6. Trichomycètes
Les Trichomycètes sont des organismes filamenteux simples ou ramifiés, cœnocytiques ou discrètement septés dans leur phase végétative, à paroi cellulosique ; ils se fixent par un pavillon adhésif à la paroi de l'intestin postérieur ou à la cuticule externe d'arthropodes (adultes et larves de myriapodes, crustacés, insectes), avec lesquels ils vivent en commensalisme ; on les rencontre aussi bien dans le sol que dans la mer, les eaux plus ou moins saumâtres, les eaux douces. Leurs modes de reproduction sont variés : les Amoebidiales, Eccrinales et Asellariales présentent toutes un stade agamique à sporangiospores plus ou moins typiques auxquelles s'ajoutent des endospores résistantes (Eccrinales) ou des arthrospores (Asellariales). Les Amoebidiales produisent aussi des myxamibes dont on a pu penser que, chez certaines espèces, elles fonctionnent comme gamètes ; cette planogamie les apparenterait aux Myxomycètes. Les Harpellales se reproduisent végétativement par des conidies latérales pourvues de prolongements filamenteux (trichospores) ; la plupart des espèces ont en outre une phase sexuée, homothallique ou hétérothallique, produisant des zygospores par un mécanisme rappelant les Entomophthorales. La classe des Trichomycètes se présente ainsi comme un groupement écologique d'affinités incertaines, dont l'unité systématique reste douteuse.
La notion de règne végétal subdivisé en Plantes, Algues, Champignons, etc., est devenue caduque au profit de plusieurs règnes mieux circonscrits. Dans ce cadre, le groupe hétérogène des Phycomycètes, démantelé, a disparu. Les Chytridiomycètes et les Zygomycètes, à parois chitineuses comme celles des Eumycètes (Ascomycètes et Basidiomycètes), sont réunis avec eux dans le règne des Eumycota (les « vrais Champignons »). Les Oomycètes et les Hyphochytridiomycètes, à parois cellulosiques comme celles des Plantes et des Algues sont regroupés avec certaines Algues qui possèdent des zoospores de même type dans le règne des Chromista. Le petit ensemble marginal et délaissé des Trichomycètes classiquement rapproché, faute de mieux, des Champignons et alors situé dans le groupe des Phycomycètes, n'a sa place dans aucun de ces règnes et reste de position incertaine. Enfin, les Myxomycètes, transférés alternativement et réciproquement du règne végétal (Champignons) au règne animal (Protistes), sont maintenant rattachés au règne des Protozoa.
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