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PUCES À PROTÉINES

Après les puces à ADN et les puces à anticorps, de nouvelles applications voient le jour pour ces dispositifs miniatures qui permettent de traiter des milliers d'échantillons en quelques heures. C'est maintenant l'analyse du protéome, c'est-à-dire de l'ensemble des milliers de protéines codées directement ou indirectement par un génome, que les puces à protéines mettent à portée de main, comme le montre par exemple le travail effectué par l'équipe de Michael Snyder de l'université Yale (Science, no 293, pp. 2101-2105, septembre 2001). 5 800 protéines de levure, soit 80 % du protéome de cet organisme, ont pu être fixées sur support solide et examinées pour leur capacité de liaison spécifique à des phospholipides (figure). En fonction de leur réaction vis-à-vis des différents phospholipides, on peut assigner à plusieurs dizaines d'entre elles des fonctions qui n'avaient pu être prédites à partir de la séquence génomique. Un avantage déterminant de cette approche, par rapport aux systèmes génétiques classiques (double-hybride), est la possibilité de sonder les conditions de l'interaction (pH, température, concentration d'un cofacteur, etc.). Sa limite  […]

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BIOLOGIE - La biologie moléculaire

Auteur :  Gabriel GACHELIN

Dans le chapitre "La biologie systémique" : …  silico et biologie des systèmes) s'appuie très largement sur l'usage des puces. Puces à ADN et* puces à protéines permettent la modélisation de pans entiers du métabolisme cellulaire en tenant compte de l'ensemble des données connues (y compris les régulations génétiques et protéiques). C'est dans ce domaine de la biologie dite « sèche », qui… Lire la suite
BIOLOGIE - La bio-informatique

Auteur :  Bernard CAUDRON

Dans le chapitre "Analyse des transcriptomes et des protéomes " : …  logiciels comparatifs d'images et pour l'exploitation des banques de données de protéines ou d'ADN. *La bio-informatique a permis de développer, au début des années 2000, des « puces à protéines » (proteochips), sortes d'équivalents au niveau polypeptidique des « puces à ADN », spécialisées dans l'étude de familles de protéines. Les… Lire la suite
TECHNIQUES DU GÉNIE GÉNÉTIQUE - (repères chronologiques)

Auteur :  Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS

d'hybridation, qui est capable d'analyser simultanément l'expression de milliers de gènes. *Première puce à protéines, permettant l'analyse du protéome, c'est-à-dire des milliers de protéines codées directement ou indirectement par un génome. Mise au point de techniques de séquençage d'ADN à très haut débit. Ciblage de gène dans le génome d… Lire la suite

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