PHYLOGÉNIE ou PHYLOGENÈSE

Ce sujet est traité dans les articles suivants :

1.  PHYLOGÉNIE ANIMALE

Écrit par : Michaël MANUEL

L'évolution animale a été l'objet, depuis le xix^e siècle, d'une somme considérable de travaux et de discussions, et demeure aujourd'hui un champ d'investigation très fertile. En effet, pour les biologistes, comprendre l'évolution animale est capital afin de disposer d'une classification qui reflète le mieux possible les… Lire la suite

2.  ACTINOPTÉRYGIENS

Écrit par : Philippe JANVIER

Dans le chapitre "Relations de parenté entre les groupes majeurs actuels"  : … L'*analyse de la répartition des caractères morphologiques et physiologiques des actinoptérygiens, ainsi que la comparaison des séquences moléculaires de plusieurs gènes de l'ADN et de l'ARN, ont permis d'obtenir une phylogénie relativement consensuelle pour l'ensemble du groupe. Mis à part quelques résultats discordants issus des données de l'ADN… Lire la suite

3.  ALGUES

Écrit par : Jean FELDMANN

Dans le chapitre "Classification et phylogénie"  : … *Les cinq grands phylums d'Algues se distinguent par des caractères d'ordre surtout cytologique et biochimique. Bien qu'il s'agisse d'organismes certainement très anciens (précambriens), les documents paléontologiques concernant les Algues sont relativement peu nombreux à l'exception des formes calcifiées (Corallinacées, Dasycladales, etc.) dont la… Lire la suite

4.  AMPHIBIENS ou BATRACIENS

Écrit par : Pierre CLAIRAMBAULT, Philippe JANVIER, Jean-Claude RAGE

Dans le chapitre "Évolution"  : … On* considère désormais que, des trois groupes actuels d'Amphibiens, ce sont les Urodèles et les Anoures qui sont les plus étroitement apparentés et sont regroupés sous le nom de Batrachia, tandis que les Gymnophiones constituent leur groupe frère. À l'état fossile, on connaît peu de lissamphibiens antérieurs au Crétacé, le plus ancien étant un… Lire la suite

5.  ARCHAEOPTERYX

Écrit par : Eric BUFFETAUT

…  incontestable connu à ce jour ; il est considéré comme un des meilleurs arguments en faveur de *l'origine dinosaurienne des oiseaux. Depuis 1995, la découverte de divers dinosaures à plumes, dont certains étaient capables de planer, dans le Crétacé inférieur (environ 120 millions d'années) de Chine vient confirmer cette origine. Venant deux ans… Lire la suite

6.  BACTÉRIES

Écrit par : Jean-Michel ALONSO, Jacques BEJOT, Patrick FORTERRE

Dans le chapitre "Classification des bactéries"  : … Gram + et Gram —, les Cyanobactéries (anciennement algues bleues) étant souvent classées à part. *Cette classification rudimentaire a été bouleversée par l'application des méthodes de la phylogénie moléculaire : essentiellement la comparaison de leurs ARN 16S (ARN présents dans la petite sous-unité du risobome). La classification internationale… Lire la suite

7.  CARNIVORES

Écrit par : Robert MANARANCHE, Géraldine VÉRON

Dans le chapitre "Origine et évolution"  : … À* la fin du Crétacé, il y a quelque 65 millions d'années, les dinosaures ainsi qu'une grande partie de la faune disparaissaient, laissant place aux mammifères alors de petite taille, souvent insectivores ou omnivores. L'absence de carnassiers spécialisés crée une situation écologique qui permet aux mammifères d'évoluer vers ce régime alimentaire.… Lire la suite

8.  CHONDRICHTHYENS

Écrit par : Philippe JANVIER

Dans le chapitre "Les grands groupes de chondrichthyens actuels et leurs relations de parenté"  : … Une révision récente des données anatomiques qui étayaient cette hypothèse ainsi que des données de *la phylogénie moléculaire basées sur plusieurs gènes confirment clairement le monophylétisme des requins actuels (ou pleurotrémates) et montrent que raies et requins actuels sont des groupes frères (fig. 2). Cependant, même si la répartition des… Lire la suite

9.  CLASSIFICATION DU VIVANT

Écrit par : Pascal DURIS, Pascal TASSY

Dans le chapitre " Classifications et évolution"  : … Dès* la publication des premiers textes fondateurs de la théorie de l'évolution, la dualité classification et phylogénie est apparente. Lamarck en 1809 distingue, d'une part, la classification et, d'autre part, la « distribution », c'est-à-dire l'ordre que la nature a suivi pour produire les organismes, concept que l'on peut assimiler à la… Lire la suite

10.  CRUSTACÉS

Écrit par : Jacques FOREST

Dans le chapitre "Paléontologie et phylogénie"  : … chez les conchostracés, le genre Estheria est connu depuis le Dévonien jusqu'aujourd'hui. *Les fossiles, si nombreux soient-ils, ne sont que d'une aide limitée dans la recherche des rapports phylétiques chez les crustacés. En effet, beaucoup de ceux-ci, à cause de leur petite taille et de la finesse de leurs téguments, ne se fossilisent… Lire la suite

11.  CYCLOSTOMES

Écrit par : Pierre CLAIRAMBAULT, Philippe JANVIER

Dans le chapitre " Phylogénie"  : … On* connaît des lamproies fossiles dès le Dévonien supérieur (Priscomyzon), il y a 360 millions d'années, et il est probable que les euphaneripidés, connu du Silurien au Dévonien (420-370 millions d'années), soient très proche de ce groupe. On considérait autrefois (cf. ostracodermes) que les lamproies s'enracinent dans le groupe… Lire la suite

12.  DÉVELOPPEMENT (biologie) - Le développement végétal

Écrit par : Georges DUCREUX, Hervé LE GUYADER, Jean-Claude ROLAND

Dans le chapitre "Les phases et les modalités du développement végétal"  : … encore chez les Angiospermes mais reste rarement exprimé dans le cadre du développement normal. *Les problèmes ontogénétiques ne sont peut-être pas encore clairement compris sur le plan phylogénétique. Toutes les structures morphologiques végétatives et reproductrices, y compris l'ovule, avaient été réalisées chez les Ptéridophytes dès le… Lire la suite

13.  DÉVELOPPEMENT (biologie) - Le développement humain

Écrit par : Jacques-Michel ROBERT

Dans le chapitre "Le programme de l'espèce"  : … son développement depuis l'œuf jusqu'à l'état achevé) est une courte récapitulation de la *phylogenèse (c'est-à-dire de l'évolution). « L'ontogenèse, écrit H. Laborit, reproduit en quelques heures, jours ou semaines selon les espèces, la longue histoire de la vie étalée sur des millions d'années. Mémoire, stockage des innombrables… Lire la suite

14.  DINOSAURES

Écrit par : Eric BUFFETAUT

Dans le chapitre " Histoire évolutive des dinosaures"  : … *Les dinosaures apparaissent vers le début du Trias supérieur, il y a environ 225 Ma (fig. 3). Leur origine est à rechercher parmi de petits archosaures légèrement bâtis, qui montrent les prémices des adaptations locomotrices des dinosaures, tels que Marasuchus découvert dans le Trias moyen d'Argentine. Les premiers dinosaures sont… Lire la suite

15.  ESPÈCE, biologie

Écrit par : Philippe LHERMINIER

Dans le chapitre "Trois relations naturelles, trois critères de diagnostic"  : … à d'autres relations plus biologiques. La reproduction conforme est le deuxième critère. L'*espèce est définie comme une lignée monophylétique, c'est-à-dire un ensemble d'individus ayant une origine ancestrale commune, qui peut être un parent fondateur, un couple unique ou une espèce isolée se perpétuant sur le modèle du clone. Rarement… Lire la suite

16.  ÉVOLUTION

Écrit par : Armand de RICQLÈS, Stéphane SCHMITT

Dans le chapitre "Darwin et la sélection naturelle "  : … c'est-à-dire du résultat de l'évolution. C'est ce qu'Ernst Haeckel (1834-1919) nommera plus tard la *phylogénie du vivant et exprimera par la célèbre métaphore de l'arbre (1866) si souvent exploitée depuis lors (fig. 1). Ainsi, Darwin est à l'origine de la notion de « canevas évolutif », ce que l'on appelle actuellement le « pattern … Lire la suite

17.  FLEUR

Écrit par : Louis EMBERGER, Michel FAVRE-DUCHARTRE, Georges MANGENOT, Paul ROLLIN

Dans le chapitre "Valeur morphologique et phylogenèse"  : … Cryptogames vasculaires paléozoïques, et la fleur des Angiospermes n'est que l'étape actuelle de la *phylogenèse que cet organe a parcourue au cours des temps. Ces découvertes ont rénové la morphologie florale, qui, de statique, est devenue dynamique. Elles ont montré que la fleur a la valeur morphologique d'un système d'axes foliarisés, très… Lire la suite

18.  FOSSILES

Écrit par : Raymond FURON, Armand de RICQLÈS

Dans le chapitre "Reliques et relictes"  : … distincts les uns des autres dans la nature actuelle, d'où leur grand intérêt pour l'étude de la *phylogenèse. Latimeria, seul Crossoptérygien actuel, est un bon exemple de relique : il représente le groupe faisant le passage des Poissons osseux aux Tétrapodes. L'ornithorynque est un autre exemple célèbre : représentant (avec l'échidné)… Lire la suite

19.  GNATHOSTOMES

Écrit par : Philippe JANVIER

Dans le chapitre "Diversité et phylogénie des gnathostomes actuels"  : … nucléaires et mitochondriaux, font l'objet d'un relatif consensus. La figure 2 montre, à gauche, *l'arbre phylogénétique des gnathostomes le plus largement admis, prenant en considération les données morpho-anatomiques. Certaines ramifications de l'arbre de droite reflètent les ambiguïtés introduites par les données moléculaires qui parfois… Lire la suite

20.  HISTOIRE DE LA CLADISTIQUE - (repères chronologiques)

Écrit par : Philippe JANVIER, Michel LAURIN

… * L'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il propose une nouvelle méthode de reconstruction des relations de parenté entre les espèces fondée exclusivement sur les états apomorphes (évolués ou particuliers) des caractères (surtout morphologiques),… Lire la suite

21.  HOMINIDÉS

Écrit par : Brigitte SENUT

Dans le chapitre "La divergence Homme-grands singes africains"  : … cours du temps se faisaient à vitesse constante (la fameuse notion d'« horloge moléculaire ») : la *date de divergence entre les grands singes africains et l'Homme avait donc été estimée à 2 millions d'années (Ma) environ pour certains et jusqu'à 4 Ma pour d'autres. Cette horloge ne pouvait pas fonctionner à un rythme homogène pour des raisons… Lire la suite

22.  INSECTES

Écrit par : René LAFONT, Jean-Yves TOULLEC

Dans le chapitre "Les insectes, un succès de l’évolution"  : … de leur vie. L'aile est donc une particularité d'une importance capitale dans l'étude de la *phylogénie des insectes (fig. 2) : elle est représentative, de par sa morphologie, du degré d'évolution de l'espèce (mobilité de l'aile et réduction de la nervation). Les espèces primitives sont assez proches des espèces fossiles, c'est-à-dire qu'… Lire la suite

23.  INSTINCT

Écrit par : Georges THINÈS

Dans le chapitre "Les stéréotypes comportementaux"  : … instinctive et, en même temps, son caractère génétiquement déterminé et son insertion dans la *phylogenèse. Mais leur ambition n'allait pas au-delà de l'utilisation taxinomique des comportements. Quant à Craig, il avait démontré le caractère téléologique de l'action instinctive, la phase préparatoire à la décharge étant entièrement dirigée… Lire la suite

24.  LORENZ KONRAD (1903-1989)

Écrit par : Raymond CAMPAN

Dans le chapitre "La polémique de l'inné et de l'acquis"  : … vom Apriorischen im Lichte gegenwärtiger Biologie »), la même année que sa fameuse étude sur la *phylogenèse des Anatidés (« Vergleichende Bewegungstudien an Anatiden »). Il montre dans cette dernière, comme l'avait fait Heinroth avant lui, que l'on peut réaliser une taxinomie en utilisant les traits de comportement plutôt que des caractères… Lire la suite

25.  MAMMIFÈRES

Écrit par : Pierre CLAIRAMBAULT, Robert MANARANCHE, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ, Michel TRANIER

Dans le chapitre " L'origine des Thériens"  : … Connu *par quelques dents depuis la fin du Trias, le grand ensemble des Pantothériens commence à prendre de l'importance au milieu du Jurassique avec des formes comme Amphitherium. Chez cet animal, l'articulation mandibulaire est purement mammalienne. Les dents sont diversifiées en incisives, canines, prémolaires et molaires ; ces dernières… Lire la suite

26.  MUTATIONNISME

Écrit par : Cédric GRIMOULT

Dans le chapitre "Le mutationnisme et l'évolution"  : … la variation lente et graduelle des espèces fossiles suivie à travers les terrains géologiques. *À cette époque, de nombreux paléontologues insistent d'ailleurs sur l'aspect heurté du rythme de l'évolution des lignées, inaugurant ainsi une conception saltationniste (par « saut ») du changement des espèces, une conception qui paraît s'accorder… Lire la suite

27.  NERVEUX (SYSTÈME) - Neurogenèse et évolution

Écrit par : Paul LAGET

…  aborder l'exposition, quelques remarques générales d'introduction sont nécessaires concernant, d'une part, la *phylogenèse et, d'autre part, le rôle de ce système. Dans les traités de zoologie, les différents embranchements du règne animal sont étudiés suivant un plan apparemment logique qui conduit le lecteur de l'organisme le plus simple au plus… Lire la suite

28.  OISEAUX

Écrit par : Eric BUFFETAUT, Michel CUISIN

…  comme un des meilleurs exemples d'une forme intermédiaire entre deux grands groupes de vertébrés. *Certains caractères ostéologiques de ce très ancien oiseau (mâchoires pourvues de dents, doigts des ailes encore séparés et munis de griffes, longue queue formée de nombreuses vertèbres...) sont autant d'indices d'une origine reptilienne des oiseaux… Lire la suite

29.  OSTRACODERMES

Écrit par : Philippe JANVIER

Dans le chapitre "Phylogénie : relations avec les cyclostomes et les gnathostomes"  : … On* regroupe classiquement les ostéostracés, les anaspides et les lamproies en un taxon monophylétique, les céphalaspidomorphes, caractérisé par la position dorsale de l'orifice naso-hypophysaire, sans communication avec la cavité branchiale (fig. 5). Ce regroupement est toutefois infirmé par au moins cinq caractères connus uniquement chez les… Lire la suite

30.  OURS BRUN EN EUROPE

Écrit par : Jean-Pierre RAFFIN

Dans le chapitre "En Europe depuis longtemps"  : … *L'ours brun provient d'une lignée de mammifères vieille de 40 à 50 millions d'années dont sont issus la plupart des mammifères carnivores, en particulier les ursidés. Les travaux sur l'ADN mitochondrial de cellules de la base de poils d'ours, menés en 1992 par Pierre Taberlet et Jean Bouvet viennent conforter les données paléontologiques. L'ours… Lire la suite

31.  PALÉONTOLOGIE

Écrit par : Édouard BOUREAU, Patrick DE WEVER, Jean PIVETEAU

Dans le chapitre "Les classifications « verticales »"  : … *Cuvier et ses prédécesseurs proposaient dans leurs systèmes de la nature de présenter le tableau des relations logiques qui unissent les espèces entre elles. Mais, peu à peu, des doctrines nouvelles se font jour, qui tendent à voir non plus dans l'ordre immuable du monde, mais dans l'histoire et la genèse des êtres, l'objet suprême des sciences de… Lire la suite

32.  PÉRISSODACTYLES

Écrit par : Robert MANARANCHE

Dans le chapitre "Évolution"  : … L'*ancêtre des Equidae actuels était représenté à l'Éocène par le genre Hyracotherium, qui comporte plusieurs espèces, dont la taille moyenne était celle d'un lévrier. Ces animaux possédaient des caractères archaïques rappelant les Condylarthres, dont ils sont issus, à côté de traits évolutifs annonçant leur descendance. Le nombre… Lire la suite

33.  PHYLOGÉNOMIQUE

Écrit par : Gabriel GACHELIN

…  d'évolution épissée aux données de la paléontologie a donné naissance à une nouvelle discipline, *la phylogénie. L'arbre phylogénique qu'Ernst Haeckel (1834-1919) proposa en 1866 est une représentation qui a marqué notre culture biologique et, d'une certaine manière, a déterminé notre façon de penser l'évolution des espèces : un seul… Lire la suite

34.  POISSONS

Écrit par : Yves FRANÇOIS, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ

…  au même titre et sur le même plan que les Amphibiens, les Reptiles, les Oiseaux et les Mammifères. *Mais, depuis que les progrès de la paléontologie ont montré le caractère hétérogène de cet ensemble, beaucoup de zoologistes renoncent à donner au terme de « Poissons » un sens scientifique. La classe des Poissons est alors remplacée par plusieurs… Lire la suite

35.  PRIMATES FOSSILES

Écrit par : Denis GERAADS

Dans le chapitre "Hominidae"  : … *Naguère, on pensait que les Grands Singes, Orang-outan, Gorille et Chimpanzé, formaient un ensemble naturel, appelé Pongidés (d'après Pongo, l'Orang-outan), séparé de la lignée humaine depuis une époque variant suivant les auteurs entre le Miocène supérieur (10 Ma) et l'Éocène (50 Ma). Les données de la biologie moléculaire sont venues… Lire la suite

36.  PROBOSCIDIENS

Écrit par : Robert MANARANCHE, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ, Pascal TASSY

Dans le chapitre "Aperçu phylogénétique"  : … à la fin du Miocène), les Proboscidiens et les Siréniens constituent le groupe des Tethytheria. Le *proboscidien le plus primitif et le plus ancien connu est Phosphatherium, qui a été découvert en 1996 dans l'Éocène basal (55 millions d'années) du Maroc. Ce petit animal, de la taille d'un renard actuel, est dépourvu de trompe et de… Lire la suite

37.  REPTILES FOSSILES

Écrit par : Armand de RICQLÈS, Pierre-Antoine SAINT-ANDRÉ

Dans le chapitre "La classe des Reptiles est-elle un groupe naturel ?"  : … Où commencent les* Reptiles ? Leur origine est-elle unique ou multiple ? Les caractères qui permettent de définir les Reptiles actuels sont-ils applicables aux formes fossiles ? Où finissent les Reptiles par rapport aux Mammifères ? Ces questions, qui sont celles de l'origine, de l'homogénéité, des limites de la classe vers le bas et vers le haut,… Lire la suite

38.  RIBOSOMES

Écrit par : Carlo COCITO

Dans le chapitre "L'appareil de traduction des procaryotes"  : … chaque ARNr possède, au sein de la particule ribosomale, une structure tridimensionnelle propre. *La comparaison des structures des ARN 5 S issus de différentes bactéries a permis de préciser la position taxonomique d'organismes nouvellement isolés et de tracer l'évolution des espèces étudiées. L'analyse par ordinateur des images des sous-unités… Lire la suite

39.  SARCOPTÉRYGIENS

Écrit par : Philippe JANVIER

Dans le chapitre "Phylogénie"  : … Les* relations de parenté entre les divers groupes de sarcoptérygiens actuels et fossiles sont toujours l'objet d'importantes recherches, car elles conditionnent l'étude de l'émergence des tétrapodes et de l'adaptation des vertébrés à la vie en milieu terrestre. Au début du xix^e siècle, les premières hypothèses scientifiques sur… Lire la suite

40.  STÉGOCÉPHALES

Écrit par : Jean-Sébastien STEYER

Dans le chapitre "Caractères et évolution"  : …  Ma environ), et réparties partout, d'Arctique en Antarctique et d'Amérique du Nord en Australie. *L'histoire évolutive du groupe, longue de quelque 270 millions d'années (presque deux fois celle des dinosaures – non aviens –) commence notamment avec Acanthostega et Ichthyostega (fig. 2 et 3), qui sont parmi les tétrapodes les… Lire la suite

41.  CLADISTIQUE ou SYSTÉMATIQUE PHYLOGÉNÉTIQUE

Écrit par : Philippe JANVIER

  *En 1950, l'entomologiste allemand Willi Hennig (1913-1976) publie son Grundzüge einer Theorie der Phylogenetischen Systematik, ouvrage dans lequel il expose sa méthode d'utilisation des caractères morphologiques afin d'élucider les relations de parenté entre les espèces ou les groupes d'espèces (taxons). Il… Lire la suite

42.  TÉTRAPODES

Écrit par : Philippe JANVIER

…  internes, ou choanes. Ils sont donc regroupés avec eux dans l'ensemble des tétrapodomorphes. *C'est au sein des tétrapodomorphes que s'est effectuée la transition évolutive entre poissons et tétrapodes. Les poissons fossiles les plus proches des tétrapodes sont les elpistostégaliens (Panderichthys, Tiktaalik), du Dévonien… Lire la suite

43.  VERTÈBRES ET RACHIS

Écrit par : Yves FRANÇOIS, Claude GILLOT

Dans le chapitre "Organogenèse vertébrale et phylogenèse"  : … , ostracodermes). La plupart des Tétrapodes ont une vertèbre de type assez différent.* Les variations des structures vertébrales au cours de l'évolution ont une grande importance pour la classification de ces Vertébrés. L'étude des modifications de la vertèbre au cours de l'évolution peut prendre comme point de départ le plus ancien… Lire la suite