SITE ACTIF, biochimie

Ce sujet est traité dans les articles suivants :

1.  ABZYMES

Écrit par : Joël CHOPINEAU, Alain FRIBOULET, Sabine PILLE, Daniel THOMAS

…  consiste à faire faire par un anticorps une copie plus ou moins fidèle de la structure du *site actif d'une enzyme, en utilisant les propriétés du réseau idiotypique décrit par Niels Jerne en 1974. Il est possible d'obtenir un premier anticorps, dirigé contre le site actif d'une enzyme. Cet anticorps représente une « image négative »,… Lire la suite

2.  ENZYMES

Écrit par : Gabriel GACHELIN

Dans le chapitre "La catalyse enzymatique"  : … substrat par l'enzyme que les conditions de la stabilisation temporaire de l'état de transition. Ce* site est appelé site actif ou encore site catalytique. La plus grande partie de l'enzymologie porte sur la manière dont le site actif interagit spécifiquement avec son substrat et sur les mécanismes réactionnels à l'œuvre dans la catalyse… Lire la suite

3.  LIAISONS CHIMIQUES - Liaisons biochimiques faibles

Écrit par : Antoine DANCHIN

Dans le chapitre "Cas de la catalyse enzymatique"  : … encore des photons de la lumière visible). Comme tout catalyseur, une enzyme n'intervient dans la réaction que pour en accélérer la vitesse et sans être consommée au cours du processus d'activation. Ce qui est important, par conséquent, c'est la vitesse de rotation des substrats et des produits de la réaction au* site catalytique de l'enzyme… Lire la suite

4.  MANGANÈSE

Écrit par : Bernard DUBOIS, Jacques FAUCHERRE, Gil MICHARD, Clotilde POLICAR, Jean-Louis VIGNES

Dans le chapitre " Le manganèse dans les systèmes biologiques"  : … structurant du bois protégeant la cellulose contre les agressions extérieures de nature diverse. *Cette enzyme possède à son actif un Mn(II) qui est, au cours du cycle catalytique, oxydé en Mn(III). Le site du Mn(II) est enfoui au cœur de la protéine. Or le substrat polymérique qu'est la lignine ne peut, en raison de sa taille, accéder à ce site… Lire la suite

5.  PHARMACOLOGIE

Écrit par : Edith ALBENGRES, Jérôme BARRE, Pierre BECHTEL, Jean-Cyr GAIGNAULT, Georges HOUIN, Henri SCHMITT, Jean-Paul TILLEMENT

Dans le chapitre "Modélisation moléculaire et calcul"  : … magnétique nucléaire (R.M.N.). Dans le meilleur des cas, lorsqu'on dispose de la structure 3D du *site actif, on recherche quelles sont les structures qui s'adaptent le mieux à ce site. On détermine ainsi un site actif à l'intérieur duquel on simule ensuite la présence d'une petite molécule (programmes de docking). Sinon, on modélise le… Lire la suite

6.  PROTÉINES

Écrit par : Yves BRIAND, Philippe BRION, René LAFONT, Jean-Claude MEUNIER, Pierre VIGNAIS

Dans le chapitre "Le protéasome 20S"  : … catalytique, est en contact avec deux antichambres délimitées par un anneau α et un anneau β. Chez* les eucaryotes, trois des sept sous-unités β présentent un site actif fonctionnel. Ces trois sites actifs coupent les liaisons peptidiques qui attachent les acides aminés constitutifs des protéines. Le protéasome peut hydrolyser les différentes… Lire la suite

7.  RIBOSOMES

Écrit par : Carlo COCITO

Dans le chapitre "Topographie des sites fonctionnels"  : … formation du lien peptidique −CO− NH−, réaction clef de la synthèse protéique, est réalisée par le *centre catalytique de la peptidyl-transférase, un domaine de la grande sous-unité ribosomale. Ce centre serait constitué par des segments de l'ARNr 23 S et par une série de protéines r situées à la base de la protubérance centrale. Cette région est… Lire la suite

8.  RIBOZYMES

Écrit par : Joël CHOPINEAU, Alain FRIBOULET, Sabine PILLE, Daniel THOMAS

…  molécule de se replier de manière très spécifique, créant ainsi une surface complexe qui forme un *site actif. La comparaison des sites de clivage de plusieurs ARN viraux a conduit à l'élaboration d'un modèle de structure secondaire pour ces molécules enzymatiques. Une séquence de 52 nucléotides seulement est capable d'avoir une telle activité… Lire la suite