BIO-INFORMATIQUE

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• BIOLOGIE - La bio-informatique

  • Écrit par Bernard CAUDRON
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  • 3 médias

  La bio-informatique est une application des techniques informatiques au traitement massif de données biologiques. Elle est spécialement utilisée pour l'analyse des séquences génomiques et des protéines. Le terme de bio-informatique est apparu en 1995 dans des publications scientifiques et des programmes...

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  • Écrit par Pierre TAMBOURIN
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• BOTANIQUE

  • Écrit par Sophie NADOT, Hervé SAUQUET
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  ...généralement au laboratoire par le botaniste lui-même, bien que la phase de lecture tende de plus en plus à être traitée par de grands centres de séquençage. Une fois les séquences obtenues, le reste du travail s'effectue sur ordinateur : tout d'abord l'alignement (mise en correspondance des séquences de différentes...

• CLADISTIQUE

  • Écrit par Pascal TASSY
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  La cladistique a vite utilisé l'informatique. En effet, analyser de façon simultanée une multitude de caractères pour de nombreuses espèces, afin de construire l'arbre phylogénétique, est au-delà des capacités de l'esprit humain. Il est parfois difficile de faire ressortir la solution qui...

• CLASSIFICATION DU VIVANT

  • Écrit par Pascal DURIS, Pascal TASSY
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  D' Amérique vinrent, à la fin des années 1960, les premiers algorithmes dits de parcimonie. Les ordinateurs calculent ce que ne peut faire le cerveau humain : la congruence maximale des distributions de caractères chez les espèces étudiées. Les parentés sont exprimées sous la forme d'un ...

• ÉPIDÉMIES ET PANDÉMIES

  • Écrit par Jacqueline BROSSOLLET, Georges DUBY, Universalis, Gabriel GACHELIN, Jean-Louis MIÈGE
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  ...années qui ont suivi le début de la pandémie du sida. L’explosion d’informations qui en résulte bénéficie par ailleurs du développement de l’informatique, des programmes bio-informatiques et du traitement d’ensembles très volumineux de données. Celles acquises sur le terrain hospitalier et au laboratoire...

• ENCODE PROJET

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
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  Le projet Encode (Encyclopedia of DNA elements) a été lancé en 2003. Son but était de rechercher tous les éléments fonctionnels présents dans l'ADN du génome humain. La première synthèse de ce travail gigantesque, qui a impliqué plusieurs dizaines de laboratoires et quelques centaines...

• EXPOSOME

  • Écrit par Élodie GIROUX
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  ...particulier dans le champ de la médecine de précision. Une évaluation multiexposition au niveau bien plus vaste requis par l’exposome exige le développementd’outils bio-informatiques pour l’analyse et le traitement de données massives et le suivi sur le long terme de grandes cohortes d’individus.

• GÉNIE GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Louis-Marie HOUDEBINE
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  ...celles-ci (identification et détermination de la structure des gènes, modification des messages génétiques et introduction dans des organismes vivants) est de plus en plus confiée à des robots. La somme des informations qui en découle devient chaque jour plus écrasante. Les biologistes travaillent désormais...

• PHYLOGÉNOMIQUE

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 2 655 mots
  ...technologiques, tant en ce qui concerne les machines qui permettent la détermination automatique et rapide des séquences d'ADN à des coûts devenus très bas, que pour ce qui est des algorithmes et des logiciels de la bio-informatique. Avec le développement de ces derniers, il est possible d'extraire de la séquence...

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