MICROBIOME HUMAIN

Carte mentale

Élargissez votre recherche dans Universalis

Les composants des microbiotes du tube digestif

Le microbiome humain comprend au moins 900 espèces microbiennes différentes. Le microbiote du tube digestif est le plus étudié. La majorité des bactéries du microbiome humain se trouve en effet dans le côlon, qui contient environ 1014 bactéries avec un ensemble de gènes actifs supérieur de 100 fois à celui des gènes humains. L’œsophage et l’estomac sont plus ou moins stériles du fait de leur acidité, à cela près que la bactérie Helicobacter pylori, associée aux ulcères d’estomac y prolifère. Le microbiote de l’intestin grêle est mal connu, du fait de la difficulté à obtenir des échantillons, mais de composition sans doute proche de celle du côlon.

La plupart des micro-organismes du côlon sont des bactéries appartenant à des espèces communes à tous les êtres humains. Elles sont majoritairement (95 p. 100) anaérobies, strictes ou facultatives. Ce microbiote contient peu d’Archées (des méthanobactéries) et un petit nombre de Fungi (levures, Aspergillus et Penicillium). Des virus de bactéries (bactériophages) sont présents, sans doute importants pour l’équilibre populationnel du microbiote, mais mal connus.

Les bactéries anaérobies du microbiote intestinal appartiennent à cinq grands groupes dont deux dominent au plan quantitatif, les Firmicutes et les Bacteroidetes. Les Firmicutes comprennent surtout des Clostridia des groupes XIVa et IV, dont Faecalibacterium, et les lactobacilles (surtout dans l’intestin grêle). Les Bacteroidetes contiennent de nombreuses espèces, dont B. fragilis et Prevotella, destructrices de glycanes. Les autres groupes sont les Actinobacteria (groupe auquel appartiennent les bifidobactéries), les Proteobacteria (dont Escherichia coli), les Verrucomicrobia (dont des Akkermansia qui ont une affinité pour le mucus). La diversité bactérienne est considérable, mais la valeur numérique des différentes populations ne dit rien quant à leur importance en physiopathologie.

Lactobacilles en microscopie électronique

Lactobacilles en microscopie électronique

Photographie

Les bactéries du genre Lactobacillus sont des hôtes normaux non pathogènes de l'intestin et du vagin. On les trouve également dans des produits fermentés comme les yogourts. C'est à propos de ces bactéries qu'Élie Metchnikov, découvreur de l'immunité innée, a pu insister sur... 

Crédits : Science Photo Library

Afficher

Chaque espèce bactérienne possède son métabolisme propr [...]


1  2  3  4  5
pour nos abonnés,
l’article se compose de 7 pages



Médias de l’article

Lactobacilles en microscopie électronique

Lactobacilles en microscopie électronique
Crédits : Science Photo Library

photographie

Lien possible entre inflammation intestinale et maladie de Parkinson

Lien possible entre inflammation intestinale et maladie de Parkinson
Crédits : Encyclopædia Universalis France

dessin

Étal de probiotiques

Étal de probiotiques
Crédits : Sam Dao/ Alamy/ Hemis

photographie





Classification


Autres références

«  MICROBIOME HUMAIN  » est également traité dans :

MICROBIOME ET SANTÉ

  • Écrit par 
  • Chih-Jung CHANG, 
  • Yun-Fei KO, 
  • Hsin-Chih LAI, 
  • Jan MARTEL, 
  • David OJCIUS, 
  • John D. YOUNG
  •  • 6 522 mots
  •  • 5 médias

Notre corps abrite une communauté complexe de milliards de microbes, surtout des bactéries, mais aussi des virus, levures et protozoaires, un nombre à peu près équivalent à celui des cellules humaines. Dans des conditions normales, cette population vit en équilibre avec l’organis […] Lire la suite

ASTHME ET IMMUNITÉ INNÉE

  • Écrit par 
  • Gabriel GACHELIN
  •  • 2 487 mots
  •  • 1 média

Dans le chapitre « Comment retrouver un environnement protecteur ? »  : […] Ainsi, l’excès d’hygiène pour se protéger des microbes dès la petite enfance n’est donc pas nécessairement favorable. Un environnement dit « naturel », au sens de non ou peu aseptisé, rendrait les enfants moins vulnérables aux allergies et à l’asthme. Mais comment retrouver un effet protecteur, puisqu’il est saugrenu d’envisager un retour au mode de vie rural du xix e  siècle ? Posée en ces termes […] Lire la suite

Voir aussi

Pour citer l’article

« MICROBIOME HUMAIN », Encyclopædia Universalis [en ligne], consulté le 24 mars 2020. URL : http://www.universalis.fr/encyclopedie/microbiome-humain/