5. Phéodaires
On connaît peu de choses sur les Phéodaires. Ceux-ci, tous marins, vivent généralement assez profondément dans l'eau, même si quelques espèces sont observés en surface. Ils sont souvent solitaires, certains individus se rassemblant parfois en une pelote où s'entremêlent les appendices pour former un ensemble assez cohérent avec un début d'organisation.
Chez la majorité des espèces, le squelette est interne. Il est constitué de spicules de silice pure et amorphe, formant une structure le plus souvent continue. Parfois, les spicules sont isolés et plus ou moins complexes. Chez quelques espèces, le squelette est externe, formé alors de corps étrangers (coques de diatomées, spicules d'éponges, etc.) agglomérés à la périphérie du cytoplasme.
Le squelette de certains phéodaires est constitué d'éléments siliceux contenant du cytoplasme, reliés entre eux par une substance organique chitineuse qui se désagrège dès la mort de l'individu. Leur conservation à l'état fossile est donc problématique. D'autres sont constitués de fines barres reliées par des nœuds renforcés ou présentent un réseau très fin évoquant celui des diatomées. Enfin, d'autres montrent une matrice gélatineuse incluant de fines aiguilles siliceuses. Quelques espèces ont des coques bivalves.
La capsule centrale est perforée de trois gros pores seulement (un principal, appelé astropyle, et deux secondaires, les parapyles). Dans l'ectoplasme se trouve une masse granulaire qui contient des pigments (le phaeodium, qui a donné le nom à ce groupe) dont la fonction reste mal connue : soit ils permettent l'excrétion des déchets du métabolisme, soit ils sont le siège d'une sensibilité à la lumière ou encore le siège de symbiontes (zooxanthelles).
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