Fils d'un médecin, Jean-Baptiste Baudin fait ses études de médecine à Lyon, puis à Paris au Val-de-Grâce. En 1832, il est nommé chirurgien sous-aide major de l'hôpital militaire de Toulon ; il passe sa thèse à Paris en 1837, puis, en qualité de chirurgien militaire, il sert de 1837 à 1839 en Algérie où il connaît Eugène Cavaignac. Il quitte l'armée et se fixe à Paris où il devient le médecin des pauvres ; en contact avec le milieu ouvrier, il connaît aussi Michelet, Quinet, Michel de Bourges, Lamennais. Républicain de très bonne heure, touché par les idées saint-simoniennes et fouriéristes, franc-maçon, il se lance avec enthousiasme dans la politique active après la révolution de février 1848 et préside notamment le club de l'Avenir. Le 25 mai 1848, il est arrêté comme complice après la journée du 15 mai. Il refuse ensuite le ministère de l'Instruction publique offert par Cavaignac.
Élu représentant de l'Ain à la Législative, il siège à la Montagne, s'intéresse aux questions d'éducation, s'oppose à la droite et au prince-président Louis-Napoléon Bonaparte et se prononce pour l'action légale le 13 juin 1849 ; le 30 septembre 1850, il prend part à la conférence réunie à Mâco […]
