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CLASSIFICATION DU VIVANT

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Carl von Linné

Les espèces vivantes se comptent par millions, entre 8 et 12 selon les estimations. C'est ce que l'on appelle la biodiversité. Pour l'heure, seulement 1,8 million d'entre elles sont identifiées et classées. Ce sont à 60 p. 100 des espèces animales, principalement des invertébrés. Parmi les quelque 46 000 espèces connues de vertébrés, on compte, par exemple, plus de 9 600 espèces d'oiseaux et plus de 4 300 espèces de mammifères. Or chaque année sont décrites de nouvelles espèces appartenant à ces deux groupes, pourtant très en vue et réputés bien inventoriés.

Ces chiffres sont trompeurs. D'abord parce qu'ils laissent entendre que la communauté scientifique a depuis toujours admis la réalité de l'espèce. Or la question de savoir si elle représente une entité naturelle ou, au contraire, une abstraction sans existence objective, est récurrente dans l'histoire des sciences du vivant. Ensuite, lorsque les biologistes défendent la réalité de l'espèce, tous n'en ont pas la même définition, celle-ci pouvant être biologique, morphologique, phylogénétique, écologique, etc.

L'espèce n'en est pas moins le pivot de toute classification du vivant, c'est-à-dire de la subdivision de ce dernier en sous-unités ou taxons. Là encore, il y a débat entre les biologistes : les uns sont convaincus de l'existence de réelles discontinuités dans la nature ou que la parenté est une réalité historique (praticiens de la systématique, de la taxinomie, de la phylogénétique) ; les autres, les continuistes (praticiens de la biologie générale), défendent, au contraire, la plénitude de la nature et pensent que toute classification est arbitraire et que la phylogénie (généalogie) est difficilement connaissable. D'où la multiplicité des approches développées pour ordonner la formidable diversité du vivant.

Cette classification n'est pas une entreprise simple. Hier –  jusqu'au début du XIXe siècle, au temps du créationnisme et du fixisme – comme aujourd'hui – dans le cadre évolutionniste instauré par Charles Darwin  […]

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SYSTEMA NATURAE (C. von Linné)

Écrit par :  Pascal DURIS

Publié en 1735 par le naturaliste suédois Carl von Linné (1707-1778), Systema naturae renferme la première classification vraiment scientifique des mondes minéral, végétal et animal. Si la classification des minéraux conçue par Linné a été vite oubliée, celle des végétaux et des animaux a en revanche connu un grand succès, partout dans le… Lire la suite
ADANSON MICHEL (1727-1806)

Écrit par :  Lucien PLANTEFOL

…  à ceux qui l'ont précédé et particulièrement à Linné, il recherche une méthode naturelle pour la *classification. Linné a créé le système sexuel, artificiel parce qu'il ne tient compte que d'une partie de chaque plante : or une méthode naturelle doit considérer l'ensemble de toutes les parties du végétal. Dans Familles naturelles des plantes… Lire la suite
BACTÉRIES

Écrit par :  Jean-Michel ALONSO, Jacques BEJOT, Patrick FORTERRE

Dans le chapitre "Classification des bactéries"  : …  choisi arbitrairement et soumis à l'approbation d'un comité international de nomenclature. Pendant* longtemps, les bactéries étaient essentiellement distinguées par la coloration de Gram entre Gram + et Gram —, les Cyanobactéries (anciennement algues bleues) étant souvent classées à part. Cette classification rudimentaire a été bouleversée par l'… Lire la suite
BOIS

Écrit par :  Marie Elisabeth BORREDON, Édouard BOUREAU, Xavier DÉGLISE, Carlos VACA-GARCIA

Dans le chapitre "Le problème de l'identification d'un bois"  : …  La* classification des espèces feuillues est fondée sur la fleur. Or les divisions créées avec cette partie de la plante ne correspondent pas toujours à celles que le bois permet d'établir. Pour déterminer les plans ligneux vivants ou fossiles avec rigueur, il faut donc étendre les comparaisons à la totalité des bois déjà décrits. C'est alors qu'on… Lire la suite
BOTANIQUE

Écrit par :  Lucien PLANTEFOL

Dans le chapitre "La systématique végétale"  : …  Les termes « plantes supérieures », « plantes inférieures » supposent la *classification de toutes ces formes végétales. Le problème a été posé par Tournefort et Rajus : classification à partir d'un type d'organe – les pétales de la fleur – ou classification à partir de tous les caractères des végétaux. Le système sexuel créé par Linné (1735) a… Lire la suite
BRONGNIART ADOLPHE THÉODORE (1801-1876)

Écrit par :  Didier LAVERGNE

… *Botaniste français et principal fondateur de la paléobotanique. Né à Paris, il est le fils du minéralogiste Alexandre Brongniart. Appliquant à la classification des plantes fossiles la méthode qu'avait utilisée Cuvier pour le règne animal, Brongniart utilise l'anatomie et l'histologie comparées pour déceler les affinités qui existent entre les… Lire la suite
CATÉGORIES

Écrit par :  Fernando GIL

Dans le chapitre "Les classifications"  : …  classifications, et chaque classification constitue la version empirique d'une théorie catégoriale. *Catégories et classifications s'enracinent dans la phylogenèse. Les animaux classent leur milieu en fonction de ce qui est nourriture ou non, en fonction de leurs ennemis, de leurs partenaires sexuels, de leurs proies (E. Mayr, Principles of… Lire la suite
CESALPINO ANDREA (1519-1603)

Écrit par :  Universalis

… approche philosophique et théorique qui contribue à faire de la botanique une science indépendante. *Les 15 autres volumes décrivent et répertorient plus de 1 500 plantes, selon un système de classification fondé sur des principes unifiés et cohérents plutôt que sur l'ordre alphabétique et les propriétés médicinales des plantes. Cesalpino anticipe… Lire la suite
CHAMPIGNONS

Écrit par :  Jacques GUINBERTEAU, Patrick JOLY, Jacqueline NICOT, Jean Marc OLIVIER

Dans le chapitre " Les structures reproductrices et la classification générale des champignons"  : …  de leur rôle, gamétique ou non, on a pris l'habitude de distinguer les propagules des *champignons selon qu'elles sont nues et mobiles grâce à un ou deux flagelles (zoïdes) ou au contraire munies d'une paroi et non mobiles (spores). En réalité, cette distinction n'a peut-être pas l'importance qu'on lui accorde, car il n'est pas rare que les zoïdes… Lire la suite
CRUSTACÉS

Écrit par :  Jacques FOREST

Dans le chapitre "Classification"  : …  *En 1758, dans le Systema naturae, Linné place la plus grande partie des crustacés connus à côté des arachnides, parmi les Insecta Aptera, et les rattache à trois genres, dont l'un, Cancer, comprend principalement des décapodes : crevettes, crabes, homard, pagures. Les Lepas (cirripèdes) sont rangés à côté des… Lire la suite
CUVIER GEORGES (1769-1832)

Écrit par :  Jean PIVETEAU

Dans le chapitre "L'anatomie comparée comme science"  : …   d'après son organisation. La loi de subordination des caractères permet d'établir une *classification naturelle. Le système nerveux, « qui est au fond tout l'animal », donne les embranchements ; les organes de la respiration et de la circulation donnent les classes ; des organes de plus en plus subordonnés donneront successivement les… Lire la suite
ÉVOLUTION

Écrit par :  Armand de RICQLÈS, Stéphane SCHMITT

Dans le chapitre "Naissance de l'idée d'évolution "  : …  épigénétiques du développement, plus plastiques. Un autre facteur est la mise au point de *classifications hiérarchiques visant à représenter fidèlement l'ordre de la nature : à cet égard, le fixiste Linné (1707-1778) a joué un rôle paradoxal mais essentiel. À un niveau plus général, le succès grandissant des philosophies du progrès,… Lire la suite
FIXISME

Écrit par :  Hervé LE GUYADER

… vite, on va se rendre compte qu'elles sont en fait des approximations plus ou moins grossières d'une* unique classification, la classification naturelle, qui refléterait l'ordre de la nature. À cette époque, l'unicité de celle-ci allait de soi, car on la rapportait à l'unicité de la création divine. Le travail des botanistes va alors s'orienter vers… Lire la suite
FLORE, ouvrage botanique

Écrit par :  Gérard AYMONIN

Dans le chapitre " La période moderne"  : …  des taxons connus sur une zone géographique choisie (cela peut être une zone comme l'Europe) ; *– les Flores, qui doivent être conçues pour permettre l'identification de tous les taxons (familles, genres, espèces et unités inférieures) du territoire analysé. Dans ce dernier type de publications, chacun des niveaux hiérarchiques doit faire l'… Lire la suite
HERBIER

Écrit par :  Gérard AYMONIN

Dans le chapitre "La formation d'un herbier"  : …  même récolte. Les collections d'algues et de champignons nécessitent des techniques particulières. *L'identification d'un spécimen est un processus souvent long, requérant l'examen par des spécialistes de tel ou tel groupe de plantes afin de parvenir à définir la famille, le genre et parfois l'espèce. Elle se fait par étapes, en tentant de placer… Lire la suite
HEXAPODES

Écrit par :  René LAFONT

… *Les reconstructions phylogénétiques traitant des relations de parenté entre les grands groupes d'Insectes sont fondées sur des observations morpho-anatomiques, auxquelles s'ajoutent de plus en plus de résultats de phylogénie moléculaire. Il est évident que de nouvelles données sont sans cesse obtenues par les différents spécialistes des groupes, et… Lire la suite
HISTOIRE DE LA CLADISTIQUE - (repères chronologiques)

Écrit par :  Philippe JANVIER, Michel LAURIN

… * L'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il propose une nouvelle méthode de reconstruction des relations de parenté entre les espèces fondée exclusivement sur les états apomorphes (évolués ou particuliers) des caractères (surtout morphologiques),… Lire la suite
HISTOIRE NATURELLE

Écrit par :  Sophie SPITZ

… *La constitution d'une histoire naturelle à la fin du xviie siècle et au début du xviiie est fondée sur le souci de substituer à l'explication de la nature sa description intégrale, considérée alors comme seul moyen de préserver la richesse des formes naturelles dans leur singularité. Décrire, selon Tournefort… Lire la suite
INDE (Arts et culture) - Les sciences

Écrit par :  Francis ZIMMERMANN

Dans le chapitre "Structure d'un traité de médecine"  : …  des maladies et des remèdes. Une taxinomie, précisément, est un ensemble de principes de la *classification des formes vivantes. Par le biais des maladies et des remèdes, c'est l'ensemble de la flore, de la faune et des minéraux qui est inventorié. Ce que nous appelons aujourd'hui l'écologie et la géographie humaine est inclus dans le… Lire la suite
JARDINS BOTANIQUES

Écrit par :  Gérard AYMONIN

Dans le chapitre " Le Jardin royal des plantes médicinales de Paris"  : …  1775, la nomenclature binominale de Linné est adoptée pour l'étiquetage des spécimens, tandis que *B. de Jussieu, à Trianon, ordonne déjà les végétaux selon une « classification naturelle » que développera, à Paris, puis publiera en 1789, son neveu, A. L. de Jussieu. Il semble utile de rappeler ici une étape instructive. Entre 1630 et 1660, Gaston… Lire la suite
LINNÉ CARL VON (1707-1778)

Écrit par :  Georges GUSDORF

Dans le chapitre "La systématique"  : …  parvenus à fixer des points exclusifs de ressemblance et de dissemblance susceptibles de permettre *l'ordonnancement du domaine végétal dans son ensemble. Ray pensait qu'il fallait s'en tenir aux caractères des fleurs et des fruits ; Tournefort estimait qu'on devait y ajouter des caractères relatifs aux diverses parties de la plante. Ainsi les… Lire la suite
LINNÉ CARL VON (1707-1778) - (repères chronologiques)

Écrit par :  Pascal DURIS

…  mois (de mai à septembre 1732) en Laponie dont il tirera une Flora Lapponica (1737). * Il part en Hollande pour y obtenir le titre de docteur en médecine. C'est lors de son séjour dans ce pays qu'il publie quelques-uns de ses ouvrages les plus célèbres : Systema naturae (1735), Fundamenta botanica (1736), Genera… Lire la suite
MALACOSTRACÉS

Écrit par :  Jacques FOREST

Dans le chapitre "Classification"  : …  *Depuis son établissement, le groupe des malacostracés a toujours été reconnu comme une division naturelle des crustacés. À une époque où le nombre des crustacés inventoriés était encore peu élevé, Leach sépara les malacostracés en podophthalmes, qui possédaient des yeux pédonculés, et édriophthalmes, dont les yeux étaient sessiles. Un caractère… Lire la suite
MAMMIFÈRES

Écrit par :  Pierre CLAIRAMBAULT, Robert MANARANCHE, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ, Michel TRANIER

Dans le chapitre " Problèmes définitionnels"  : …  L'apparition *progressive du « patron structural » des Mammifères au sein de la lignée reptilienne Synapside rend difficile l'estimation d'une « frontière » entre animaux de grade reptilien et Mammifères. Ce problème est lié au caractère paraphylétique du taxon Reptiles (cf. reptiles). D'où les diverses tentatives de définition du clade « … Lire la suite
NOMENCLATURE BOTANIQUE RÈGLES INTERNATIONALES DE

Écrit par :  Jean-Marie PRUVOST-BEAURAIN

Dans le chapitre "Rangs de taxons et nothotaxons"  : …  Les groupes taxonomiques (c'est-à-dire servant à la *classification) de chaque rang sont appelés « taxons » (en latin taxa, sing. taxon). Chaque organisme individuel est considéré comme appartenant à un nombre non défini a priori de taxons, de rangs subordonnés consécutifs, le rang de base étant celui de l'espèce. Pour les… Lire la suite
NOSOLOGIE

Écrit par :  Georges TORRIS

… *Définition et classification des maladies. L'idée de classer les maladies à l'instar des espèces animales et végétales apparut au xviiie siècle sous l'influence des travaux de Linné (Boissier de Sauvages, 1731 ; Robert James, 1743). Les dermatologues, à la suite de R. William (1757-1812), en Grande-Bretagne, et de J. L. Alibert… Lire la suite
ONGULÉS

Écrit par :  Robert MANARANCHE, Michel TRANIER

…  comme un super-ordre, les Ongulés n'ont plus aujourd'hui aucune signification du point de vue de *la classification, les limites de cet ancien super-ordre ayant évolué avec l'exploration phylogénétique.  On classe les formes actuelles des Ongulés en cinq ordres, voire six : Perissodactyla (ou Mesaxonia), une partie des … Lire la suite
PALÉONTOLOGIE

Écrit par :  Édouard BOUREAU, Patrick DE WEVER, Jean PIVETEAU

Dans le chapitre "La classification des animaux"  : …  *Depuis Aristote, un des buts de la science de la nature a été de ranger les êtres vivants en groupes hiérarchisés, inclus les uns dans les autres. Une telle tendance et un tel besoin de l'esprit se manifestent, au xviiie siècle, dans l'œuvre des botanistes, en particulier de Carl von Linné (1707-1778) qui, sortant d'ailleurs des… Lire la suite
PALÉOZOÏQUE ou ÈRE PRIMAIRE

Écrit par :  Alain BLIECK

Dans le chapitre "Foisonnement des organismes fossiles"  : …  phylogénie morphologique et moléculaire menées depuis les années 1970, il est devenu classique de *diviser le monde vivant en trois groupes de rang supérieur (« domaines ») : les eubactéries (Eubacteria) ; les archées (Archaea) ; et les eucaryotes (Eucarya), parmi lesquels on distingue quatre « règnes » : les protistes ou protoctistes (Protista ou… Lire la suite
PHYLOGÉNIE ANIMALE

Écrit par :  Michaël MANUEL

…  En effet, pour les biologistes, comprendre l'évolution animale est capital afin de disposer d'une *classification qui reflète le mieux possible les relations de parenté (classification dite phylogénétique). Une telle classification se trouve au fondement de toute la biologie animale comparative. La phylogénie –  histoire des espèces et des lignées… Lire la suite
PHYLOGÉNOMIQUE

Écrit par :  Gabriel GACHELIN

…  dès la fin du xviiie siècle. Les naturalistes sont passés progressivement de *la classification des êtres vivants à la recherche des relations de filiation entre les groupes, proposant des schémas temporels de l'évolution des espèces. L'interprétation de la classification en termes d'évolution épissée aux données de la… Lire la suite
POISSONS

Écrit par :  Yves FRANÇOIS, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ

Dans le chapitre "Classification phylogénétique"  : …  Jusqu'*à la « révolution » cladiste, les Poissons étaient divisés en deux grands ensembles : les Agnathes et les Gnathostomes. Si ces derniers représentent un groupe monophylétique, il n'en va pas de même des Agnathes ; caractérisés par l'absence de mâchoires et différents autres traits primitifs, ils ne sont représentés dans la nature actuelle que… Lire la suite
RAY ou WRAY JOHN (1627-1705)

Écrit par :  Jacqueline BROSSOLET

… *Naturaliste anglais, surnommé le « Pline anglais », John Ray (ou Wray, en latin Raius) donne un souffle nouveau à la zoologie. Après avoir étudié à Cambridge, il enseigne à vingt-trois ans le grec et les mathématiques. Attiré par la botanique, il publie, en 1660, Catalogus plantarum circa Cantabrigium nascentium. Prêtre de l'Église… Lire la suite
CLADISTIQUE ou SYSTÉMATIQUE PHYLOGÉNÉTIQUE

Écrit par :  Philippe JANVIER

  *En 1950, l'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie son Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il expose sa méthode d'utilisation des caractères morphologiques afin d'élucider les relations de parenté entre les espèces ou les groupes d'espèces (taxons). Il… Lire la suite
TAXINOMIE ou TAXONOMIE NUMÉRIQUE

Écrit par :  Jean RAYNAL

… *Michel Adanson (1727-1806) a été le précurseur génial de la taxinomie numérique. Incompris en son siècle, réfractaire aux axiomes linnéens, Adanson manifesta déjà le besoin d'évaluer quantitativement, de façon précise, reproductible, les différences ou les ressemblances, et de substituer à des évaluations demeurées floues et subjectives des nombres… Lire la suite
TOURNEFORT JOSEPH PITTON DE (1656-1708)

Écrit par :  Jacqueline BROSSOLET

… son retour, il est nommé professeur de médecine au Collège de France et directeur du Jardin du roi. *Dans ses Éléments de botanique, admirablement écrits et décrits, il a classé les plantes selon leurs différentes parties, en examinant les fleurs, les feuilles, les racines, les tiges et la saveur. Il faut, dit-il, « ramasser comme par… Lire la suite
VERTÉBRÉS

Écrit par :  Charles DEVILLERS, Philippe JANVIER

Dans le chapitre "Morphologie"  : …  Jadis, et jusque dans les années 1960, les *classifications étaient fondées sur la ressemblance globale, et beaucoup de groupes zoologiques dits primitifs étaient constitués sur la base de caractères généraux présents également dans d'autres groupes, mais sous une forme modifiée. Puis un arbre évolutif était construit à partir de cette… Lire la suite
WOESE CARL (1928- )

Écrit par :  Antony G. CRAINE,  Universalis

…  1964, Woese entre dans le corps enseignant de l'université de l'Illinois à Urbana-Champaign. Avant *1977, date de parution de son article révolutionnaire dans les Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), nombre de biologistes pensent que toutes les espèces vivant sur Terre appartiennent à l'une des deux lignées primaires :… Lire la suite
XYLOTHÈQUE DU C.I.R.A.D.-FORÊTS

Écrit par :  Alain MARIAUX

…  de la fleur, du fruit et, secondairement, des feuilles, de la ramification, du port, etc. *Les arbres sont classés dans une famille au sein de laquelle ils appartiennent à un genre et à une espèce. La valeur scientifique d'un échantillon de bois tient donc à la récolte sur le même arbre d'un bon « herbier » aussi complet que possible, à sa… Lire la suite
ZOOLOGIE (HISTOIRE DE LA)

Écrit par :  Valérie CHANSIGAUD

Dans le chapitre "De la classification linnéenne à l'anatomie comparée"  : …  La *zoologie est profondément marquée par le système de classification des plantes mis au point par le Suédois Carl von Linné (1707-1778). Cette méthode est jugée très vite révolutionnaire, car elle permet de caractériser facilement n'importe quel organisme grâce à quelques critères parfaitement définis. Selon le naturaliste britannique Oliver… Lire la suite

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Carl von Linné Buffon Jean-Baptiste de Monet, chevalier de Lamarck Charles Darwin Systématique évolutionniste Schéma de parenté des amniotes

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