4. La fibrillogenèse
Après sa sortie de la cellule, le tropocollagène va s'associer avec d'autres molécules de tropocollagène. Dans le cas des collagènes interstitiels, cette association se fait par décalage d'un quart de longueur de chaque molécule par rapport à l'autre et par la formation de protofibrilles élémentaires, probablement par l'association de cinq molécules de tropocollagène, comme indiqué sur les figures. À ce moment-là, une enzyme spécifique, la lysiloxydase, va oxyder quelques résidus de lysyle près des terminaisons (télopeptidiques) des molécules, permettant ainsi la formation des liaisons intercaténaires (ou liaisons pontiques) entre les molécules de tropocollagène voisines. Ces liaisons pontiques sont essentiellement de deux types distincts :
– le produit de l'oxydation de la lysine – l'allysine (δ-semi-aldéhyde de l'acide α-amino-adipique) – peut s'unir avec la fonction ε-amine d'une lysine sur la molécule de tropocollagène voisine pour former une base de Schiff :

– ou encore, deux résidus d'allysine sur deux molécules de tropocollagène voisines peuvent s'unir pour former un composé aldol (allysine aldol) :

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