PHYLOGÉNOMIQUE

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De la phylogénie à la phylogénétique moléculaire

Jusque dans les années 1950, les débats sur la construction des arbres phylogéniques ont porté sur les caractères physiques des organismes, dont la présence ou l'absence était suffisamment informative, ainsi que sur les méthodes utilisées pour la construction de la phylogénie. La démarche s'appuyait essentiellement sur les homologies entre organes déduites de l'anatomie et de l'embryologie comparées. Puis, avec l'Allemand Willi Hennig (1913-1976), une nouvelle manière de traiter les caractères s'est rapidement imposée. Appelée cladistique, cette méthode établit les relations de parenté entre les divers groupes par tri entre les caractères dits primitifs et les caractères dits dérivés, et sur l'estimation du nombre minimal d'événements permettant de passer d'un groupe – ou clade – à un autre (principe de parcimonie). La cladistique permet ainsi d'obtenir une phylogénie d'un type nouveau – que l'on préfère souvent appeler phylogénétique pour la distinguer de la précédente –, laquelle est venue modifier en certains points la classification traditionnelle.

Vers 1970, un nouveau type de caractères utilisables pour construire des phylogénies prend le relais des caractères morphologiques : ce sont les séquences des protéines et des gènes. Rappelons que les caractères physiques sont dus à l'expression des gènes qui composent l'information génétique de tout organisme (les virus à ARN n'échappant pas à la règle). Les gènes sont des fragments d'ADN écrits dans un alphabet à quatre lettres (A pour adénine, T pour thymine, C pour cytosine et G pour guanine). Ces lettres sont alignées en séquences qui dictent la structure des molécules pour lesquelles elles codent et qui, el [...]



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Écrit par :

  • : chercheur en histoire des sciences, université Paris-VII-Denis-Diderot, ancien chef de service à l'Institut Pasteur

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Pour citer l’article

Gabriel GACHELIN, « PHYLOGÉNOMIQUE », Encyclopædia Universalis [en ligne], consulté le 10 décembre 2019. URL : http://www.universalis.fr/encyclopedie/phylogenomique/