbiotes bactériens), mais aussi le déploiement...

• MICROBIOME HUMAIN

  • Écrit par Universalis
  • 3 359 mots
  • 3 médias
  La clé des travaux portant sur les microbiotes humains est l’émergence de la métagénomique liée au développement simultané des appareils de séquençage de l’acide désoxyribonucléique (ADN) à haut débit et des logiciels permettant de donner sens aux multiples séquences d’ADN obtenues à partir...

• MICROBIOTE DE LA BOUCHE

  • Écrit par Sylvie BABAJKO, David OJCIUS, Ihsène TAÏHI-NASSIF
  • 4 607 mots
  • 4 médias
  Ce n’est que grâce aux développements de la métagénomique (liée au séquençage massif de l’ADN bactérien retrouvé sur un site) qu’il a été démontré que ces bactéries, à elles seules, ne peuvent provoquer ou faire progresser une parodontite. Par opposition à la vision d'une maladie infectieuse conventionnelle...

• PALÉOGÉNOMIQUE

  • Écrit par Régis DEBRUYNE
  • 3 614 mots
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  ...préhistorique à partir du « chewing-gum » en brai de bouleau qu’elle a mâché il y a plus de cinq mille ans (Jensen et al., 2019). Ainsi, les études fondées sur l’analyse des ADN issus de sédiments anciens (de grotte, de lac ou de pergélisol) permettent d’identifier les organismes fossiles qui y ont laissé leurs...

• SÉQUENÇAGE HAUT DÉBIT DE L'ADN

  • Écrit par Véronique BLANQUET, Nathalie DUPRAT, Lionel FORESTIER
  • 4 982 mots
  • 8 médias
  La métagénomique et la métatranscriptomique ont pour objectif d’identifier dans un milieu complexe respectivement les génomes et les transcriptomes de plusieurs individus d'espèces différentes. Ainsi, l’analyse du microbiote intestinal rendu possible par une telle approche permet de déterminer...