BIO-INFORMATIQUE

Articles

• BIOTECHNOLOGIES

  • Écrit par Pierre TAMBOURIN
  • 5 368 mots
  • 4 médias
  ...développement de la génomique (transcriptome, protéome, métabolome) et capables d'appréhender désormais le vivant à un niveau de complexité qui impose une bio-informatique solide susceptible de stocker les innombrables données obtenues mais aussi d'aider à leur interprétation en permettant de conceptualiser...

• BOTANIQUE

  • Écrit par Sophie NADOT, Hervé SAUQUET
  • 5 647 mots
  • 7 médias
  ...généralement au laboratoire par le botaniste lui-même, bien que la phase de lecture tende de plus en plus à être traitée par de grands centres de séquençage. Une fois les séquences obtenues, le reste du travail s'effectue sur ordinateur : tout d'abord l'alignement (mise en correspondance des séquences de différentes...

• CLADISTIQUE

  • Écrit par Pascal TASSY
  • 3 006 mots
  • 4 médias
  La cladistique a vite utilisé l'informatique. En effet, analyser de façon simultanée une multitude de caractères pour de nombreuses espèces, afin de construire l'arbre phylogénétique, est au-delà des capacités de l'esprit humain. Il est parfois difficile de faire ressortir la solution qui rend compte...

• CLASSIFICATION DU VIVANT

  • Écrit par Pascal DURIS, Pascal TASSY
  • 7 201 mots
  • 6 médias
  D' Amérique vinrent, à la fin des années 1960, les premiers algorithmes dits de parcimonie. Les ordinateurs calculent ce que ne peut faire le cerveau humain : la congruence maximale des distributions de caractères chez les espèces étudiées. Les parentés sont exprimées sous la forme d'un arbre –  le cladogramme...

• ÉPIDÉMIES ET PANDÉMIES

  • Écrit par Jacqueline BROSSOLLET, Georges DUBY, Universalis, Gabriel GACHELIN, Jean-Louis MIÈGE
  • 20 843 mots
  • 15 médias
  ...années qui ont suivi le début de la pandémie du sida. L’explosion d’informations qui en résulte bénéficie par ailleurs du développement de l’informatique, des programmes bio-informatiques et du traitement d’ensembles très volumineux de données. Celles acquises sur le terrain hospitalier et au laboratoire...

• EXPOSOME

  • Écrit par Élodie GIROUX
  • 4 797 mots
  • 2 médias
  ...particulier dans le champ de la médecine de précision. Une évaluation multiexposition au niveau bien plus vaste requis par l’exposome exige le développementd’outils bio-informatiques pour l’analyse et le traitement de données massives et le suivi sur le long terme de grandes cohortes d’individus.

• GÉNIE GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Louis-Marie HOUDEBINE
  • 3 338 mots
  • 6 médias
  ...celles-ci (identification et détermination de la structure des gènes, modification des messages génétiques et introduction dans des organismes vivants) est de plus en plus confiée à des robots. La somme des informations qui en découle devient chaque jour plus écrasante. Les biologistes travaillent désormais...

• GÉNOME HUMAIN

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 3 791 mots
  • 1 média
  ...produits d'expression (transcriptomes et protéomes) d'un grand nombre de types cellulaires différents, puis a recherché leur présence dans le génome humain, l'ensemble de ces informations étant traité dans deslaboratoires de bio-informatique qui s'appuient sur des applications construites à cette fin.

• PHYLOGÉNOMIQUE

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 3 017 mots
  ...technologiques, tant en ce qui concerne les machines qui permettent la détermination automatique et rapide des séquences d'ADN à des coûts devenus très bas, que pour ce qui est des algorithmes et des logiciels de la bio-informatique. Avec le développement de ces derniers, il est possible d'extraire de la séquence...