3. Organisation administrative
Les activités de l'Institut Pasteur reposent sur un budget de l'ordre de 220 millions d'euros en 2006, à peu près répartis en trois tiers : un tiers fourni par l'État, un tiers tiré de ressources propres et un tiers provenant du mécénat. La part de contrats européens dans le budget de fonctionnement va croissant.
La recherche est facilitée par une administration fortement structurée. Quelles que soient les variations introduites par chaque directeur général et président du conseil d'administration, l'organisation de la direction de l'Institut Pasteur reste essentiellement constante. Elle comprend une structure de direction avec un directeur général en place pour six ans, assisté d'un directeur scientifique et d'un directeur administratif et financier. Ceux-ci sont secondés par un nombre variable de sous-directeurs et de directeurs délégués (enseignement, juridique, D.R.H., communication, etc.), eux-mêmes responsables de plusieurs services administratifs et techniques. Un conseil scientifique a pour mission d'aider la direction à l'évaluation des groupes de recherche et des personnes et à l'appréciation des programmes de recherche. Un groupe d'observateurs externes de haut niveau a été introduit en 2001 pour apprécier la validité des choix faits par la direction.
Les activités de direction stricto sensu sont contrôlées par un conseil d'administration de 20 membres, dont 16 élus (pasteuriens et non-pasteuriens) et 4 membres de droit (représentants ministériels de la recherche, université, C.N.R.S., I.N.S.E.R.M.), qui se réunit quatre fois par an. Une particularité de l'Institut Pasteur est l'existence d'une « assemblée des cent », pour partie élue par les pasteuriens, pour partie nommée, dont la fonction est l'approbation ou le rejet du rapport annuel du conseil d'administration et l'élection des membres élus du conseil d'administration, lequel élit le directeur général.
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