2. Diversité et phylogénie des gnathostomes actuels
Les gnathostomes actuels comprennent deux groupes majeurs, les chondrichthyens et les ostéichthyens. Les chondrichthyens (cf. chondrichthyens) sont représentés par les requins, raies et chimères. Les ostéichthyens (cf. ostéichthyens) comprennent les actinoptérygiens (cf. actinoptérygiens) et les sarcoptérygiens (cf. sarcoptérygiens), ces derniers incluant les tétrapodes ou vertébrés terrestres (cf. tétrapodomorphes). Les relations de parenté entre les grands groupes de gnathostomes, qu'elles soient déduites des caractères morpho-anatomiques, physiologiques, ou des séquences moléculaires de gènes nucléaires et mitochondriaux, font l'objet d'un relatif consensus. La figure 2 montre, à gauche, l'arbre phylogénétique des gnathostomes le plus largement admis, prenant en considération les données morpho-anatomiques. Certaines ramifications de l'arbre de droite reflètent les ambiguïtés introduites par les données moléculaires qui parfois entrent en conflit avec les données morpho-anatomiques.
Le monophylétisme de la plupart des grands groupes de gnathostomes actuels (chondrichthyens, ostéichthyens, actinoptérygiens, sarcoptérygiens, tétrapodes) reste néanmoins corroboré par la majorité de ces données. Les seules relations débattues sont internes aux actinoptérygiens et aux sarcoptérygiens, notamment les relations entre ginglymodes (lépisostéiformes), Amia (halécomorphes) et téléostéens (monophylétisme, soit des holostéens, soit des halécostomes ; cf. actinoptérygiens), et les relations entre actinistiens (cœlacanthes), dipneustes et tétrapodes (cf. sarcoptérygiens).
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