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NUCLÉOTIDIQUE SÉQUENCE

Ce sujet est traité dans les articles suivants :

1.  ADN (acide désoxyribonucléique) ou DNA (deoxyribonucleic acid)

Écrit par : Michel DUGUETMichel MORANGE

Dans le chapitre "Le modèle de Watson et Crick"  : … et perpendiculaires à l'axe de la molécule. Ainsi, l'information portée sur une chaîne par la * séquence de bases apparaît de manière complémentaire sur l'autre chaîne, expliquant de façon prodigieusement simple comment une chaîne peut servir de modèle (matrice) pour la synthèse de l'autre (cf. fig. 2). La publication du modèle de Watson et… Lire la suite
2.  BACTÉRIOLOGIE

Écrit par : Jean-Michel ALONSOJacques BEJOTMichel DESMAZEAUDDidier LAVERGNEDaniel MAZIGH

Dans le chapitre "Méthodes"  : … évolution. Les premières méthodes de diagnostic moléculaire ont fait appel à l'hybridation d'une *séquence d'ADN simple brin connue : sonde d'ADN dûment marquée (radioactive, fluorescente ou chromogène...) avec une séquence à identifier (cf. génétique moléculaire), sur des fragments d'ADN ayant subi une dénaturation préalable (… Lire la suite
3.  BIOCHIMIE

Écrit par : Pierre KAMOUN

Dans le chapitre "Biologie moléculaire"  : … la troisième et la deuxième à la quatrième sur les deux brins complémentaires de la molécule d'ADN. *La séquence des bases sur l'ADN constitue un langage qui est parfois traduit en langage protéique : trois lettres sur l'ADN codent un message correspondant à un acide aminé. François Jacob et Jacques Monod, en 1961, ont montré que la synthèse… Lire la suite
4.  BIOLOGIE - La biologie moléculaire

Écrit par : Gabriel GACHELIN

Dans le chapitre "La double hélice de l'ADN"  : … Or l'ADN est une longue fibre issue de l'enchaînement de milliers ou de milliards des quatre* bases nucléotidiques, l'adénine (A), la thymine (T), la cytosine (C) et la guanine (G). Cet enchaînement produit une séquence (...AATCGATG...) dont la monotonie paraissait peu compatible avec le codage d'une multiplicité de protéines. Cependant,… Lire la suite
5.  BIOLOGIE - La bio-informatique

Écrit par : Bernard CAUDRON

Dans le chapitre "Définition et enjeux de la discipline"  : … quatre bases nucléiques (l'adénosine – A –, la cytosine – C –, la guanine – G – et la thymine – T). *L'information génétique est contenue dans de longues « phrases » constituées de ces quatre lettres : ce sont les gènes. Ces derniers codent pour des ARN qui seront finalement traduits, dans les cellules vivantes, en protéines. Les signaux de départ,… Lire la suite
6.  BIOTECHNOLOGIES

Écrit par : Pierre TAMBOURIN

Dans le chapitre "L'essor des biotechnologies"  : … dont il faut corriger le dysfonctionnement et, par là, les effets délétères. La connaissance des* séquences nucléotidiques de l'ADN constitue le niveau le plus fin de l'information génétique. Dans les années 1990, la biologie à grande échelle naît de la nécessité d'augmenter fortement la puissance des techniques de séquençage de cette… Lire la suite
7.  BOTANIQUE

Écrit par : Sophie NADOTHervé SAUQUET

Dans le chapitre "L'apport des outils modernes"  : … et l'informatique. En effet, depuis les années 1990, il est possible d'amplifier et lire la *séquence ADN de n'importe quel gène d'une espèce, pourvu qu'on ait une idée du début et de la fin de cette séquence et que l'on ait accès à du matériel convenable (généralement un échantillon de feuille pour les plantes terrestres) pour en extraire l… Lire la suite
8.  CELLULE - L'organisation

Écrit par : Pierre FAVARD

Dans le chapitre "Transcription, traduction, réplication"  : … types d'ARN sont utilisés pour la synthèse des chaînes polypeptidiques des protéines (fig. 7a). La* séquence des nucléotides d'un ARNm est traduite en séquence d'acides aminés par les ribosomes qui sont des complexes ARNr protéines. Une séquence de trois nucléotides adjacents de l'ARNm constitue un codon qui spécifie un acide aminé ; la table de… Lire la suite
9.  CHIMIE - La chimie aujourd'hui

Écrit par : Pierre LASZLO

Dans le chapitre "Évolution moléculaire"  : … xxe siècle, ce champ disciplinaire a entièrement basculé –  génomique oblige – vers* l'analyse comparée des acides nucléiques de divers organismes. Il associe aujourd'hui génomique, outils moléculaires et logiciels informatiques. Pour établir les arbres phylogénétiques (généalogie des espèces), le matériel de choix est constitué par… Lire la suite
10.  CHROMOSOMES - Le chromosome des eucaryotes

Écrit par : Denise ZICKLER

Dans le chapitre " Morphologie du chromosome"  : … fragments, dénaturé en chaînes simples et la vitesse de réassociation en duplex pour une séquence *nucléotidique donnée dépend du nombre d'exemplaires de cette dernière – font apparaître trois classes de fréquences de réassociation, dont les proportions diffèrent d'une espèce à l'autre : les séquences hautement répétitives, ou ADN satellite (plus… Lire la suite
11.  CLADISTIQUE

Écrit par : Pascal TASSY

Dans le chapitre "Cladistique et informatique"  : … de la cladistique informatisée. À partir des années 1980, la comparaison des gènes et l'examen des *séquences des nucléotides de l'ADN ont pris le pas sur les caractères anatomiques. D'une part, parce que c'est plus simple : l'information est stéréotypée, les gènes ne diffèrent que par les quatre bases qui les composent (A pour adénine, G pour… Lire la suite
12.  CODE GÉNÉTIQUE

Écrit par : Antoine DANCHIN

…  : les brins se séparent et sont recopiés l'un et l'autre en respectant la loi de complémentarité. *La séquence de l'ADN a de nombreuses fonctions, dont nous ne retiendrons qu'une seule, celle de définir localement des séquences codant les acteurs de la vie cellulaire, les protéines. Les protéines sont, là encore, des enchaînements de modules de… Lire la suite
13.  COMPLÉMENTARITÉ, biochimie

Écrit par : Didier LAVERGNE

… *La présence de motifs structuraux à conformation complémentaire sur des molécules organiques non identiques permet leur assemblage à la manière des pièces d'un puzzle par stéréospécificité. La complémentarité est rigoureuse quand elle dépend de l'organisation séquentielle des motifs d'assemblage. C'est le cas pour la molécule d'ADN, constituée par… Lire la suite
14.  DENISOVA HOMME DE

Écrit par : Bruno MAUREILLE

Dans le chapitre "L'ADN mitochondrial de l'homme de Denisova"  : … En *2010, Swante Pääbo et son équipe ont séquencé et étudié le génome mitochondrial complet de la phalange isolée, attribuée à un enfant, découverte dans la grotte de Denisova et datée de —  50 000 à — 30 000 ans, âge déduit de la compréhension de l'histoire archéologique de la grotte. Cet ADN mitochondrial a été comparé à celui de cinquante-quatre… Lire la suite
15.  ÉLEVAGE

Écrit par : André FELLouis-Marie HOUDEBINE

Dans le chapitre "La sélection des animaux"  : … de les modifier génétiquement. Le génome des organismes supérieurs contient en grand nombre des *séquences répétées de petite taille, appelées mini et microsatellites, qui ne semblent pas avoir de fonction particulière. Elles sont en tout cas peu conservées d'une génération à l'autre. Elles sont donc héritables et polymorphes. C'est le cas… Lire la suite
16.  ENCODE PROJET

Écrit par : Gabriel GACHELIN

…  projet Encode est la suite du programme Génome humain lancé en 1989. Le but de ce dernier était de *déterminer la séquence complète de l'ADN du génome humain, terminée en avril 2003, publiée en 2004. À partir de là, l'exploitation de cette séquence à 3 milliards de dollars à l'époque (moins de 1 000 désormais) s'est orientée dans plusieurs… Lire la suite
17.  GÉNÉTIQUE

Écrit par : Axel KAHNPhilippe L'HÉRITIERMarguerite PICARD

Dans le chapitre "Détermination de la séquence nucléotidique de l'ADN"  : … *Il est extrêmement aisé de déterminer l'enchaînement des nucléotides constituant un brin d'ADN. Deux techniques – dont les descriptions valurent le prix Nobel à leurs auteurs – sont couramment utilisées. La méthode de Maxam et Gilbert fait appel à des réactions chimiques clivant l'ADN au niveau de bases particulières. La méthode de Sanger est quant… Lire la suite
18.  GÉNIE GÉNÉTIQUE

Écrit par : Louis-Marie HOUDEBINE

Dans le chapitre "Du gène à la protéine"  : … et son activité biologique. La succession des acides aminés est directement déterminée par la *succession des bases nucléotidiques (A, C, G, T, pour, respectivement, adénine, cytosine, guanine et thymine) qui sont les constituants essentiels de l'ADN. Le code de correspondance entre les bases de l'ADN et les acides aminés, appelé le code… Lire la suite
19.  GÉNOME NÉANDERTALIEN

Écrit par : Eva-Maria GEIGLThierry GRANGEBruno MAUREILLE

Dans le chapitre "La place des Néandertaliens dans l'évolution de l'Homme"  : … comparaison réalisée entre le génome du Néandertalien et d'Hommes actuels permet l'identification *des changements de séquences propres au génome humain qui précèdent la grande expansion de l'Homme moderne. La méthode de séquençage utilisée permet d'identifier les petits changements de séquence (correspondant à des différences de séquences d'un… Lire la suite
20.  GÉNOMIQUE - Théorie et applications

Écrit par : Louis-Marie HOUDEBINE

Dans le chapitre "La cartographie physique des génomes"  : … vecteurs de clonage dont le type dépend de la longueur des fragments d'ADN qui y sont insérés. Le *séquençage partiel des fragments permet de les ordonner. On dispose donc ainsi de l'ensemble d'un génome dans une série de vecteurs dont les séquences se recouvrent partiellement. Ces ensembles de vecteurs constituent des banques génomiques. À tout… Lire la suite
21.  GÉNOMIQUE - Le séquençage des génomes

Écrit par : Bertrand JORDAN

Dans le chapitre " Le décryptage des gènes"  : … d'une chaîne de nucléotides. L'information que portent ces molécules est en fait constituée par l*'ordre dans lequel se suivent les quatre types de bases puriques et pyrimidiques qu'elles renferment : T, A, G et C. Cet ordre définit la séquence qui détermine la structure des protéines construites à partir de cette formule, après transcription et… Lire la suite
22.  GÉNOMIQUE - La transgenèse

Écrit par : Pascale BRIAND

Dans le chapitre "L'étude de l'expression génique"  : … ARN messagers, molécules intermédiaires entre le gène et la protéine dont il a codé la synthèse. *Des séquences du gène, ou qui lui sont contiguës, sont impliquées dans cette régulation et constituent des cibles des facteurs de régulation. Déterminer quelles sont ces séquences, et en particulier celles qui règlent l'apparition de l'expression d'… Lire la suite
23.  GÉNOMIQUE - Génome artificiel

Écrit par : Gabriel GACHELIN

Dans le chapitre "La synthèse chimique de petits fragments d'ADN"  : … dans le cas le plus général. Les gènes, alignés le long de la molécule d'ADN des chromosomes, sont *des séquences issues de l'assemblage de quatre bases azotées : l'adénine (A), la cytosine (C), la guanine (G) et la thymine (T). L'ordre dans lequel ces bases (on parle plus volontiers de nucléotides) apparaissent le long de la séquence d'un gène… Lire la suite
24.  GILBERT WALTER (1932- )

Écrit par : Georges BRAM

…  contrôle génétique et dont Jacques Monod et François Jacob avaient pressenti l'existence en 1961. *Il travaille ensuite sur la détermination des séquences des bases de l'ADN et met au point une méthode élégante, complémentaire de celle de Sanger, et qui peut être utilisée tant avec les simples hélices qu'avec les doubles hélices. Walter Gilbert a… Lire la suite
25.  HÉRÉDITÉ

Écrit par : Charles BABINETLuisa DANDOLOJean GAYONSimone GILGENKRANTZ

Dans le chapitre "Établissement et maintien de l'empreinte"  : … l'allèle d'origine paternelle ne pourra s'exprimer qu'à partir de son allèle d'origine maternelle. *Des séquences spécifiques sont la cible de cette méthylation : elles sont en général localisées à proximité des gènes et sont appelées DMR (de l'anglais differentially methylated region). Leur méthylation est établie au cours de la… Lire la suite
26.  HISTOIRE DE LA CLADISTIQUE - (repères chronologiques)

Écrit par : Philippe JANVIERMichel LAURIN

…  de vue est désigné sous l'expression de cladistique transformée ou cladistique structuraliste. * Le biologiste américain J. Szelusniak et ses collaborateurs publient la première phylogénie moléculaire fondée sur une analyse de parcimonie (cladistique) manuelle des séquences d'un gène de la globine des Vertébrés. Le biologiste américain M. … Lire la suite
27.  HORMONES

Écrit par : Jacques DECOURTYves-Alain FONTAINERené LAFONT UniversalisJacques YOUNG

Dans le chapitre "Mécanisme d'action des hormones à récepteur nucléaire"  : … régulés. Le complexe hormone-récepteur activé se lie grâce aux doigts de zinc sur l'ADN sur des *séquences particulières situées dans le promoteur (partie régulatrice) des gènes cibles (fig. 5). Ces séquences sont désignées par le terme général d'« éléments de réponse aux hormones », le HRE. Il s'agit d'une famille de séquences nucléotidiques de… Lire la suite
28.  INFORMATION GÉNÉTIQUE

Écrit par : Henri ATLAN

Dans le chapitre "Codage génétique et biosynthèse des protéines"  : …  – que par l'ordre dans lequel sont assemblés les nucléotides (parfois plusieurs milliers) dans la *séquence qui la constitue. Si une molécule protéique peut être comparée à une phrase écrite à l'aide d'un alphabet comportant vingt lettres, une molécule d'ADN constituant un gène est semblable à une phrase écrite à l'aide d'un alphabet comportant… Lire la suite
29.  MUTATIONS

Écrit par : Philippe L'HÉRITIERGérard LEBLON Universalis

Dans le chapitre "Mutation ponctuelle"  : … Une* mutation ponctuelle est une altération d'une ou d'un petit nombre de paires nucléotides dans la séquence qui constitue une molécule d'ADN. Comme la spécificité d'un tel segment réside dans l'ordre séquentiel des paires de nucléotides qui peut se traduire notamment par la formation d'une protéine spécifique, on conçoit qu'une modification de… Lire la suite
30.  MYCOBACTÉRIES

Écrit par : Carlo COCITOGabriel GACHELIN Universalis

Dans le chapitre " Génomique comparative "  : … *La détermination de la séquence complète du génome de Mycobacterium leprae, qui a été publiée en février 2001 (S. T. Cole et al, « Massive Gene decay in the leprosy bacillus 2001 », in Nature, no 409, pp. 1007-1011, 2001), devrait permettre d'y voir un peu plus clair dans les propriétés de ce proche parent du bacille de… Lire la suite
31.  NUCLÉIQUES ACIDES

Écrit par : Jacques KRUHEthel MOUSTACCHIMichel PRIVAT DE GARILHEAlain SARASIN

Dans le chapitre "Conformation et masse moléculaires de l'ADN"  : … Cette structure qui réunit deux chaînes réciproquement complémentaires à l'égard de leurs *séquences nucléotidiques est compatible avec la réplication de la molécule d'ADN (cf. infra). On voit sur la figure 4b que les deux chaînes ont une polarité opposée : ce sont des chaînes antiparallèles ; de telle sorte que… Lire la suite
32.  PCR (polymerase chain reaction) ou AMPLIFICATION EN CHAÎNE PAR POLYMÉRASE

Écrit par : Véronique BARRIEL

Dans le chapitre "La PCR, un bricolage moléculaire"  : … est une double hélice dont chaque brin s'enroule autour de l'autre selon la complémentarité de la *séquence de leurs bases nucléiques : en face d'un A se trouve un T, en face d'un C se trouve un G. Il est possible de dissocier les brins par chauffage, et cela de manière réversible ; ils se réassocient correctement au cours du refroidissement. La… Lire la suite
33.  PHYLOGÉNOMIQUE

Écrit par : Gabriel GACHELIN

Dans le chapitre "De la phylogénie à la phylogénétique moléculaire"  : … (A pour adénine, T pour thymine, C pour cytosine et G pour guanine). Ces lettres sont alignées en *séquences qui dictent la structure des molécules pour lesquelles elles codent et qui, elles, participent à la construction des caractères. Le pari de ce type de phylogénie (ou phylogénétique), dite alors moléculaire, est d'utiliser comme caractères… Lire la suite
34.  POLARITÉ, biologie

Écrit par : Didier LAVERGNE

… *La polarité est inhérente au vivant. Elle en traduit le besoin d'ordre ou, plus exactement, elle révèle qu'il tend vers une ordonnance intrinsèque. Elle commence au niveau moléculaire : Pasteur a montré que toute la matière vivante est construite sur le modèle moléculaire lévogyre. Autrement dit, entre les deux situations possibles, lévogyrie ou… Lire la suite
35.  POLYMORPHISME, biologie

Écrit par : Philippe L'HÉRITIERMaxime LAMOTTEÉtienne PATINLluis QUINTANA-MURCI

Dans le chapitre "Polymorphisme et génétique"  : … n'ont aucune conséquence biologique. Ces polymorphismes peuvent être de plusieurs types. Ils *peuvent correspondre soit à un changement de séquence nucléotidique (par exemple, A devient G, C ou T), auquel cas on parle de SNP (single nucleotide polymorphism) ; soit à une variation en nombre de répétitions d'une séquence répétée de… Lire la suite
36.  PROGRAMME GÉNÉTIQUE

Écrit par : Corinne ABBADIE

Dans le chapitre "Le transfert d'information génétique au sein de la cellule"  : … aléatoire de ces quatre bases qui constitue le message génétique. On appelle gène toute *séquence nucléotidique de l'ADN codant soit une protéine soit un petit ARN qui participera à la biosynthèse de cette protéine. Plus précisément, le gène ne se limite pas strictement à la partie codante mais comporte aussi les séquences flanquantes… Lire la suite
37.  PROTÉINES

Écrit par : Yves BRIANDPhilippe BRIONRené LAFONTJean-Claude MEUNIERPierre VIGNAIS

…  l'ADN (acide désoxyribonucléique) des chromosomes. Cet ADN est lui-même constitué d'un assemblage *séquentiellement agencé d'unités appelées nucléotides contenant 4 bases azotées différentes. L'ADN sera tout d'abord transcrit en ARN messager et ce dernier sera « lu » dans le cytoplasme d'une cellule au cours d'un processus de « traduction » qui… Lire la suite
38.  PROTÉINES INFORMATIONNELLES

Écrit par : Patrick FORTERRE

… *Depuis le premier séquençage complet du génome d'un organisme cellulaire (la bactérie Haemophilus influenzae), en 1996, les patrimoines génétiques de plus de cinquante micro-organismes, de trois animaux et d'une plante ont été décryptés. La comparaison de tous ces génomes a confirmé la division du monde vivant en trois domaines (proposée… Lire la suite
39.  RÉGULATIONS BIOCHIMIQUES

Écrit par : Jacques KRUH

…  celui-ci prend naissance une molécule d'acide ribonucléique ou ARN messager, qui copie la séquence *nucléotidique du gène correspondant, selon un mécanisme qualifié de transcription. L'ARN messager est donc porteur d'une information génétique calquée sur celle de l'ADN ; elle est constituée d'une suite de triplets nucléotidiques appelés… Lire la suite
40.  SANGER FREDERICK (1918-2013)

Écrit par : Georges BRAM Universalis

… de Cambridge, Sanger va développer ses recherches pour mettre au point une méthode de détermination *des séquences des bases nucléotidiques dans l’ADN. Il met au point des méthodes plus simples que les méthodes de clivage chimique de l’ADN en fragments qui prévalaient jusque-là, lui permettant de travailler plus rapidement et sur de plus petites… Lire la suite
41.  SÉQUENÇAGE D'ADN

Écrit par : Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS

  *Dès son entrée à l'université de Cambridge en 1940, le Britannique Frederick Sanger se passionne pour la structure des macromolécules. En 1955, il publie la première séquence protéique, celle de l'insuline, qui lui vaut le prix Nobel de chimie en 1958. Il se tourne ensuite vers le séquençage des acides nucléiques, en… Lire la suite
42.  SÉQUENÇAGE D'ADN - (repères chronologiques)

Écrit par : Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS

… * Séquençage, par Frederick Sanger, du premier génome, celui d'un virus bactérien (phi X174). Attribution du prix Nobel de chimie à Frederick Sanger et Walter Gilbert, inventeurs respectifs de deux techniques de séquençage. Seule celle de Sanger est toujours utilisée. Séquençage du génome du virus d'immunodéficience humaine (en fait un rétrovirus),… Lire la suite
43.  SÉQUENÇAGE DU GÉNOME HUMAIN

Écrit par : Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS

  Le *12 février 2001, les revues scientifiques Nature et Science publient la séquence quasi complète des 3 milliards de bases du génome humain. Cette double publication conclut par un ex aequo la compétition entre un consortium international de laboratoires publics, qui a entamé ses travaux au début des… Lire la suite
44.  VARIATION, biologie

Écrit par : Jean GÉNERMONT

Dans le chapitre "Analyse des séquences nucléotidiques"  : … *Les endonucléases de restriction sont des enzymes qui coupent la chaîne d'ADN en des sites occupés par une séquence précise de quelques (par exemple 6) nucléotides. Traiter par une telle enzyme le matériel génétique d'un individu fournit un ensemble de fragments de longueurs variables (les distances séparant deux sites de coupure… Lire la suite
45.  VIROLOGIE

Écrit par : Sophie ALAINMichel BARMEFrançois DENISLéon HIRTH

Dans le chapitre "Mise en évidence des virus"  : … détection et ne sont positives que lorsque le virus est présent en abondance dans les prélèvements. *La recherche de séquences génomiques spécifiques de telle ou telle espèce virale est possible avec les techniques d'hybridation à l'aide de sondes chaudes ou froides qui sont relativement peu sensibles et utilisées quand les charges virales sont… Lire la suite
46.  VIRUS

Écrit par : Vincent BARGOIN

Dans le chapitre "Structure des virus"  : … chez l'animal, comporte ainsi 5 kilobases, contre 100 kilobases pour les virus du groupe herpès. *Aux extrémités des génomes viraux figurent des séquences particulières. Pour les rétrovirus, il s'agit de séquences dites LTR (long terminal repeat), qui ne font pas partie du génome viral présent dans le virion, mais qui sont ajoutées… Lire la suite

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