Principes de classification et nomenclature biologique


BOTANIQUE

  • Écrit par 
  • Sophie NADOT, 
  • Hervé SAUQUET
  •  • 5 657 mots
  •  • 7 médias

Dans le chapitre « Botanique et systématique »  : […] La systématique est une discipline vaste qui a pour objet d'inventorier, de nommer, de classer et, dans sa signification actuelle, de reconstruire l'histoire évolutive des organismes vivants et disparus. Contrairement à une idée largement répandue, la botanique ne se limite pas à la systématique des plantes et la systématique des plantes (ou […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/botanique/1-botanique-et-systematique/

CLADISTIQUE

  • Écrit par 
  • Pascal TASSY
  •  • 3 012 mots
  •  • 4 médias

La cladistique, ou cladisme, est une méthode de classification biologique qui exprime la phylogénie, c'est-à-dire les relations de parenté existant entre les êtres vivants. Elle repose sur le partage de caractères hérités d'une ascendance commune (ancêtre commun). Élaborée au cours du xxe siècle, la […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/cladistique/#i_0

CLASSIFICATION DU VIVANT

  • Écrit par 
  • Pascal DURIS, 
  • Pascal TASSY
  •  • 7 215 mots
  •  • 4 médias

Les espèces vivantes se comptent par millions, entre 8 et 12 selon les estimations. C'est ce que l'on appelle la biodiversité . Pour l'heure, seulement 1,8 million d'entre elles sont identifiées et classées. Ce sont à 60 p. 100 des espèces animales, principalement des invertébrés. Parmi les quelque 46 000 espèces connues de vertébrés , on compte, […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/classification-du-vivant/#i_0

ESPÈCE, biologie

  • Écrit par 
  • Jean GAYON
  •  • 4 781 mots
  •  • 5 médias

En sciences de la vie , l'espèce constitue l'unité fondamentale et la plus naturelle de la classification. Cette notion, omniprésente et essentielle dans le langage courant comme dans l'usage scientifique, peut paraître simple mais elle est difficile à définir. Dans la littérature scientifique, la notion d'espèce a fait l'objet de nombreuses […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/espece-biologie/#i_0

FAMILLE DES PLANTES, Michel Adanson

  • Écrit par 
  • Jean-Marc DROUIN
  •  • 428 mots
  •  • 1 média

Familles des plantes est une œuvre singulière. Son auteur, le botaniste français Michel Adanson (1727-1806) , fit un séjour au Sénégal, de 1748 à 1754, pour y étudier la flore. Rentré en France, membre de l'Académie des sciences, il fut en contact avec Buffon et Bernard de Jussieu. […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/famille-des-plantes/#i_0

HISTOIRE DE LA CLADISTIQUE - (repères chronologiques)

  • Écrit par 
  • Philippe JANVIER, 
  • Michel LAURIN
  •  • 1 675 mots

1950 L'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il propose une nouvelle méthode de reconstruction des relations de parenté entre les espèces fondée exclusivement sur les états apomorphes (évolués ou particuliers) […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/histoire-de-la-cladistique-reperes-chronologiques/#i_0

NOMENCLATURE BOTANIQUE RÈGLES INTERNATIONALES DE

  • Écrit par 
  • Jean-Marie PRUVOST-BEAURAIN
  •  • 9 876 mots
  •  • 12 médias

Comment nommer les végétaux et les champignons ? Afin d'éviter toute ambiguïté, l'idéal serait que tout taxon, en particulier tout genre, espèce, sous-espèce ou variété, soit désigné, dans une langue donnée, par un nom et un seul, qui ne s'appliquerait qu'à ce taxon : ainsi pourrait-on, en particulier au niveau de l'espèce, établir une bijection […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/regles-internationales-de-nomenclature-botanique/#i_0

PHYLOGÉNIE ANIMALE

  • Écrit par 
  • Michaël MANUEL
  •  • 11 713 mots
  •  • 8 médias

L' évolution animale a été l'objet, depuis le xixe siècle, d'une somme considérable de travaux et de discussions, et demeure aujourd'hui un champ d'investigation très fertile. En effet, pour les biologistes, comprendre l'évolution animale est capital afin de disposer d'une classification qui reflète […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/phylogenie-animale/#i_0

PHYLOGÉNOMIQUE

  • Écrit par 
  • Gabriel GACHELIN
  •  • 3 023 mots
  •  • 1 média

La phylogénomique, définie à la fin des années 1990, vise à établir les filiations entre les différents groupes d'êtres vivants en s'appuyant sur les caractéristiques de leur patrimoine héréditaire respectif. Elle constitue ainsi la version la plus récente d'une démarche scientifique initiée dès la fin du xviii […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/phylogenomique/#i_0

SYSTEMA NATURAE (C. von Linné)

  • Écrit par 
  • Pascal DURIS
  •  • 227 mots

Publié en 1735 par le naturaliste suédois Carl von Linné (1707-1778), Systema naturae renferme la première classification vraiment scientifique des mondes minéral, végétal et animal . Si la classification des minéraux conçue par Linné a été vite oubliée, celle des végétaux et des animaux a en revanche connu un grand succès, […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/systema-naturae/#i_0

SYSTÉMATIQUE PHYLOGÉNÉTIQUE

  • Écrit par 
  • Philippe JANVIER
  •  • 350 mots

En 1950, l'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie son Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il expose sa méthode d'utilisation des caractères morphologiques afin d'élucider les relations de parenté entre les espèces ou les groupes d'espèces (taxons). Il propose que les […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/cladistique-systematique-phylogenetique/#i_0

TAXINOMIE ou TAXONOMIE NUMÉRIQUE

  • Écrit par 
  • Jean RAYNAL
  •  • 798 mots

Michel Adanson (1727-1806) a été le précurseur génial de la taxinomie numérique. Incompris en son siècle, réfractaire aux axiomes linnéens, Adanson manifesta déjà le besoin d'évaluer quantitativement, de façon précise, reproductible, les différences ou les ressemblances, et de substituer à des évaluations demeurées floues et subjectives des […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/taxinomie-taxonomie-numerique/#i_0

VARIATION, biologie

  • Écrit par 
  • Jean GÉNERMONT
  •  • 9 399 mots
  •  • 2 médias

Dans le chapitre « Variation entre espèces apparentées et critères de l'espèce »  : […] Selon la « définition biologique », qui sera retenue ici, deux espèces distinctes sont génétiquement inaptes à se croiser efficacement entre elles. Les caractères par lesquels diffèrent deux espèces apparentées peuvent participer ou non à la barrière d'isolement reproductif. Caractères directement liés à l'isolement reproductif Chez […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/variation-biologie/3-variation-entre-especes-apparentees-et-criteres-de-l-espece/


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Phylogénie animale : caractères embryologiques et classification

Phylogénie animale : caractères embryologiques et classification

tableau

Les caractères embryologiques classiques, confrontés à la nouvelle phylogénie des Bilateria. Les états de caractères écrits en bleu sont ceux qui sont classiquement attribués aux deutérostomiens; les états en rouge caractérisaient les protostomiens dans la classification... 

Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Phylogénie animale : classification des métazoaires

Phylogénie animale : classification des métazoaires

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Arbre des métazoaires (animaux pluricellulaires) d'après les phylogénies moléculaires fondées sur les ARN ribosomiques. 

Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Faune d'Ediacara

Faune d'Ediacara

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Reconstitution de la faune précambrienne des eaux littorales d'Ediacara. 

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Faune de Burgess

Faune de Burgess

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Quelques représentants de la faune de Burgess. 

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Conception traditionnelle de l'évolution animale

Conception traditionnelle de l'évolution animale

dessin

L'arbre, qui ne comporte ici que les embranchements habituellement considérés comme majeurs, est fondé sur l'idée d'une complexité croissante des animaux, allant du plus «  primitif » au plus «  évolué » au fur et à mesure qu'on s'éloigne de la base de l'arbre. 

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Phylogénie animale : l'ancêtre des Bilateria

Phylogénie animale : l'ancêtre des  Bilateria

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Un portrait-robot de l'ancêtre des Bilateria, d'après des travaux de l'évo-dévo (évolution et développement). Baptisé Urbilateria, cet ancêtre serait un organisme relativement complexe par rapport à l'ancêtre anatomiquement simple de la théorie classique. 

Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Phylogénie animale : classification des Bilateria

Phylogénie animale : classification des  Bilateria

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Arbre des Bilateria, principalement issu des phylogénies moléculaires. La couleur des noms des embranchements indique le type d'organisation de ces animaux du point de vue des cavités liquidiennes: en bleu, les acœlomates; en vert, les pseudo-cœlomates; en rouge les cœlomates. 

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Phylogénie animale : théorie de la Gastraea

Phylogénie animale : théorie de la Gastraea

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La théorie de la Gastraea, scénario imaginé par Haeckel pour expliquer les toutes premières étapes de l'évolution des métazoaires. 

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Téléostéens : cladogramme

Téléostéens : cladogramme

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Cladogramme des Téléostéens. 

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Monde animal: classification sommaire

Monde animal: classification sommaire

tableau

Classification sommaire du monde animal. 

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Craniates : cladogramme

Craniates : cladogramme

dessin

Cladogramme des principaux groupes de Craniates. 

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Algues et classification

Algues et classification

dessin

La place des algues au sein de l’arbre de la vie (classification actuelle). Composées de différents groupes,  les algues se répartissent dans deux des trois grands domaines du monde vivant : les bactéries (Bacteria) et les eucaryotes (Eukaryota). C’est pour cela que le terme algue n’a... 

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Taxons et nothotaxons

Taxons et nothotaxons

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Hiérarchie des rangs de taxons et nothotaxons, suffixes des noms de taxons et abréviations des noms de rangs de la nomenclature botanique. 

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Classement d'espèces et variétés

Classement d'espèces et variétés

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Exemples de classement d'espèces et variétés dans la hiérarchie des rangs de la nomenclature botanique. 

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Nomenclature botanique: élaboration des règles

Nomenclature botanique: élaboration des règles

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Organigramme de l'élaboration de l'ICBN, de l'ICNCP et des listes de contrôle et registres de noms de cultivars (d'après l'ICNCP-1995). 

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Sous-embranchement des Pinophytina ou Gymnospermae : les 16 familles et 80 genres actuels

Sous-embranchement des  Pinophytina  ou  Gymnospermae  : les 16 familles et 80 genres actuels

tableau

Sous-embranchement des Pinophytina ou Gymnospermae (gymnospermes) : les 16 familles et 80 genres actuels. 

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Rangs de taxons

Rangs de taxons

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Noms en diverses langues des rangs de taxons de la nomenclature botanique. 

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Sous-embranchement des Pinophytina ou Gymnospermae (gymnospermes) : classes, sous-classes, ordres, familles

Sous-embranchement des  Pinophytina  ou  Gymnospermae  (gymnospermes) : classes, sous-classes, ordres, familles

tableau

Sous-embranchement des Pinophytina ou Gymnospermae (gymnospermes) : classes, sous-classes, ordres, familles.La classification des gymnospermes, considérés comme un embranchement, un sous-embranchement ou une classe selon les auteurs, faisant l'objet de multiples débats... 

Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Amniotes : relations phylétiques des différents groupes

Amniotes : relations phylétiques des différents groupes

dessin

Cladogrammes représentant les relations phylétiques des différents groupes d'Amniotes selon Gauthier et Gardiner. 

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Cladogramme des amniotes

Cladogramme des amniotes

dessin

Schéma montrant les relations de parenté des amniotes, animaux tétrapodes (vertébrés pourvus de quatre membres) qui possèdent tous, pour protéger leurs embryons, un sac contenant un liquide (le liquide amniotique) dont l’enveloppe est appelée amnios. Cet amnios est un caractère commun... 

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Cladistique: les fondements du cladogramme de Willi Hennig

Cladistique: les fondements du cladogramme de Willi Hennig

dessin

Principe de l’élaboration d’un cladogramme. On considère ici quatre espèces (W, X, Y et Z) et l’on étudie six caractères présents chez toutes les espèces. Chaque caractère se présente sous deux états : soit il est  primitif (en blanc) ou plésiomorphe, soit il est dérivé ou... 

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Cladistique et caractères moléculaires

Cladistique et caractères moléculaires

dessin

Un cas particulier d’évolution des caractères moléculaires. Pour un site donné d’un gène quelconque, la comparaison des nucléotides montre que deux espèces X et Y possèdent chacune une cytosine C (située au bout des deux branches). Supposons qu’en réalité cette cytosine soit le... 

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Cladistique : la vache, le saumon et le dipneuste

Cladistique : la vache, le saumon et le dipneuste

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Liens de parenté existant entre la vache, le saumon et le dipneuste (« poisson pulmoné »). Le membre pair monobasal (en noir) est un caractère dérivé (apomorphie) qui est présent chez la vache et le dipneuste. C’est donc une synapomorphie (puisque ce caractère est partagé par les deux ... 

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Systématique évolutionniste

Systématique évolutionniste

dessin

Systématique évolutionniste. La classification « horizontale » du règne animal, à gauche du tableau, présente un caractère statique. À droite, une classification dynamique, inspirée par l'idéologie darwinienne, donc prenant en compte le facteur temps et la notion de filiation, se... 

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Schéma de parenté des amniotes

Schéma de parenté des amniotes

dessin

L'actuelle division des amniotes (Amniota) en sauropsides (Sauropsida) et mammifères (Mammalia) se substitue à la traditionnelle classification en trois groupes : reptiles (Reptilia), oiseaux (Aves) et mammifères. Les oiseaux et les crocodiles (Archosauria), quoique peu ressemblants, sont ici… 

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Canidés

Canidés

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Les six canidés figurant sur cette planche illustrent  la difficulté de définir la notion d’espèce. Le chien (représenté sur la colonne de gauche par, de haut en bas, le chihuahua, l’épagneul et le saint-bernard) est une espèce sans équivalent dans le monde animal car elle regroupe... 

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Populations de goélands autour du pôle Nord.

Populations de goélands autour du pôle Nord.

dessin

Des populations de goélands étroitement apparentées sont réparties de manière approximativement circulaire autour du pôle Nord. Certaines sont communément appelées «goélands argentés», d'autres «goélands bruns». Les naturalistes distinguent sept variétés géographiques majeures,... 

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Disciplines de la botanique

Disciplines de la botanique

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Ce schéma illustre la diversité des disciplines et des principales applications de la botanique. 

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Classification phylogénétique des Angiospermes

Classification phylogénétique des Angiospermes

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Cette classification phylogénétique des Angiospermes, élaborée par APG III (Angiosperm Phylogeny Group) en 2009 et actualisée selon le site Angiosperm Phylogeny Website, est utilisée par la majorité des botanistes. Les traits noirs représentent les relations de parenté (phylogénie)... 

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Phylogénie animale : caractères embryologiques et classification

Phylogénie animale : caractères embryologiques et classification
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Phylogénie animale : classification des métazoaires

Phylogénie animale : classification des métazoaires
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Faune d'Ediacara

Faune d'Ediacara
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Faune de Burgess

Faune de Burgess
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Conception traditionnelle de l'évolution animale

Conception traditionnelle de l'évolution animale
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Phylogénie animale : l'ancêtre des  Bilateria

Phylogénie animale : l'ancêtre des Bilateria
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Phylogénie animale : classification des  Bilateria

Phylogénie animale : classification des Bilateria
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Phylogénie animale : théorie de la Gastraea

Phylogénie animale : théorie de la Gastraea
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Téléostéens : cladogramme

Téléostéens : cladogramme
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Monde animal: classification sommaire

Monde animal: classification sommaire
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Craniates : cladogramme

Craniates : cladogramme
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Algues et classification

Algues et classification
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Taxons et nothotaxons

Taxons et nothotaxons
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Classement d'espèces et variétés

Classement d'espèces et variétés
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Nomenclature botanique: élaboration des règles

Nomenclature botanique: élaboration des règles
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Sous-embranchement des  Pinophytina  ou  Gymnospermae  : les 16 familles et 80 genres actuels

Sous-embranchement des Pinophytina ou Gymnospermae : les 16 familles et 80 genres actuels
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Rangs de taxons

Rangs de taxons
Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Sous-embranchement des  Pinophytina  ou  Gymnospermae  (gymnospermes) : classes, sous-classes, ordres, familles

Sous-embranchement des Pinophytina ou Gymnospermae (gymnospermes) : classes, sous-classes, ordres, familles
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Amniotes : relations phylétiques des différents groupes

Amniotes : relations phylétiques des différents groupes
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Cladogramme des amniotes

Cladogramme des amniotes
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Cladistique: les fondements du cladogramme de Willi Hennig

Cladistique: les fondements du cladogramme de Willi Hennig
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Cladistique et caractères moléculaires

Cladistique et caractères moléculaires
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Cladistique : la vache, le saumon et le dipneuste

Cladistique : la vache, le saumon et le dipneuste
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Systématique évolutionniste

Systématique évolutionniste
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Schéma de parenté des amniotes

Schéma de parenté des amniotes
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Canidés

Canidés
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Populations de goélands autour du pôle Nord.

Populations de goélands autour du pôle Nord.
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Disciplines de la botanique

Disciplines de la botanique
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Classification phylogénétique des Angiospermes

Classification phylogénétique des Angiospermes
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