GÉNOMIQUEThéorie et applications

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L'analyse des génomes

Les bactéries possèdent environ 2 000 gènes, les levures 5 000, les plantes et les animaux 20 000. Ces gènes sont contenus dans 4 × 106 paires de bases chez les bactéries, 2 × 107 chez les levures, 108 à 1011 chez les plantes et 3 × 109 chez les animaux supérieurs. Définir l'ordre des bases d'un grand génome est une opération délicate en raison non seulement de sa taille mais aussi de la présence de nombreuses séquences répétées qu'il est difficile de positionner correctement dans l'ADN.

La cartographie génétique des génomes

Pour pouvoir commencer à connaître et exploiter les génomes, avant d'en déterminer la structure intime, il est apparu intéressant d'en dresser une carte. Les 3 × 109 paires de bases qui sont contenues dans 1,8 mètre d'ADN, lui-même présent dans chacune des cellules humaines, occuperaient un livre de 100 mètres d'épaisseur, écrit avec les seules lettres ATGC correspondant aux bases de l'ADN, le tout sans ponctuation ni indication particulière. La cartographie des génomes consiste à situer, le long des chromosomes, des séquences d'ADN connues. Celles-ci ne sont le plus souvent pas choisies particulièrement en fonction des informations génétiques qu'elles contiennent. Il est au contraire apparu plus judicieux de localiser des centaines ou des milliers de séquences courtes, répétées et réparties dans l'ensemble de la plupart des génomes. De telles séquences, composées du motif GT par exemple, répété de 15 à 20 fois, sont réparties dans l'ensemble des génomes des animaux. Appelées microsatellites, elles sont héritables, comme tout fragment d'ADN, mais également très polymorphes car manifestement peu soumises à une pression de sélection. Il a été possible de définir la position des milliers de microsatellites chez l'homme, la souris, les principaux animaux domestiques et les principales plantes cultivées. Cette cartographie est progressivement étendue à un plus grand nombre d [...]


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Écrit par :

  • : directeur de recherche, unité de biologie du développement et reproduction, Institut national de la recherche agronomique

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Pour citer l’article

Louis-Marie HOUDEBINE, « GÉNOMIQUE - Théorie et applications », Encyclopædia Universalis [en ligne], consulté le 20 septembre 2020. URL : https://www.universalis.fr/encyclopedie/genomique-theorie-et-applications/