GÉNOMIQUELe séquençage des génomes

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Méthodologie du séquençage

Obtention de l'ADN à séquencer

Le clonage est indispensable, sauf cas particulier, pour toute étude détaillée de l'ADN d'un organisme et en particulier pour son séquençage : c'est lui qui permet de disposer de l'ADN de ce génome sous une forme pure et utilisable. En pratique, les fragments d'ADN de l'organisme à étudier sont associés à un vecteur et introduits dans un hôte (souvent une bactérie, parfois une levure). Chaque bactérie (ou levure) ayant reçu un fragment de l'ADN exogène donne naissance à une colonie, un clone formé d'individus identiques et contenant le même segment d'ADN exogène, que l'on peut ainsi produire à volonté.

Les vecteurs employés en biologie moléculaire « classique » dérivent soit de plasmides naturellement présents dans les bactéries et modifiés de manière à emporter un segment d'ADN exogène, soit de virus bactériens comme le bactériophage lambda (également modifié), soit de constructions comme les cosmides réalisées à partir d'éléments empruntés aux vecteurs précités. La taille des fragments d'ADN incorporés va de quelques centaines de bases jusqu'à trente ou quarante milliers de bases (kilobases) pour les cosmides. Ces tailles sont bien adaptées pour nombre d'études, mais sont insuffisantes pour l'étude de grands génomes : un chromosome humain contient environ cent à cent cinquante millions de bases d'ADN et son clonage sous forme de fragments contenus dans des cosmides aboutit à des milliers de clones. Le repérage de la région du chromosome dont provient chaque cosmide devient alors très malaisé.

Les besoins de l'étude des génomes ont motivé la mise au point de systèmes de clonage capables de transporter de très grands fragments d'ADN. Le premier d'entre eux a été le système des chromosomes artificiels de levure (YAC, yeast artificial chromosomes) qui « déguise » un grand segment d'ADN exogène en chromosome de levure en lui ajoutant quelques segments d'ADN [...]


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Taille de divers génomes

Taille de divers génomes
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Clonage et sous-clonages

Clonage et sous-clonages
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Position d'un nucléotide dans l'ADN

Position d'un nucléotide dans l'ADN
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Exploration du génome et bio-informatique, B. Jordan

Exploration du génome et bio-informatique, B. Jordan
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Pour citer l’article

Bertrand JORDAN, « GÉNOMIQUE - Le séquençage des génomes », Encyclopædia Universalis [en ligne], consulté le 19 février 2020. URL : http://www.universalis.fr/encyclopedie/genomique-le-sequencage-des-genomes/