2. Organisation du complexe HLA
La figure montre que le complexe HLA occupe chez l'homme quatre mégabases sur le chromosome 6p. Les gènes correspondant aux molécules de classe I occupent une mégabase dans la région la plus proche du télomère. Les molécules de classe II sont codées par des gènes qui s'étalent sur deux mégabases dans la région centromérique. Entre ces deux domaines se trouve une zone que l'on a appelée région de classe III, dont les gènes codent pour des fonctions diverses. L'organisation des gènes de classes I et II correspond à la structure des protéines correspondantes.
• Classes I et II
Chaque molécule de classe I d'un poids moléculaire de 46 kilodaltons est constituée à sa partie NH2 terminale d'une chaîne avec trois sous-régions extracellulaires, appelées domaines comportant chacun environ quatre-vingt-dix acides aminés (chaque domaine étant, codé par un exon) et présentant de fortes homologies avec les parties constantes des immunoglobulines. Une région transmembranaire (codée par un exon), et une région cytoplasmique (codée par trois exons) aboutissant à l'extrémité COOH terminale complètent la molécule HLA de classe I. Les molécules de classe I sont associées à une petite chaîne de 12 kilodaltons, constante, la β2-microglobuline. Les domaines α1 et α2 (codés respectivement par les exons 2 et 3) sont liés aux peptides antigéniques et forment la région dite PBR, c'est-à-dire peptide binding region, tandis que α3 se lie à une molécule de surface, CD8, du lymphocyte cytotoxique Tc.
Les molécules de classe II sont constituées chacune de deux chaînes : une chaîne α et une chaîne β, formées elles-mêmes de deux domaines α1, α2 et β1 et β2 (fig ; 2 b). Les domaines α1 et β1 (codé par les exons 2 pour chacune des chaînes) sont liés aux peptides antigéniques.
La région des gènes de classe II ne produit pas seulement les molécules HLA II : l'expression de certains loci (TAP, LMP) génère des produits auxiliaires (le produit de TAP facilite la liaison antigène-molécule HLA classe I, et une activité protéase provient de LMP).
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