L'ouverture du bloc communiste permet au Vatican de renouer des liens officiels avec l'Europe de l'Est. Le Vatican établit des relations diplomatiques avec l'U.R.S.S., la Hongrie et la Roumanie en 1990 – après la Pologne en 1989 – et avec l'Albanie en 1991 ; il renoue les relations avec les États Baltes, ainsi qu'avec différents pays issus de la fragmentation des pays communistes, parmi lesquels l'Arménie, l'Azerbaïdjan, la Bosnie-Herzégovine, la Géorgie, la Moldavie et l'Ukraine en 1992. Les relations avec le Mexique reprennent cette même année après une interruption de cent vingt-cinq ans.
Le 18 octobre 1990 est promulgué le « Code des canons des Églises orientales » pour les vingt et une Églises catholiques orientales.
Le pape Jean-Paul II s'engage dans la recherche d'une solution au Proche-Orient, rencontrant le chef de l'O.L.P. Yasser Arafat en 1990 et réunissant en mars 1991 les sept patriarches des Églises catholiques du Proche-Orient lors d'un synode extraordinaire d'évêques.
Le 30 décembre 1993, le Vatican et Israël signent un « accord fondamental » qui prévoit la normalisation des relations entre les deux États et l'échange d'ambassadeurs, ce qui équivaut à une reconnaissance mutuelle. Le 15 juin 1994, le Vatican et Israël annoncent l'instauration de relations diplomatiques complètes.
Le 10 mars 1997, allant à l'encontre des mises en garde américaines, le Vatican annonce l'ouverture de relations diplomatiques avec la Libye, où vivent environ 50 000 catholiques. Le Saint-Siège indique qu'il entend « donner une impulsion particulière au dialogue international ».
En décembre, Karékine Ier, catholicos de l'Église apostolique arménienne, et Jean-Paul II signent un accord mettant fin à quinze siècles de querelle théologique sur la nature humaine du Christ.
En janvier 1998, Jean-Paul II se rend en visite à Cuba où il s'exprime librement, défendant les libertés et la démocratie et condamnant implicitement l'embargo américain. La visite du pape constitue à la fois une victoire diploma […]
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