3. Répercussions de l'œuvre
Les premières attaques contre le Traité portèrent plus sur sa critique de l'interprétation traditionnelle de la Bible que sur ses aspects politiques. L'ouvrage remettait en cause une lecture de l'histoire humaine que, par exemple, Bossuet illustrait encore dans le Discours sur l'Histoire universelle. Catholiques, calvinistes et luthériens entreprirent donc sa réfutation. Mais d'autres travaux, venus d'horizons différents (Richard Simon, Jean Astruc, les théologiens allemands de la fin du xviiie siècle) contribuèrent à leur tour à défaire l'orthodoxie scripturaire, et l'on peut dire que le TTP constitua le premier fondement de la critique biblique moderne. Quant aux aspects politiques, ils diffèrent de la doctrine de la tolérance telle qu'on la trouve par exemple chez Locke, car ils se fondent sur la puissance relative de la nature humaine et non sur des droits abstraits, et ne connaissent pas les limites de la Lettre lockienne sur la tolérance. Enfin l'analyse de la société en termes de passions et non de volonté annonce celle de Hume et tout ce qui donnera naissance aux théories de la société civile – c'est-à-dire le courant d'où sont issues les sciences sociales.
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