3. Reproduction sexuée des polyploïdes
Le déroulement de la méiose est toujours plus ou moins perturbé chez les polyploïdes. Lorsque plus de deux éléments homologues sont présents, la tendance des chromosomes à s'apparier par deux, par rapprochement de leurs régions homologues, et à former des chiasmas conduit en effet, à la métaphase de la première division, à des dispositions variées. Les quatre chromosomes homologues d'un tétraploïde, par exemple, peuvent soit rester associés en un seul groupe de quatre (tétravalent), soit former deux bivalents, soit, plus rarement un trivalent et un monovalent. À l'anaphase, les structures polyvalentes se dissocient de manière variée, d'où toute une gamme possible de garnitures chromosomiques pour les gamètes.
Ce comportement de chromosomes a une répercussion directe sur la fertilité et la stabilité génétique des polyploïdes. Les triploïdes, et d'une manière générale les polyploïdes impairs, sont toujours fortement stériles. Chacun des groupes de trois chromosomes se dissocie en effet normalement en deux et un, d'où la production de gamètes à garniture presque toujours aneuploïde, avec un effectif de chromosomes intermédiaire entre le nombre haploïde et le nombre diploïde. Les polyploïdes pairs sont, au contraire, généralement assez fertiles. Chez les tétraploïdes, par exemple, les groupes de quatre se dissocient fréquemment en deux et deux, d'où des gamètes diploïdes et des zygotes tétraploïdes comme leurs parents.
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