Place des archées Asgard dans l’arbre universel du vivant

Deux scénarios sont proposés ici pour montrer la place des archées Asgard au sein de la phylogénie du monde vivant. La figure a est fondée sur le premier arbre publié par Thijs Ettema et ses collaborateurs en 2015 et obtenu par la mise bout à bout (concaténation) de 36 protéines universelles. Selon ce scénario, les Eucaryotes se situent au sein du superphylum des archées Asgard et constituent un sous-groupe des Heimdallarchées. La figure b est fondée sur l'arbre publié par Patrick Forterre et ses collaborateurs en 2017 et qui a été élaboré sur la concaténation des deux grandes sous-unités des ARN polymérases. Dans ce cas, les Eucaryotes constituent un groupe frère de toutes les Archées. La présence de caractères spécifiques des Eucaryotes retrouvés chez les archées Asgard pourrait s'expliquer dans certains cas par d'anciens transferts de gènes entre les archées Asgard et les proto-eucaryotes. Notez que la branche horizontale (notée a) qui relie l'ancêtre commun des Eucaryotes et des Archées à l'ancêtre commun des Archées (LACA) dans la figure b est plus petite que celle (notée e) qui le relie à celui des Eucaryotes (LECA) et beaucoup plus petite que celle (notée b) qui relie LUCA (ancêtre commun de tous les organismes) à l'ancêtre commun des bactéries (LBCA). Ces différences dans les longueurs de branches compliquent les analyses phylogénétiques. La longueur des branches horizontales correspond au nombre de mutations accumulées au cours du temps et que l'on peut identifier aujourd'hui en comparant les séquences des protéines. La branche a n'existe pas dans l'hypothèse de la figure a. 

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