4. Les polémiques
Jean Moulin est la cible périodique de calomnies. Celles-ci se sont alimentées des écrits d'Henri Frenay, chef du mouvement Combat, qui prétendit, dès 1950, que Jean Moulin avait « favorisé » les communistes dans la Résistance. En 1973, il reprit cette thèse dans ses souvenirs (La nuit finira), puis la systématisa en 1977, dans un essai polémique, L'Énigme Jean Moulin.
Discréditer le symbole de la Résistance (le général de Gaulle fit entrer Moulin en 1964 au Panthéon où François Mitterrand lui rendit hommage lors de sa prise de fonction en 1981), c'est discréditer, d'une part, de Gaulle, et, d'autre part, la Résistance et les valeurs de combat, de sacrifice et de liberté qu'ils incarnent.
La répartition de l'argent et des armes entre les composantes de la Résistance, le choix de ses collaborateurs, la composition des institutions qu'il créa, les directives militaires et politiques qu'il appliqua prouvent, à la lecture des archives, que Jean Moulin n'a pas favorisé les communistes et s'est même appliqué à les contenir, afin d'assurer l'autorité exclusive du général de Gaulle sur l'ensemble des résistances. Frenay, d'ailleurs, n'a jamais prétendu démontrer le crypto-communisme de Jean Moulin, mais seulement exprimer son « intime conviction ». Toutefois, les glissements successifs de son raisonnement, l'utilisation de moins en moins nuancée qui en fut faite et l'autorité morale dont il jouissait en tant qu'ancien chef de la Résistance ont non seulement donné du poids à son soupçon, mais ont fourni des arguments à ses suiveurs. Ceux-ci s'abritent derrière lui pour calomnier Jean Moulin, jusqu'à en faire un espion soviétique voire, à l'opposé, un agent américain.
La métamorphose des résistances en la Résistance, que Jean Moulin a soumise à l'autorité du général de Gaulle, évita pourtant à la France, lors de la Libération, l'humiliation d'une occupation alliée et la tragédie d'une guerre civile qui ensanglanta d'autres pays d'Europe occupés par les Allemands.
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