LIAISONS BIOCHIMIQUES FAIBLES

LIAISONS CHIMIQUES - Liaisons biochimiques faibles

  • Écrit par 
  • Antoine DANCHIN
  •  • 5 907 mots
  •  • 9 médias

La biologie a vu s'effacer depuis le début de ce siècle ce qui la séparait de la physique du fait que l'on s'est accordé à reconnaître qu'une modélisation en termes physico-chimiques pourrait, sans doute, expliquer les architectures et les processus qui caractérisent le vivant. Et plus particulièrement, c'est à la fin du premier quart du siècle que la description d'édifices atomiques complexes, le […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/liaisons-chimiques-liaisons-biochimiques-faibles/#i_81297

AUTOASSEMBLAGE VIRAL

  • Écrit par 
  • Léon HIRTH
  •  • 901 mots

Les virus les plus simples sont généralement constitués par une molécule d'acide nucléique protégée par des sous-unités protéiques. La particule virale ainsi constituée est dite nucléocapside . Les sous-unités qui composent la capside protéique peuvent s'arranger autour de l'acide nucléique selon une symétrie cubique ou hélicoïdale. Il arrive que les divers éléments d'une mêm […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/autoassemblage-viral/#i_81297

ENZYMES

  • Écrit par 
  • Gabriel GACHELIN
  •  • 12 668 mots
  •  • 10 médias

Dans le chapitre « La formation du complexe enzyme substrat dans le site actif »  : […] Considérons une enzyme E et son substrat S. La découverte de Michaelis et Menten a été la démonstration que la condition du pouvoir catalytique d'une enzyme est la formation entre l'enzyme et son substrat d'un complexe, appelé ES, dans lequel le substrat est fixé de manière spécifique au sein d'un creux de l'enzyme, le site actif (fig. 2 ) appelé encore site catalytique. La première preuve de l'ex […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/enzymes/#i_81297

IMMUNOCHIMIE - Réaction antigène-anticorps

  • Écrit par 
  • Joseph ALOUF
  •  • 9 372 mots
  •  • 6 médias

Dans le chapitre « Aspects thermodynamiques de la réaction ligand-site anticorps »  : […] La formation du complexe L − P de la réaction (1) entraîne une variation de l' énergie libre standard ΔG 0 du système reliée à la constante d'équilibre K par l'équation : où T est la température absolue exprimée en kelvins (− 273 0 C = 0 K), R la constante des gaz parfaits (8,314 J . K -1  . mol -1 […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/immunochimie-reaction-antigene-anticorps/#i_81297

MACROMOLÉCULES

  • Écrit par 
  • Michel FONTANILLE, 
  • Yves GNANOU, 
  • Marc LENG
  •  • 13 783 mots
  •  • 6 médias

Dans le chapitre « Les protéines »  : […] Les protéines constituent une classe de macromolécules d'une grande complexité. Elles résultent de l'enchaînement linéaire d'acides aminés assemblés séquentiellement au niveau des ribosomes du cytoplasme cellulaire conformément au modèle que constitue l'ARN messager, c'est-à-dire conformément au code génétique qui procède d'une séquence originellement définie au niveau de l'ADN. Vingt sortes d'ac […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/macromolecules/#i_81297

PHARMACOLOGIE

  • Écrit par 
  • Edith ALBENGRES, 
  • Jérôme BARRE, 
  • Pierre BECHTEL, 
  • Jean-Cyr GAIGNAULT, 
  • Georges HOUIN, 
  • Henri SCHMITT, 
  • Jean-Paul TILLEMENT
  •  • 20 274 mots
  •  • 9 médias

Dans le chapitre « Conditions de l'interaction molécule-récepteur »  : […] L'activité d'une molécule endogène, ou exogène, ne dépend pas seulement de son aptitude intrinsèque à interagir avec un récepteur, mais également de son cheminement vers celui-ci, qui conditionne sa distribution. L'interaction molécule-récepteur dépend de la complémentarité des deux partenaires illustrée par le couple clé-serrure. Elle résulte de la formation d'interactions de différents types : l […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/pharmacologie/#i_81297

PHARMACORÉCEPTEURS, biochimie

  • Écrit par 
  • Philippe COURRIÈRE
  •  • 595 mots
  •  • 1 média

Notion introduite pour la première fois par J. N. Langley et P. Ehrlich à propos de l'action d'une drogue. Langley observa, en effet, en 1909, que la nicotine, qui est un excitant ganglionnaire, provoquait une réponse quand on l'appliquait localement sur certaines parties du tissu musculaire et que son effet persistait même après dénervation du muscle. Il en conclut qu'il existait, en des points […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/pharmacorecepteurs-biochimie/#i_81297

PROTÉINES

  • Écrit par 
  • Yves BRIAND, 
  • Philippe BRION, 
  • René LAFONT, 
  • Jean-Claude MEUNIER, 
  • Pierre VIGNAIS
  •  • 20 683 mots
  •  • 19 médias

Dans le chapitre « La stabilité des protéines »  : […] La stabilité conformationnelle d'une protéine est définie comme la variation d'enthalpie libre associée à la réaction : protéine dépliée (dénaturée) ↔ protéine repliée (renaturée/native). L'approximation de la théorie des deux états s'applique à une transition fortement coopérative comme la transition dénaturation-renaturation et permet d'en déterminer expérimentalement les paramètres thermodynami […] Lire la suite☛ http://www.universalis.fr/encyclopedie/proteines/#i_81297


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Interactions dans les systèmes biologiques

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Divers types d'interactions faibles à l'œuvre dans les systèmes biologiques, avec leurs principales caractéristiques énergétiques et géométriques 

Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Rôle des liaisons dans la structure des protéines

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Rôle des liaisons faibles dans la structure des protéines : en haut, hélice a d'une chaîne polypeptidique ; en bas, feuillet plissé ß antiparallèle 

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Allostérie

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Allostérie 

Crédits : Encyclopædia Universalis France

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Auto-assemblage

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Auto-assemblage : protéines capsidiques des particules virales de mosaïque du tabac, réalisant des assemblages variés selon les conditions du milieu (force ionique en pH) 

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Catalyse enzymatique

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Interprétation de la spécificité de la catalyse enzymatique en fonction de la conformation du site actif de l'enzyme 

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Interaction entre l'eau et les molécules lipidiques

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Interaction entre l'eau et les molécules lipidiques 

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Liaison d'un substrat à un tétramère

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Schéma de la liaison d'un substrat S à un tétramère Soit une molécule formée de quatre sous-unités identiques, mais existant sous deux formes A et B, et pouvant se lier à un substrat SDans le modèle initial de Koshland, Nemethy et Filmer, seuls les éléments de la diagonale existent : la... 

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Molécule d'eau

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La molécule d'eau, dipôle permanent (en haut) et la liaison ion-dipôle, dans le cas de l'ion potassium (K+) en solution dans l'eau (en bas) 

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Structure de l'eau

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Structure de l'eau : a, dissymétrie de la molécule ; b, réseau tridimensionnel dissociable comme le montre le détail de gauche en libérant des ions : OH+3 est le proton hydraté (hydronium des solutions aqueuses, oxonium dans les autres cas), OH- est l'anion... 

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Interactions dans les systèmes biologiques
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Rôle des liaisons dans la structure des protéines
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Allostérie
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Auto-assemblage
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Catalyse enzymatique
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Interaction entre l'eau et les molécules lipidiques
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Liaison d'un substrat à un tétramère
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Molécule d'eau
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Structure de l'eau
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