ARCHÉES ASGARD

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Les difficultés des phylogénies anciennes

L’idée selon laquelle les archées Asgard sont les ancêtres des Eucaryotes reste controversée. La phylogénie publiée en 2015 par Ettema et ses collaborateurs pour déterminer la position des archées Asgard dans l’ensemble du monde vivant était fondée sur l’assemblage bout à bout (on parle de concaténation) des séquences de 36 protéines universelles. On obtient ainsi une longue séquence unique caractéristique de chaque organisme et on construit un arbre unique fondé sur la comparaison de ces séquences concaténées. Mais l’analyse des arbres individuels concernant chacune des 36 protéines universelles a montré que des contradictions se cachent derrière l’analyse globale de ces mêmes 36 protéines. En effet, on note que la position des archées Asgard varie fortement dans les arbres individuels selon la protéine étudiée. Dans de nombreux cas, elles ne sont pas groupées dans les arbres individuels : certaines sont proches des Eucaryotes tandis que d’autres se retrouvent au milieu des Archées. Leur proximité avec les Eucaryotes s’observe surtout avec les petites protéines. Si on s’intéresse aux plus grosses protéines, qui portent plus de signaux pour placer correctement les organismes car elles permettent de comparer les positions d’un plus grand nombre d’acides aminés, les archées Asgard se retrouvent le plus souvent placées au milieu des autres archées. Dans les concaténations, les très nombreuses protéines universelles de petite taille masqueraient le signal présent dans les protéines de grande taille. En utilisant comme marqueur évolutif l’ARN polymérase, l’enzyme qui permet la lecture de nos gènes ADN sous la forme d’ARN messager, Patrick Forterre et ses collaborateurs ont obtenu un arbre dans lequel tous les Asgard étaient groupés, au sein des Archées. L’ARN polymérase est une enzyme de très grande taille composée de deux sous-unités qui sont les deux plus grandes protéines universelles disponibles. Dans l’arbre obtenu en concaténant les séquences de ces deux sous-unités, les Archées ne sont [...]

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Diversité des archées Asgard

Diversité des archées Asgard
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Place des archées Asgard dans l’arbre universel du vivant

Place des archées Asgard dans l’arbre universel du vivant
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Prometheoarchaeum synthrophicum

Prometheoarchaeum synthrophicum
Crédits : H. Imachi, M.K. Nobu, JAMSTEC

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Écrit par :

  • : professeur émérite à l'université Paris-Saclay, professeur honoraire à l'Institut Pasteur

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Patrick FORTERRE, « ARCHÉES ASGARD », Encyclopædia Universalis [en ligne], consulté le 22 septembre 2021. URL : https://www.universalis.fr/encyclopedie/archees-asgard/