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GÉNOMIQUE Génome artificiel

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Le 20 mai 2010, des chercheurs du John Craig Venter Institute aux États-Unis ont publié en ligne, sur le site Internet de la revue américaine « Science », un article intitulé « Création d'une cellule bactérienne contrôlée par un génome synthétisé chimiquement ». Il ne s'agit pas de vie ou de cellule synthétique comme on l'a souvent lu dans les médias, mais de la synthèse d'un chromosome bactérien entier par voie chimique – copie exacte de celui de la bactérie « Mycoplasma mycoides » –, de son introduction dans une bactérie d'espèce différente (« Mycoplasma capricolum ») et de la production, à partir de cette chimère génétique initiale, de bactéries dont les constituants sont tous issus du décodage du seul génome artificiel, celui de la bactérie receveuse ayant été détruit. Si cette expérience, qui a pris quinze ans pour aboutir, n'apporte qu'assez peu de chose en biologie fondamentale, elle constitue, en revanche, une prouesse technologique. Potentiellement riche de développements industriels et environnementaux, elle ouvre les portes vers la construction de nouvelles formes de vie tout en suscitant des problèmes éthiques nouveaux. 

1.  La synthèse chimique de petits fragments d'ADN

Le support matériel de l'hérédité de tous les organismes vivants est un acide nucléique, l'ADN (acide désoxyribonucléique) dans le cas le plus général. Les gènes, alignés le long de la molécule d'ADN des chromosomes, sont des séquences issues de l'assemblage de quatre bases azotées : l'adénine (A), la cytosine (C), la guanine (G) et la thymine (T). L'ordre dans lequel ces bases (on parle plus volontiers de nucléotides) apparaissent le long de la séquence d'un gène dicte les propriétés de la molécule codée par ce gène. En d'autres termes, synthétiser chimiquement un chromosome bactérien revient à relier, dans un ordre très précis, les quelques millions de nucléotides qui le composent. Dans la nature, l'opération s'effectue par copie d'un brin d'ADN matrice. Une synthèse chimique d'un ADN de cet […]

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S'il y a une branche de la science où les chercheurs de notre génération ont dû complètement se recycler, c'est bien celle de la biologie moléculaire. En effet, l'irruption de celle-ci dans les laboratoires de recherche médicale a provoqué une véritable révolution conceptuelle et technique. Ceux qui avaient été formés à la recherche alors qu'elle… Lire la suite
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GÉNOMIQUE - Génomique et cancérologie

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Le décryptage du génome humain, au début du xxie siècle, a facilité l'analyse du fonctionnement cellulaire sous l'influence des gènes. D'où l'entrée en scène d'une génomique fonctionnelle cancérologique qui s'attache notamment à comprendre, afin de les contrôler, les mécanismes de l'oncogenèse qui sont à l'origine de la… Lire la suite
BIOLOGIE - Les pratiques interventionnelles

Écrit par :  François GROS

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BIOLOGIE - La bio-informatique

Écrit par :  Bernard CAUDRON

…  est une application des techniques informatiques au traitement massif de données biologiques. *Elle est spécialement utilisée pour l'analyse des séquences génomiques et des protéines. Le terme de bio-informatique est apparu en 1995 dans des publications scientifiques et des programmes de recherche, avec les premiers pas de la génomique. Cette… Lire la suite
BIOTECHNOLOGIES

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CANCER - Cancer et santé publique

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Dans le chapitre "Perspectives thérapeutiques nouvelles"  : …  Maintenant qu'ont été identifiés les défauts du génome caractérisant les cellules cancéreuses,* il est tentant d'essayer de les corriger et de faire redevenir normales les cellules cancéreuses. Quelques résultats ont été obtenus chez l'homme dans certaines leucémies, utilisant des procédés (des virus) capables d'introduire spécifiquement des… Lire la suite
CHIMIE - La chimie aujourd'hui

Écrit par :  Pierre LASZLO

Dans le chapitre "Évolution moléculaire"  : …  Depuis la fin du xxe siècle, ce champ disciplinaire a entièrement basculé –  *génomique oblige – vers l'analyse comparée des acides nucléiques de divers organismes. Il associe aujourd'hui génomique, outils moléculaires et logiciels informatiques. Pour établir les arbres phylogénétiques (généalogie des espèces), le matériel de… Lire la suite
CYTOGÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE

Écrit par :  Simone GILGENKRANTZ

… 5 × 106 paires de bases) atteignit la limite des méthodes d'exploration conventionnelle. *Durant quelques années, dans l'exploration du génome, le fossé entre l'échelle cytogénétique (5 × 107 paires de bases pour les plus petits chromosomes) et l'exploration moléculaire (2 × 104 pour un gène moyen) sembla donc… Lire la suite
GÉNÉTIQUE

Écrit par :  Axel KAHNPhilippe L'HÉRITIERMarguerite PICARD

Dans le chapitre "Le génome"  : …  *Au sens strict, le génome est l'ensemble des gènes d'un organisme. Par extension, on utilise ce terme pour désigner l'ensemble des molécules portant les gènes, c'est-à-dire l'ADN. On utilise souvent, comme unité de mesure des acides nucléiques, la kilobase (ou kilopaires de bases pour l'ADN double brin). On dira donc que le génome « haploïde » (= … Lire la suite
GÉNOME NÉANDERTALIEN

Écrit par :  Eva-Maria GEIGLThierry GRANGEBruno MAUREILLE

Paléoanthropologues *et biologistes de l'évolution humaine ont assisté en 2010 au déchiffrage d'une partie du génome néandertalien. Cette lignée humaine, qui a peuplé l'Asie de l'Ouest et l'Europe pendant 400 000 ans, a disparu il y a environ 30 000 ans. Elle est… Lire la suite
HÉRÉDITÉ

Écrit par :  Charles BABINETLuisa DANDOLOJean GAYONSimone GILGENKRANTZ

Dans le chapitre "Organisation des génomes"  : …  Les *gènes, quelles que soient leurs variantes alléliques, étant situés en un point précis du chromosome, appelé locus, il a été possible d'établir la carte du génome humain. Elle peut être consultée sur des bases de données informatisées comme genatlas ou the genome database. De plus, comme de nombreux gènes ont été… Lire la suite
PHYLOGÉNOMIQUE

Écrit par :  Gabriel GACHELIN

Dans le chapitre "Bio-informatique et phylogénomique"  : …  Tout *autre est la situation créée par la possibilité de comparer des génomes entiers ou un grand nombre de gènes. Une solide bibliothèque de génomes complets et de gènes isolés s'est constituée à partir d'un grand nombre d'organismes différents et s'enrichit à chaque nouveau séquençage. L'acquisition d'une telle quantité de données est devenue… Lire la suite
PLASTES

Écrit par :  Roger BUVATGérard LEDOIGT

Dans le chapitre "Cartographie de l'ADN plastidial"  : …  *L'utilisation d'endonucléases et la séparation électrophorétique des fragments de restriction ont permis de mettre en évidence des séquences répétées de l'ADN chloroplastique. Ces régions contiennent les opérons ribosomiques. Chez la plupart des plantes supérieures et chez Chlamydomonas, on trouve deux régions répétées, arrangées… Lire la suite
PROGRAMME GÉNÉTIQUE

Écrit par :  Corinne ABBADIE

… mesure où l'état de conservation des restes permet d'extraire au moins une petite partie du génome. *Au sein d'un individu, toutes les cellules possèdent le même génome car elles proviennent de la division d'une seule et même cellule d'origine : l'œuf dont elles ont reçu leur contenu chromosomique. Néanmoins, il existe un grand nombre de types… Lire la suite
PROTÉINES INFORMATIONNELLES

Écrit par :  Patrick FORTERRE

… *Depuis le premier séquençage complet du génome d'un organisme cellulaire (la bactérie Haemophilus influenzae), en 1996, les patrimoines génétiques de plus de cinquante micro-organismes, de trois animaux et d'une plante ont été décryptés. La comparaison de tous ces génomes a confirmé la division du monde vivant en trois domaines (proposée… Lire la suite
RÉTROTRANSCRIPTION DE L'ADN

Écrit par :  Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS

  *À la fin des années 1960, la biologie moléculaire, alors jeune discipline, entre dans ce que l'historien Michel Morange a appelé sa « traversée du désert ». Les connaissances sont alors résumées par le « dogme central » énoncé par Francis H. C. Crick, qui veut que l'information aille uniquement de l'ADN (acide… Lire la suite
SLONIMSKI PIOTR (1922-2009)

Écrit par :  Bernard DUJON

…  équipe, alors installés dans de nouveaux laboratoires du C.N.R.S. à Gif-sur-Yvette, découvrent que *les mitochondries, organites intracellulaires jouant un rôle primordial dans la respiration cellulaire, possèdent leur propre génome. Il se lance alors dans l'élucidation de la nature et du contenu génétique de ce nouveau génome alors inconnu mais… Lire la suite
VARIATION, biologie

Écrit par :  Jean GÉNERMONT

Dans le chapitre "Déterminations précises de séquences"  : …  de nombreuses substitutions, pertes et additions de nucléotides, sans effets phénotypiques connus. *La connaissance des séquences complètes des matériels génétiques de différentes espèces fournit désormais une référence à laquelle peuvent être comparées des séquences partielles obtenues sur un nombre plus ou moins élevé d'individus, d'où la… Lire la suite
VENTER JOHN CRAIG (1946- )

Écrit par :  Gabriel GACHELIN

…  qui s'oppose à cette appropriation des séquences du vivant. Il quitte alors le N.I.H. en 1992 *pour fonder une société privée d'études en génomique, le T.I.G.R. (The Institute for Genomic Research). C'est là qu'est effectué, dès 1995, le premier séquençage complet d'une bactérie, celui d'Haemophilus influenzae. Après avoir quitté le T… Lire la suite
VIROLOGIE

Écrit par :  Sophie ALAINMichel BARMEFrançois DENISLéon HIRTH

Dans le chapitre " Virologie moléculaire : le génome viral"  : …  biologique unique, et leur classification ne doit pas tenir compte de l'hôte qu'ils infectent. *L'organisation générale d'un virus simple comporte essentiellement un génome constitué par un acide nucléique (ADN ou ARN), porteur d'une information génétique spécifique. Ce génome est protégé par un système de sous-unités protéiques dont l'… Lire la suite
WEISSENBACH JEAN (1946- )

Écrit par :  Bernard DUJON

…  il prend la direction du laboratoire du C.N.R.S. des maladies génétiques humaines au Généthon. *En 1997, il devient directeur général du Génoscope-Centre national de séquençage (C.N.S.) qui venait d'être créé pour permettre à la France de participer au séquençage du génome humain et de développer les recherches en génomique. Auteur de plus de… Lire la suite

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