En février 1991, après un référendum triomphal pour le gouvernement, une Charte d'unité nationale est édictée. En novembre, une nouvelle vague de massacres menace les avancées démocratiques mais n'empêche pas un projet de Constitution pluraliste d'être massivement adopté en mars 1992.
Le Hutu Melchior Ndadaye est élu président au suffrage universel en juin 1993 ; son parti, le Front pour la démocratie au Burundi (Frodebu, hutu), remporte 64 des 81 sièges de la nouvelle Assemblée. En signe d'apaisement, Melchior Ndadaye nomme la Tutsi Sylvie Kinigi Premier ministre.
Melchior Ndadaye et six députés sont assassinés en octobre 1993 ; Sylvie Kinigi parvient à garder le pouvoir, mais les violences ethniques se déchaînent, provoquant la fuite de 800 000 personnes dans les pays voisins. L'Assemblée nationale modifie en janvier 1994 la Constitution pour élire à la présidence le Hutu Cyprien Ntaryamira. Dirigé par le Tutsi Anatole Kanyenkiko, le gouvernement s'ouvre largement à la principale force d'opposition, l'Union pour le progrès national (Uprona, tutsi), et à quelques autres formations. Le 6 avril, Cyprien Ntaryamira et Juvénal Habyarimana (président hutu du Rwanda) meurent dans l'attentat perpétré contre leur avion.
Le 10 septembre 1994, la majorité présidentielle hutu et l'opposition tutsi concluent une convention de gouvernement qui prévoit l'attribution à l'opposition de 45 p. 100 des postes ministériels dont celui de Premier ministre. Les 13 et 14, des affrontements opposent, à Bujumbura, l'armée à majorité tutsi à des extrémistes hutu hostiles à l'accord. Le 30, les autorités se trouvant dans l'impossibilité d'organiser un scrutin au suffrage universel, l'Assemblée élit à la tête de l'État son président, Sylvestre Ntibantunganya, hutu, qui assurait l'intérim depuis le mois d'avril. Le 3 octobre, celui-ci reconduit dans ses fonctions le Premier ministre Anatole Kanyenkiko qui forme un gouvernement de coalition. En décembre, une crise politique ébranle le gouvernement à la su […]
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