6. Foisonnement des organismes fossiles
À la suite des diverses études de phylogénie morphologique et moléculaire menées depuis les années 1970, il est devenu classique de diviser le monde vivant en trois groupes de rang supérieur (« domaines ») : les eubactéries (Eubacteria) ; les archées (Archaea) ; et les eucaryotes (Eucarya), parmi lesquels on distingue quatre « règnes » : les protistes ou protoctistes (Protista ou Protoctista), les champignons (Fungi), les plantes (Plantae) et les animaux ou métazoaires (Animalia ou Metazoa). Nous n'aborderons ici que le groupe des eucaryotes. Pour les bactéries (Eubacteria et Archaea), dont les plus anciennes correspondraient à des structures stromatolitiques datées entre — 3 500 et — 3 200 Ma (ce qui fait encore l'objet de débats scientifiques animés, certains réfutant ces structures en tant que traces de vie avérées), leur diversité familiale n'a en général pas changé depuis le Protérozoïque. Cela n'empêche pas que les bactéries (et les virus) constituent de nos jours l'essentiel de la biomasse à l'échelle globale.
• Les protistes ou protoctistes (eucaryotes basaux)
Ce groupe est typiquement paraphylétique, c'est-à-dire qu'il est défini par exclusion : ses représentants ne sont ni des animaux, ni des plantes, ni des champignons, ni des bactéries. Il s'agit d'eucaryotes basaux, c'est-à-dire des algues à cellules nucléées, des flagellés, des protozoaires, etc. Ce sont presque tous des organismes unicellulaires à noyau, mais certains d'entre eux présentent une organisation multicellulaire différente de celle des autres eucaryotes (par exemple certains ciliés, des euglènes, des chrysophytes et des diatomées), d'où le concept de protoctistes pour réunir les protistes unicellulaires et les protistes multicellulaires. Ils sont aquatiques (marins, dulcicoles ou parasites). Au Paléozoïque, le plancton marin comprend les acritarches, un groupe correspondant vraisemblablement à un amalgame d'organites et d'organismes d'affinités biologiques variées (animale, végétale ou protiste). Apparus vers —2 200 Ma en Sibérie (si le site d'Ikabijsk est correctement daté), ils sont préservés à caus […]
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