3. Les grands groupes éteints de gnathostomes
Seuls deux groupes majeurs de gnathostomes sont considérés comme complètement éteints, les placodermes et les acanthodiens (cf. acanthodiens, placodermes). Les placodermes, qui ont dominé les faunes de vertébrés aquatiques du Silurien supérieur au Dévonien supérieur (420 à 360 Ma), sont presque certainement monophylétiques, car tous partagent quelques caractères exclusifs, comme une armure dermique divisée en une partie thoracique et une partie céphalique. Les placodermes ont été jadis rapprochés des élasmobranches (ou des chondrichthyens en général) en raison de l'anatomie de leur boîte crânienne, qui rappelle celle des requins, mais ils ont aussi été rapprochés des ostéichthyens, avec lesquels ils partagent une disposition assez voisine des os dermiques du crâne et de la ceinture pectorale (armure thoracique). Actuellement, la comparaison de leurs caractères anatomiques avec ceux des autres gnathostomes, notamment la disposition des insertions de leurs muscles oculaires (myodomes), suggère qu'ils sont plutôt le groupe frère de tous les autres gnathostomes.
La monophylie des acanthodiens, qui vécurent de l'Ordovicien supérieur au Permien inférieur (445-290 Ma), n'est guère corroborée. Ce groupe a longtemps été considéré comme le groupe frère des ostéichthyens, mais certains pourraient être en fait des chondrichthyens primitifs, tandis que d'autres seraient effectivement des ostéichthyens souches. Les écailles des acanthodiens, très caractéristiques (cf. acanthodiens), sont connues dès l'Ordovicien supérieur (445 Ma) et constituent les plus anciens restes connus de gnathostomes, mais les plus anciens acanthodiens complets ne datent que du Dévonien inférieur (410 Ma) et n'apportent que peu d'informations anatomiques.
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